凝胶成像及quantityone中文操作说明
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伯乐凝胶成像仪
操作指南
1、翻开仪器电源开关〔在该仪器的左后侧〕
2、翻开电脑开关
3、根据所需要分析的凝胶的性质,选择适宜的滤光片:
a.分析中需要用紫外光时〔如核酸类物质的紫外观测分析〕,将
滤光片拨至CCD镜头前。
b.分析中不需要用紫外光时〔如蛋白质类物质的分析〕,将没有滤
光片的一档拨至CCD镜头前,或拨至空挡。
4、根据所需要分析的凝胶的性质,选择适宜的凝胶放置方式:
a、采用紫外光分析模式时,直接将所需观测的凝胶直接放在观测
台上〔小心移至观测台上,注意不要产生气泡,以免影响观测〕。
b、采用透射白光观测模式时,需将白光板放至紫外观测板上,再
将凝胶放在白光板上。
5、双击电脑桌面“Quantity One〞软件的快捷方式翻开软件,弹
出界面〔未注册软件点击“run〞进入界面或点击“basic〞进
入basic模式〕。单击“File〞,在下拉菜单中选择“Gel Doc〞
栏,弹出仪器的图像采集界面。
6、将观测板小心拉出,小心放入凝胶,注意板与胶之间不要产生
气泡;如有气泡产生,那么需赶去气泡,以免影响检测结果。
选择仪器右侧的光源模式,分别为:
trans UV :透射紫外光;epi WHITE:侧面〔反射〕白光
PREP UV:紫外光准备〔低光照紫外〕;trans WHITE:透射白光;
备注:假设用户采用的是白光转换板,需用白光源透射时,仍采用
trans UV栏。
7、按照图像采集界面的步骤〔STEP Ⅰ— STEPⅪ〕,
a、STEP Ⅰ:单击“live/Focus〞模式,调节“IRIS〞、
“ZOOM〞和“FOCUS〞等“↑〞“↓〞调节图像,直
GelDoc 凝胶成像系统 1
EB 、SYBR Green 等染料染的核酸电泳凝胶;Sypro Ruby 、银染、考马斯亮蓝等方法染的蛋白电泳凝胶;以及化学显色的印记膜等。
使用完毕关闭电脑、成相仪电源
关闭GelDoc 正面的power 开关;
如果不再拍照请将机身后侧开关与电源关掉
文字注解和打印格式
图像处理,各种功能分析
对采集的图像保存,并初步优化
打开电脑里程序操作界面;
打开GelDoc 正面的power 开关,进行图像采集
接通电源,电脑、成相仪(共4个插座);
打开电脑、成相仪(背面左下方)电源开关
Tanon凝胶成像系统操作规程
Tanon凝胶成像系统操作规程
设备操作流程:
1、开启总电源。
2、开启电脑至Windows处于正常工作状态。
3、打开主机上层箱内电源开关。
4、双击桌面上的“GIS”图标,进入软件。
5、拍摄:1)打开拍摄界面。
2)把凝胶置于投射上。
3)打开相应灯源的电源开关(如用紫外灯源,请勿肉眼无防护直接观测)。
4)经电脑控制进行拍摄、保存图像。
5)拍摄完毕请立即关闭灯源电源。
6、工作完毕,关闭软件窗口。
7、当天工作完毕后,关闭主机上层箱内电源开关。
8、关闭电脑。
注意事项:
1、凝胶成像系统为EB污染区,电脑为非EB污染区,注意严格区
分EB污染区和非污染区,防止污染区向非污染区扩散。
2、仪器配置的电脑专机专用,不得上网。
3、电脑开启时请勿突然断电,以防硬盘损坏导致实验资料丢失。
4、如用紫外灯源,拍摄完毕请立即关闭灯源电源!
5、拍摄时,请注意不要将过量的缓冲液倾倒在投射底座上。
6、请注意保管好软件加密狗和软件光盘,以免遗失。
GEL EQ凝胶成像使用指南
1. 打开主机电源与计算机电源.
2. 点击凝胶成像软件,进入QUANTITY ONE操作界面.
