Cluster Analysis on Japonica Rice (Oryza sativa L.) with Good Eating Quality Based on SSR Mark
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水稻转录组学研究水稻(Oryza sativa)是全球重要的粮食作物之一,具有较高的经济和社会价值。
随着基因组学和转录组学的不断发展,水稻转录组学的研究逐渐成为当今重要的研究领域之一。
本文将深入探讨水稻转录组学研究的相关内容,包括其基本原理、研究方法和应用等方面。
一、水稻转录组学基本原理转录组学是利用高通量测序技术对某个生物体中的全部mRNA进行测序、定量和分析的学科。
水稻转录组学研究就是利用这种技术手段对水稻基因表达进行全面研究,探究不同生长阶段和环境下水稻基因表达差异,揭示其分子机制。
水稻转录组学研究的基本原理是通过大规模测序技术,获取水稻生长、发育和胁迫等不同条件下的转录组数据,从而实现对水稻基因表达谱的全面分析和比较。
二、水稻转录组学研究方法目前,水稻转录组学研究主要依靠RNA测序技术,其中包括Sanger测序、芯片技术和高通量测序技术(HTS)。
Sanger测序是先进的研究方法之一,该技术利用其独有的链终止法,对RNA分子进行测序,产生高品质的序列结果。
该技术结果可被组装成完整的转录本,用于分析基因的表达水平和表达的剪接异构体。
不过,Sanger测序的高成本和低通量限制了技术的应用范围,限制了对转录组全面分析的进展。
芯片技术是一种快速、简单、高通量的RNA检测方法,它依赖于在芯片表面上捕获的寡核苷酸探针。
芯片技术的优点在于特异性、高通量和高精度,但由于其是基于探针的互补杂交技术实现的,其检测能力会受到探针长度、浓度和生物样本性质的限制。
由于该技术的局限性,现在已经转向HTS技术。
HTS技术目前是进行水稻转录组学研究的主要方法之一。
它基于高通量的平台,利用二代或三代测序技术鉴定mRNA、RNA剪接异构体和ncRNA的序列,并通过计算生物学的方法定量研究样品中的基因表达差异。
与Sanger测序和芯片技术相比,HTS技术具有高效率、高通量和高精度的优点,能够快速获得更多的转录本数据,并且能提供深入的转录本鉴定和表达数据分析。
2018年31卷5期 Vol. 31 No. 5西"表$% &Southwest China Journal of Agricultural Sciences877文章编号:1001 -4829(2018)5 -0877 -07D O I:10. 16213/ki.scjas.2018. 5. 001江苏省主要粳稻品种稻米品质研究陈培峰1,顾俊荣1,乔中英1,赵步洪2,季红娟2,董明辉“(1江苏太湖地区农业科学研究所,江苏苏州215155 ;2.江苏里下河地区农业科学研究所,江苏扬州225008"摘要:【目的】本文对江苏省主要粳稻品种稻米品质性状进行综合分析评价,为水稻优质育种和栽培提供参考。
【方法】以18份江苏省主要推广应用的粳稻品种为试材,分析江苏省主要粳稻品种品质性状差异及其相关关系。
【结果】碾米品质、营养品质和蒸煮品质在品种间的差异较小,但外观品质和7V A谱特征值的差异较大;中熟中粳稻、迟熟中粳稻、早熟晚粳稻的碾米品质、外观品质较好,而中熟晚粳稻直链淀粉含量和消减值较低,肢稠度较高,食味品质较好。
相关分析表明,直链淀粉含量与多个品质性状密切相关,直链淀粉含量越高的品种,蛋白质含量最低,肢稠度越小,消减值越大,外观品质和碾米品质与其他的品质性状间无显著相关性。
对各品种水稻的品质性状进行主成分分析,得到了 3个代表食味品质、碾米和外观品质的主成分,其累计贡献率达到82.91 聚类分析结果表明,可将稻米品种分为4类,其中第I类和第IV类品种外观品质较好,第I I类品种育成时间较早,碾米品质和外观品质较差,第III类品种直链淀粉含量较低,肢稠度较高。
【结论】江苏主要粳稻品种的碾米品质和外观品质较好,但蒸煮食味品质一般,优质食味品种较少,在今后的优质稻选育过程中应注重对食味的改良。
关键词:粳稻;品质性状;相关分析;聚类分析中图分类号:S511.2 + 2 文献标识码:AStudy on Rice Quality of Main Japonica Rice Varieties in Jiangsu ProvinceCHEN Pei-feng1,GU Jun-rong1,QIAO Zhong-ying1,ZHAO Bu-hong2,JI Hong-juan2,DONG Ming-liui1 !(1 • Taihu Reg Agric Res Inst of Jiangsu,Jiangsu Suzhou 215155,China; 2. Lixiahe Reg Agric Res Inst o225007, China)Abstract:*Objective】The quality traits o f main japonica rice varieties in Jiangsu province were analyzed and evaluated comprehensively toprovide a reference for high quality rice breeding and cultivation. * Method】The difference of ri lyzed witli 18 m ain varieties of Japonica rice varieties in Jiangsu province as tested materials. * Result】 The diferences of milling,cookingand nutritional quality a mong these varieties were not obvious,but tlie appearance quality and RVA spectriam characteristic