3. 在FILE菜单中,选择GEL EQ菜单,进入图像采集界面
4. 点击LIVE/FOCUS菜单,采集图像.(根据被扫胶的要求, 在凝胶成像主机面板上选择UV/WHITE紫外光/白光.(如需使用透射白光,则把白光台电源打开,把白光台放在底板上,把胶放在白光台上.
5. 调节光圈大小,点击IRIS下OPEN/CLOSE;调节聚焦,点击FOCUSE下NEAR/FAR按钮;调节远近即大小,点击ZOOM下相应按钮,直到满意为止.
6. 爆光时间一般选择自动AUTO EXPOSE即可.
7. 若图像上有高亮红点,说明爆光过度,则须缩小光圈.
8. 图像调好后,点击SAVE键保存.若需保存为其他格式,则在FILE菜单下选择导出,保存为JPEG/TIFF格式文件.
9. 关于分析处理见Quantity One应用讲义
Quantity One应用讲义
本讲义介绍Quantity One的两个重要分析功能:定量分析和分子量确定。
Quick Quantity One软件Help Guide快捷指南提示如何实现一个功能,如定量分析(Volumes Quick Guide,电泳条带分析(Band Analysis,差显分析(Differential Display Analysis,克隆计数(Colony Counting Analysis等。快捷指南下有1,2,3…步骤,根据提示完成。
一.定量分析功能
凝胶成像系统
操作规程:
1. 打开成像仪器电源,将样品放入工作台。
2. 双击桌面上图标,打开Quantity One 软件,或从开始-程序-The Discovery Series/Quantity One进入。
3. 从File下拉菜单中选择ChemiDox XRS,打开图像采集窗口。
4. Select Application 选择相关应用:
a UV Transillumination 透射UV:针对DNA EB胶或其他荧光;
b White Transillumination 透射白光:针对透光样品如蛋白凝胶,X-光片;
c White Epillumination 侧面白光:针对不透光样品或蛋白凝胶;
d Chemiluminescnec
e 化学发光,不打开任何光源。
5. 单击Live/Focus按钮,激活实时调节功能,此功能有三个上下键按钮:IRIS(光圈),ZOOM (缩放),FOCUS(聚焦),可在软件上直接调节或在仪器面板上手工调节,调节步骤:a调节IRIS 至适合大小;b点ZOOM将胶适当放大;c调节FOCUS至图像最清晰。
6. 如是DNA EB胶或其他荧光,单击Auto Expose,系统将自动选择曝光时间成像,如不满意,单击Manual Expose,并输入曝光时间(秒),图像满意后保存。
如是蛋白凝胶,接第5步骤直接将清晰的图像保存即可;如是化学发光样品,将滤光片位置换到Chemi位(仪器上方右侧),将光圈开到最大,输入Manual Expose时间,可对化学发光的弱信号进行长时间累积如30min,或单击Live Acquire 进行多帧图像实时采集,在对话框内定义曝光时间长短,采集几帧图像,在采集的多帧图像中选取满意的保存。
Bio-Rad Gel Doc XR 凝胶成像系统
Gel Doc XR 是一款快速,简单易用,高分辨率的凝胶成像系统。系统包括了密封暗箱,
摄像头,白光和UV 光源,带琥珀型滤片的滤片环,UV 保护档板。它还包括了从图象采
集到分析打印一体的Quantity One 1-D 分析软件,以及无安装数量限制的QuantityOne Basic
软件。其卓越的性能表现在:
)
高像素分辨率
马达自动控制镜头使在成像过程中无须手工操作3 个数量级的宽线性范围
实时图象采集方便快速对图象进行定位和聚焦
在线积累功能能对图象进行不同程度的曝光,只需在选择“Freeze”即可保存最满意的图象 Quantity One 快捷指南方便地引导你用最少的步骤完成分析全过程
》
火线接口保证快速数据传输
可升级到ChemDoc XRS 化学发光成像系统