valiae were obvious. The middle-maturing m edium,late-maturing medium and early-maturing late Japonica rice varieties had advantages of better millingquality and appearance quality,but the middle-maturing late Japonica rice varieties had the advantages of lo value,higher gel consistency and better eating quality. The correlation analysis showed that amylose content was closely related to multiplequality traits,but the appearance quality and milling quality was not obviously related to other quality traits. The data of rice quality characters were processed by the princijDal component analysis. Based on it,3 princijDal component were founded to pearance quality resjDectively,which t he cumulative contrilDution of thiese 3 components was 82. 91 M. 18 rice cultivars were divided into 4groups according to the cluster analysis,fromwhich group I and IVhad better appearance quality,group II had worse milling and appearancequality and group III had lower amylose content and higher gel consistency. * Conclusion】 So the main Japonica rice varieties of Jiangsu hadbetter milling and appearance quality,worse cooking and eating quality. The high quality rice b the improvement of the taste.Key words: Japonica rice varieties; Quality traits; Correlation analysis; Cluster analysis收稿日期=2017 -05 -10基金项目:江苏省第五期$333工程”科研资助项目(BRA20160 72";苏州市农业科技创新工程项目(SNG201505、SNG2017079) 作者简介:陈培峰(1980 -",男,江苏无锡人,硕士学位,副研究 员,主要从事水稻遗传育种与高效栽培技术研究,Tel:(0512) 65388221,E-mail:chenp£2005@ 126. c m; !为通讯作者:董明辉,E-mail: mhdong@。
Hereditas (Beijing) 2021年3月, 43(3): 199―202收稿日期: 2021-02-04; 修回日期: 2021-02-02作者简介: 许操,研究员,研究方向:小肽信号与植物发育、作物重新驯化、蛋白质相分离。
E-mail:*****************.cn DOI: 10.16288/j.yczz.21-056网络出版时间:2021/2/5 15:28:37URI: https:///kcms/detail/11.1913.R.20210205.1057.003.html 热点追踪从0到1:异源四倍体野生稻从头驯化创造全新作物许操中国科学院遗传与发育生物学研究所,植物基因组学国家重点实验室,种子创新研究院,北京 1001012021年2月3日,Cell杂志在线发表了李家洋院士团队关于四倍体野生稻从头驯化的重大突破性进展。
该团队绘制了四倍体野生稻从头驯化路线图,与合作者经过多年攻关,突破了一系列限制多倍体野生稻驯化的理论难题和技术瓶颈,综合运用多维组学和基因编辑技术实现了野生四倍体水稻的从头驯化,创造了世界首例重新设计与快速驯化的四倍体水稻,将过去的“不可能”变成了现在的“一切皆有可能”。
该研究突破了现有二倍体水稻作物的育种局限,实践了从0到1的突破性创新,为遗传背景复杂的野生植物重新驯化提供了范例和解决方案,将引领未来作物创造,翻开生物育种新篇章。
驯化是一个复杂的进化历程,是一种生物的繁衍逐渐受到另一种生物的影响与控制的过程[1]。
农作物的栽培与人工驯化是农业文明起源的重要标志。
将野生植物驯化成农作物是人类驯化活动的主要目标之一。
在漫长的驯化选择历程中,植物逐渐失去其野生祖先种的遗传和生理特征,形成符合人类阶段性需求的栽培品种[2]。
驯化和改良引发的农作物品种更新换代往往与人类文明的发展历程同步。
20世纪40年代起,随着农业机械化和化学合成技术等工业文明成果的日臻成熟和推广应用,作物品种也随着第一次绿色革命的兴起而实现更新换代,这使得以大规模、单一品种的机械化种植,化肥及杀虫剂、除草剂等在农业生产中大量施用为特征的农业模式替代了传统的多样化品种的小规模农耕模式。
原料米和酒曲对米酒滋味品质影响的评价王菲;钟小丹;戴彩霞;胡雅璇;张振东;于博;郭壮【摘要】分别采集了糯米、籼米和粳米样品各5个,在同一发酵条件下分别与5个酒曲进行了组合发酵,并采用电子舌技术和多变量统计学方法相结合的手段,对制备的75个米酒样品的滋味品质进行了评价分析.通过主成分分析、典范对应分析、置换多元方差分析、多元方差分析和聚类分析发现原料对米酒滋味品质的影响大于酒曲,以糯米和籼米为原料酿造的米酒其滋味品质较为相似,而两者与以粳米为原料酿造的米酒滋味品质存在显著差异(P<0.05).通过线性判别分析发现该差异是由于涩味、苦味和丰度(鲜的回味)3个指标造成的,且以糯米为原料酿造的米酒滋味品质最佳.%Each of the five long-grain rice, japonica rice, and milled rice were collected, and the taste profile characterizations of 75 rice wine samples which fermented by the five rice wine koji under the same condition were studied by electronic tongue and multivariate statistics. Principal component analysis, canonical corre-spondence analysis, permutational multivariate analysis of variance, multivariate analysis of variance, and cluster analysis showed that the effect of raw materials on the taste profile of rice wine was greater than rice wine koji. Meanwhile, the taste profile of rice wine fermented by long-grain rice and japonica rice were similar, and these two samples indicated significant differences with the rice wine fermented by milled rice. It was worth men-tioning that astringent, bitterness, and richness were identified by linear discriminant analysis as key variables significantly associated with the taste profile difference. Thus,it can conclude that the rice wine fermented by long-grain rice with best taste quality.【期刊名称】《食品研究与开发》【年(卷),期】2017(038)020【总页数】5页(P80-84)【关键词】米酒;原料;酒曲;电子舌;多变量统计学【作者】王菲;钟小丹;戴彩霞;胡雅璇;张振东;于博;郭壮【作者单位】湖北文理学院化学工程与食品科学学院鄂西北传统发酵食品研究所,湖北襄阳441053;湖北米婆婆生物科技股份有限公司,湖北孝感432003;湖北文理学院化学工程与食品科学学院鄂西北传统发酵食品研究所,湖北襄阳441053;湖北文理学院化学工程与食品科学学院鄂西北传统发酵食品研究所,湖北襄阳441053;湖北文理学院化学工程与食品科学学院鄂西北传统发酵食品研究所,湖北襄阳441053;湖北文理学院化学工程与食品科学学院鄂西北传统发酵食品研究所,湖北襄阳441053;湖北文理学院化学工程与食品科学学院鄂西北传统发酵食品研究所,湖北襄阳441053【正文语种】中文Abstract:Each of the five long-grain rice,japonica rice,and milled rice were collected,and the taste profile characterizations of 75 rice wine samples which fermented by the five rice wine koji under the same condition were studied by electronic tongue and multivariatestatistics.Principal component analysis,canonical correspondence analysis,permutational multivariate analysis of variance,multivariate analysis of variance,and cluster analysis showed that the effect of raw materials on the taste profile of rice wine was greater than rice wine koji.Meanwhile,the taste profile of rice wine fermented by long-grain rice and japonica rice were similar,and these two samples indicated significant differences with the rice wine fermented by milled rice.It was worth mentioning that astringent,bitterness,and richness were identified by linear discriminant analysis as key variables significantly associated with the taste profile difference.Thus,it can conclude that the rice wine fermented by long-grain rice with best taste quality.Key words:rice wine;raw materials;rice wine koji;electronic tongue;multivariate statistics米酒酿造通常以糯米或籼米为主要原料,但由于粳米价格相对低廉,因而近年来部分厂家亦尝试使用粳米[1]。