操作流程:
1、打开成像仪电源开关
2、打开电脑开关
3、用鼠标双击显示器上的Quantity One 图标,进入控制程序
4、用鼠标点击File,在出现的下拉菜单中选择Gel Doc,点击进入后出现成像控制画面
5、该成像仪有三种成像方式供选择:透射白光(Trans White)、反射白光(Epi White)、和透
射紫外(Trans UV),分别用于聚丙烯酰胺蛋白胶、膜等不透光物品和琼脂糖凝胶的紫外透射成像,在成像前在成像仪的面板上做出选择,按下相应的按钮
6、打开成像仪的门,如用白光,则将白光板取下轻放在紫外灯箱的上面,然后铺上保鲜膜。
{
如用紫外则直接铺上保鲜膜
7、将凝胶放在保鲜膜上,尽量放正,铺展保鲜膜
Quantity one 软件分析使用方法简介
一、条带分子量分析方法
打开软件,在volumes quick guide一栏中选择open,打开你所需要分析的图片。图片格式为tiff。Transform转化,调节图象的对比度黑白到合适程度。确定泳道(lane),并对泳道进行各种调整(实际实验中泳道往往不是垂直的而出现各种变形)。按下图所示在软件的工具栏
中有一Lane Tool图标,包含有更多泳道编辑工具(Frame Lane中输入泳道个数即可做到自动添加泳道,手动调整大小即可)。确定泳道和条带的操作也可以手动进行,即点击Lane 菜单,选择Sigle Lane中的Creat Lane,将鼠标移至打开的图片中,这时鼠标后面会有一个绿色的加号,选择一个marker泳道和需要计算分子量的泳道,每个泳道重上至下的创建。这种方法是单个泳道一个一个的创建,创建时注意在每个泳道条带的正中间开始创建,减少跑电泳时条带的不整齐对结果计算的影响,并且创建的泳道线(红线)一定要垂直。
完成泳道添加步骤后,确定分析条带。该步骤可以自动也可以手动。手动添加步骤为:点击Band菜单,选则Create Band,这时是要创建每个泳道中条带的位置。再将鼠标移动至图片位置,同样鼠标后面呈现绿色加号形式,用鼠标依次点击marker的条带位置。最后点击你所测定的目的条带。泳道中创建Band时也要在条带的中间位置创建,以免跑电泳时加量过多使跑出来的条带过宽,进而影响测定结果。自动添加步骤为:选择Detect Band,检测
泳道内的条带,打开出现如下窗口。通过调节sensitivity灵敏度可调节检测出的条带数,调节Lane Width使代表表带的红色横线与条带宽度差不多宽。中间一行人工编辑按钮可以用来增加/减少条带、调节条带的上、下边界等。打开工具栏中Band Tool条带编辑工具包可看到更多编辑工具。
BIO-RAD凝胶成像仪简明操作程序
BIO-RAD凝胶成像仪简明操作程序
一、打开电源(仪器左侧靠后)。
二、将胶放在台面上,点亮Tran UV键。
三、双击电脑桌面上Quantity One图标,启动成像软件,按Fil e→
Gel Doc的流程进入成像界面
四、成像和保存。
调节以下功能键使图像清晰:
Iris:调节光圈(亮度)
Zoom:放大和缩小图像
Focus:聚焦使图像清晰
Auto expose/Manual expose:自动/手动曝光
分析软件还可以进行分子量计算,相对定量等工作,具体操作详见说明书
成像完毕后,Save 保存文件在“常规用户”各自的文件夹下,如需要拷贝文件,则选择Fil e→Export将文件转换后再拷贝,否则文件拷贝后将无法打开
五、关闭电源、清洁台面
注意:
●每次使用要登记,使用完毕后应关闭电源并清洁台面。
●严禁将图像存在桌面上,一经发现,立即删除
●严禁在本仪器计算机上做与成像和分析无关的事情
●未经允许,不得带本实验室以外的人员使用本仪器。
quantityone中⽂使⽤说明
凝胶电泳是每个做分⼦⽣物学的同学天天都要打交道的基本技术。电泳之后的信息处理与电泳本⾝同样重要。⽬前有⼤量软件可以⽤于分析电泳结果,⽐较有名的⽐如BandScan、BandLeader、Sigma Gel 等等。今天要向⼤家介绍的是来⾃Bio-Rad的1D凝胶定量软件Quantity One(Bio-Rad还有⼀个做2D 凝胶分析的软件PDQuest)。这个软件的最新版本可以在Bio-Rad的主页免费下载。⽬前的最新版本是4. 52版。