V ol.29,N o.4pp.574~580 July ,2003作 物 学 报ACT A AG RONOMICA SI NICA第29卷第4期2003年7月 574~580页水稻籼粳杂种不育性及其类型严长杰 梁国华 顾世梁 陆驹飞 汤述翥 顾铭洪Ξ(扬州大学农学院农学系,江苏扬州225009)摘 要 克服栽培稻不同亚种间杂种F 1的不育性是有效利用亚种间杂种优势的前提。
本研究选择了籼粳两亚种不同生态型的19个水稻品种作为试验材料,研究了它们之间杂种不育性的表现特点及遗传特性。
试验按p ×q 设计进行,以籼稻作为母本,共配置了90个籼粳交组合。
调查了各组合F 1的小穗育性和花粉育性。
研究结果表明:(1)各组合的小穗育性和花粉育性都存在显著的差异。
(2)花粉育性和胚囊育性分别由不同的遗传系统所控制,两者共同决定小穗育性的高低。
(3)起源于我国华南的籼稻品种比具有国际稻血缘的籼稻品种与粳稻的分化更远。
(4)根据花粉育性和小穗育性为指标的聚类分析结果可知:本研究中90个籼粳交F 1可分为4个类型,即花粉育性和小穗育性都高;小穗育性高,但花粉育性低;小穗育性低,但花粉育性高;小穗育性和花粉育性都低。
关键词 水稻;籼粳交杂种;小穗育性;花粉育性中图分类号:S511 文献标识码:ACharacteristic and Classification for Sterility of H ybrids from Typical IndicaCrossed with J aponica V arieties(O.sativa )Y AN Chang 2Jie LIANG G uo 2Hua G U Shi 2Liang LU Ju 2Fei T ANG Shu 2Zhu G U M ing 2H ong(Department o f Agronomy ,Agricultural College ,Yangzhou Univer sity ,Yangzhou ,Jiangsu 225009,China )Abstract There has been much interesting in studying the sterility of hybrid between tw o rice subspecies indica andjaponica ,and it is a prerequisite for the utilization of heterosis in high yield rice breeding.In this study ,19varieties ,10in 2dica and 9japonica ones ,were selected as parents ,which represents different rice ecosystems.According to the p ×q de 2sign ,90cross combinations were obtained by crossing 10indica varieties (as female parents )to the 9japonica varieties (as male parents ).The F 1spikelet and pollen fertilities of all crosses were analyzed in detail.The main results are listed as fol 2lows :(1)Am ong the 90crosses ,the spikelet and pollen fertility varied widely ,ranging from fully fertile to nearly sterile.(2)The pollen and embry o sac fertility were controlled by tw o sets of different genes ,and both of them made contributions to F 1spikelet fertility.(3)The indica varieties originated in S outh China had higher 2level genetic differentiation from japonica varieties than those containing IRRI rice genetic system.(4)C luster analysis indicated that 90indica/japonica crosses could be divided into four types ,i.e.both spikelet fertility and pollen fertility were normal ,both of tw o were low (sterile ),spikelet fertility was relatively normal ,while pollen fertility was low ,and the last type was that spikelet fertility was relatively low ,while pollen fertility was relatively high.K ey w ords Rice ;Indica/japonica hybrid ;S pikelet fertility ;P ollen fertility 了解水稻品种间的亲和性分化,对于认识栽培稻的起源、分化有重要意义。