虽然软件并⾮免费,但是值得⾼兴的是该软件提供了30天的全功能试⽤期,⽽且30天以后仍然可以以Basic Mode继续使⽤,关键功能如Lane、Band、Volume Contour功能⼀个不缺,只是⽆法保存和打印结果(其实这没有很⼤关系,⼤家可以⽤HyperSnap等截屏保存分析结果)。
Quantity One的分析功能顾名思义主要⽤来进⾏凝胶或者培养⽫的荧光定量分析。它的分析功能或者说分析⽅式主要有4种:泳道/条带轨迹定量法;等⾼线直接定量法;菌落计数;分⼦量测定
这三种⽅法中使⽤最为⽅便也是最为⼴泛的应该是等⾼线定量法(Volumn Contour)。它通过半⾃动描绘电泳条带的等⾼线边缘来得到等⾼线区域内部⾯积,再将该⾯积乘以区域内平均光密度值得到条带内部总的信号量。当然这种分析⽅法的弊病显⽽易见:⽆法同等得排除不同泳道的背景亮度;等⾼线的绘制处于“半⾃动”状态,即需要⼈为判断作为等⾼线标准的电泳条带的边缘;最致命的是在⼏个电泳条带距离⼗分接近的时候⼏乎⽆法绘制单⼀条带的轮廓(常出现连续的⼏个条带等⾼线相连⽽⽆法分离出单独条带的轮廓)。
凝胶成像仪操作规程
《凝胶成像仪操作规程》
一、凝胶成像仪是一种专门用于电泳凝胶成像的仪器,操作规程如下:
1. 准备样品:将凝胶样品放置在凝胶成像仪的托盘上,并确保凝胶样品完全覆盖。
2. 开启仪器:打开电源开关,调节成像仪的参数,如曝光时间、波长等。
3. 拍摄图像:在参数设置完成后,通过操作仪器上的按钮或者程序,开始拍摄凝胶的图像。
4. 处理图像:将拍摄的图像传输到电脑或其他设备上进行进一步处理和分析。
5. 清洁仪器:拍摄完成后,关闭仪器,清洁托盘和镜头等部件,以确保下次使用时仪器的整洁。
二、凝胶成像仪在操作时需要注意以下几点:
1. 操作人员应该熟悉仪器的使用手册,并按照操作规程进行操作,以免造成不必要的损坏。
2. 在操作时应注意安全,避免发生触电或者碰撞等意外事故。
3. 注意仪器的保养,定期清洁和维护,延长仪器的使用寿命。
4. 在操作过程中,要保持仪器和样品的清洁,避免灰尘和其他杂质进入仪器影响成像效果。
5. 操作人员应保持注意力集中,避免操作失误,影响成像的质量。
通过遵循以上操作规程,能够保证凝胶成像仪的正常使用,提高凝胶成像的效率和质量。
功能强大的操作、分析软件“Quantity One”
简介
“Quantity One”是Bio-Rad公司图像系列产品的操作和分析软件。主要用来定量和分析荧光、化学发光、放射性同位素、化学染色物标记的各种单向电泳、杂交点和条带、TCL 板、酶标板、培养皿的克隆斑等。
“Quantity One”能在Windows 98、Windows 95、Windows NT 4.0、Macintosh 9500(或更高)环境下运行。窗口设计有下拉式菜单、图像工具栏、菜单操作提示栏等,界面设计十分友好、非常简单易学。
“Quantity One”的图像文件以Tiff文本格式输出,可以方便的进入其它的图像处理软件进行更深一步的图像处理和编辑。同时,分析数据可以直接转入到Micro Excel,
以报告形式排版、打印。
每套“Quantity One”软件都有相对应的进入密码(Unique Password)和软件狗(Hardware Protection keys),并附有详尽的软件操作说明书。
1.“Quantity One”的运行程序
打开操作界面
输入操作指令,进行图像采集
图像初步优化
图像处理
各种功能分析
文字注解和打印格式
2.“Quantity One”的主要功能和优势
2.1“Quantity One”的图像采集功能
步骤一:自动选择仪器的配置
根据您的标记信号类型,“Quantity One”能自动选择激光波长和滤波片,使整个光路调整到适当的工作状态。
步骤二:选择扫描范围
GelDoc2000提供的最大扫描面积为25cm×26cm,您可以根据样品放置的位置和大小,任意选择所需的扫描范围。
凝胶成像系统使用方法
1. 首先,将样品放置在凝胶上,并将其放入凝胶槽中。
2. 将凝胶槽放入成像系统中,并确保凝胶表面与成像台底部接触良好。
3. 打开成像软件,并选择适当的成像参数。这些参数包括激发波长、滤光片、曝光时间等。
4. 调整成像系统的聚焦位置,以确保获得清晰的图像。
5. 开始成像,观察凝胶中的凝胶带或其他目标物的荧光信号。
6. 可根据需要对图像进行处理和分析,例如调整对比度、亮度和图像大小等。
7. 在完成成像后,关闭成像系统并小心取出凝胶槽。
8. 清洗凝胶槽和系统的内部部件,以确保下一次使用时的卫生和正常工作。
凝胶成像仪使用方法
凝胶成像仪是一种用于观察和记录凝胶电泳结果的仪器。它广泛应用于生物医学研究、分子生物学和生物化学实验中。以下是关于凝胶成像仪的使用方法的详细说明。
一、仪器准备
1. 检查凝胶成像仪是否处于正常工作状态,确保所有部件都已连接好。
2. 打开仪器电源并等待凝胶成像仪的启动过程完成。
3. 确保摄像机和转换器已经联接,而且转换器和电脑也已经连接好。
二、凝胶成像条件设置
1. 打开图像采集软件,并确保与凝胶成像仪的连接已经建立。
2. 调整摄像机的位置,使其能够对凝胶进行成像。确保摄像机离凝胶的距离适中,以获得清晰的成像结果。
3. 在软件中选择合适的成像模式,比如亮场或荧光模式。
4. 根据实验需要,设置合适的曝光时间和灵敏度。较长的曝光时间可以获得更多的细节,但过长的曝光时间可能会导致成像结果过暗或过亮。
5. 调整对比度和亮度,以获得清晰的成像结果。根据实验需要,可以增加或降低对比度和亮度,以突出或减弱凝胶上的信号。
三、成像操作
1. 将凝胶放置在成像台上,并确保凝胶与摄像机的视野完全重叠。可以使用凝
胶对准标记来确保凝胶的位置准确。
2. 调整摄像机的焦距和焦点,以获得清晰的成像结果。
3. 点击软件上的“开始成像”按钮,开始进行成像。可以选择连续拍摄或单次拍摄,具体视实验需求而定。
4. 在成像过程中,确保凝胶没有发生移动或晃动,以避免成像结果模糊或失真。
5. 成像完成后,保存图像文件,并进行必要的后期处理,如调整亮度、对比度和锐度等。
四、清洁和维护
1. 成像结束后,断开凝胶成像仪与电脑的连接,并关闭凝胶成像仪的电源。
优选文档
Image Quant LAS 4000mini 凝胶成像系统快速操作指南
一、开机
1. 启动LAS 4000机箱电源、个人计算机和操纵软件ImageQuant LAS 4000;
2. 等待数分钟:当成像芯片CCD到达预设低温后,机箱上状态灯即显示蓝色,同时操作软件上CCD温度栏显示READY,设备即可随时使用。
二、化学发光成像
1. 将转印膜置于EPI 样品盘内,放入机箱,关闭机箱门。
2. 点击操纵软件Method/Tray position 按钮。
(1) 在Method纵向栏中选择化学发光Chemiluminescence。
(2) 依据转印膜尺寸选择适宜的样品盘位置Tray position 。
(3) 点击OK。
3. 点击聚焦Focusing按钮。确认转印膜被正确放置,并进行精细聚焦。完毕后点击返回Return 按钮。
4. 在主界面Exposure Type菜单中选择单张曝光Precision。
5. 在曝光时间Exposure Time菜单中选择自动曝光Auto或者手工设定Manual。
6. 在Sensitivity/Resolution菜单中选择标准灵敏度/分辩率Standard。
7. 点击开始Start 按钮,开始图像采集。
8. 图像采集结束后,调整图像比照度gradation。保存或者打印图像。
三、关机
正常关机:退出软件时,选择Stop the CCD cooling now,关闭机箱电源。
系统待机:退出软件时,选择Keep the CCD cooling after quit,同时保持机箱电源开启
GEL EQ凝胶成像使用指南
1.打开主机电源与计算机电源.
2.点击凝胶成像软件,进入QUANTITY ONE操作界面.
3.在FILE菜单中,选择GEL EQ菜单,进入图像采集界面
4.点击LIVE/FOCUS菜单,采集图像.(根据被扫胶的要求, 在凝
胶成像主机面板上选择UV/WHITE紫外光/白光).(如需使用透射白光,则把白光台电源打开,把白光台放在底板上,把胶放在白光台上.)
5.调节光圈大小,点击IRIS下OPEN/CLOSE;调节聚焦,点击
FOCUSE下NEAR/FAR按钮;调节远近即大小,点击ZOOM 下相应按钮,直到满意为止.
6.爆光时间一般选择自动AUTO EXPOSE即可.
7.若图像上有高亮红点,说明爆光过度,则须缩小光圈.
8.图像调好后,点击SA VE键保存.若需保存为其他格式,则在
FILE菜单下选择导出,保存为JPEG/TIFF格式文件.
9.关于分析处理见Quantity One应用讲义
Quantity One应用讲义
本讲义介绍Quantity One的两个重要分析功能:定量分析和分子量确定。
Quantity One软件Help Quick Guide快捷指南提示如何实现一个功能,如定量分析(V olumes Quick Guide),电泳条带分析(Band Analysis),差显分析(Differential Display Analysis),克隆计数(Colony Counting Analysis)等。快捷指南下有1,2,3…步骤,根据提示完成。
一.定量分析功能
Quantityone的使用方法
执行步骤:
由于Quantiy One只能识别黑白的TIF文件,而实际上发表论文时,很多杂志也要求提供TIF等格式的图片而非JEPG格式的;因此,考虑到这两层因素,我建议大家从一开始扫描就统一存贮为TIF格式的图片。
1.创建泳道:
a.打开我们要分析的电泳图片(以蛋白质电泳为例)。
b.选择“Lane-Auto Frame lanes”。这时如果您的电泳图片比较标准的话,Quantity One就会自动识别出每条电泳泳道的位置,而且将各个泳道的路径用一条红线标画出来;
如果您对软件自动标记的泳道不甚满意,您可以通过“Lane-Edit Frame”下级各个子菜单提供的功能对泳道框架位置、大小等进行调节;调节方法就是通过鼠标的拖放来实现。
如果您只需要分析其中几个泳道的数据而不想其他泳道的标记干扰您的视线,您可以通过“Lane-Single Lane-Remove Lane”删除您不需要的泳道的标记。注意:
不是所有的电泳图片的泳道都能够被Quantity One自动识别。在不能自动识别的情况下,Quantity One就会弹出对话框告诉您它不能识别泳道。这时大家就需要手工绘制电泳泳道。方法和上面一样,同过“Lane-Single Lane-Creat Lane”来实现。只要用鼠标在您的电泳图片上顺着待标记的泳道的中轴线拖放就可以绘制出该泳道的标记红线。
2.不同泳道的背景排除:
我们要将我们的电泳图片进行前面谈到的泳道识别,不管是自动方式还是手工识别。然后选择“Lane-Lane Backgroud...”命令。选择该命令后,鼠标即变成一个绿色的“+”,将鼠标移到您打算进行背景排除的泳道,点击左键一下,立刻就会弹出如下图所示的对话框。