粮食最低收购价与市场价关系的实证分析 以稻谷为例肖翔霞,张佳㊀(长江大学经济与管理学院,湖北荆州434023)摘要㊀粮食最低收购价格与市场价格是影响我国粮食安全和农民收入的两个重要因素,为进一步探究两者的关系,以稻谷为例,通过实证研究发现,最低收购价与市场价存在显著的因果关系㊂结果表明:从长期看,粮食最低收购价格与市场价格具有长期均衡关系,稳定调减最低收购价格对于推进粮食市场价格形成机制改革具有重要意义㊂从短期看,市场价格对于最低收购价格的影响要大于最低收购价对市场价格的影响,且最低收购价格对市场价的影响存在品种上的差异,粳稻最低收购价格对市场价的影响明显大于早籼稻和中籼稻最低收购价格对市场价的影响㊂基于上述结论,提出了相应的政策建议㊂关键词㊀最低收购价;粮食市场价;实证研究中图分类号㊀S-9㊀㊀文献标识码㊀A㊀㊀文章编号㊀0517-6611(2023)06-0223-05doi:10.3969/j.issn.0517-6611.2023.06.051㊀㊀㊀㊀㊀开放科学(资源服务)标识码(OSID):EmpiricalAnalysisoftheRelationshipbetweenMinimumPurchasePriceandMarketPriceofGrain TakingRiceasanExampleXIAOXiang⁃xia,ZHANGJia㊀(EconomicsandManagementSchoolofYangtzeUniversity,Jingzhou,Hubei434023)Abstract㊀Grainminimumpurchasepriceandmarketpricearetwoimportantfactorsaffectingfoodsecurityandfarmers incomeinChina.Tofurtherexploretherelationshipbetweenthem,thispapertakesriceasanexampleandfindsthroughempiricalresearchthatthereisasignificantcausalrelationshipbetweenminimumpurchasepriceandmarketprice.Theresultsshowedthat:Inthelongrun,theminimumpurchasepriceofgrainhasalong⁃termequilibriumrelationshipwiththemarketprice,andthestablereductionoftheminimumpurchasepriceisimportanttopromotethereformofthegrainmarketpriceformationmechanism.Intheshortrun,theimpactofmarketpriceonminimumpurchasepriceisgreaterthantheimpactofminimumpurchasepriceonmarketprice,andtherearespeciesdifferencesintheimpactofminimumpurchasepriceonmarketprice,withtheimpactofminimumpurchasepriceonmarketpriceofjaponicaricesignificantlygreaterthantheimpactofminimumpurchasepriceonmarketpriceofearlyindicariceandmediumindicarice.Basedontheabovefindings,correspondingpolicyrecommendationsareproposed.Keywords㊀Minimumpurchaseprice;Grainmarketprice;Empiricalstudy基金项目㊀湖北省教育厅科学技术研究项目(Q20191311)㊂作者简介㊀肖翔霞(1999 ),女,湖北宜昌人,硕士研究生,研究方向:农业经济政策㊂收稿日期㊀2022-05-09;修回日期㊀2022-06-20㊀㊀2020年12月28日习近平总书记在中央农村工作会议明确指出 要调动农民种粮积极性,稳定和加强种粮农民补贴,提升收储调控能力,坚持完善最低收购价政策 ㊂我国从2004年在粮食主产区实施最低收购价政策,自此粮食市场价与最低收购价紧密相连㊂2008 2014年,稻谷最低收购价格依据 成本加合理利润 的定价原则连续7次上调,与此同时,粮食市场价格亦一路攀升,触及价格 天花板 ㊂从2016年早籼稻最低收购价开始调减,到2017年稻谷最低收购价全面下调,市场价格也呈现出明显下降趋势㊂因此,不少学者认为,最低收购价政策托底市场价格一路走高[1],扭曲了市场价格形成机制[2-5],甚至对非执行区的市场价格也存在传递辐射效应[6]㊂但也有学者认为,粮食最低收购价政策作为一种政策手段,保持市场价格稳定,并不能从根本上影响市场价格,是市场经济与我国实际相结合的产物[7]㊂目前,关于粮食最低收购价格的研究主要集中于其政策效果的评价,就其与市场价格的关系研究相对不足㊂鉴于此,笔者主要探讨粮食最低收购价与市场价格的关系,以及在深化农业供给侧改革及农业高质量发展的背景下如何协调二者的关系,对完善粮食最低收购价政策以及促进农民增收㊁农业供给侧改革㊁农业高质量发展等具有重要的理论和现实意义㊂1㊀稻谷最低收购价与市场价关系的简要立论1.1㊀稻谷最低收购价与市场价的基本历史轨迹㊀稻谷最低收购价于2004年实施,2004 2007年保持稳定,早籼稻为1.40元/kg㊁中籼稻为1.44元/kg㊁粳稻为1.50元/kg,均低于当年市场价㊂由于最低收购价过低,2007年稻谷收储量难以支撑政府对稻米市场进行有效的宏观调控[8],因此,从2008年开始,稻谷最低收购价逐年上调,并于2013年开始超过市场价格的年度均值,早籼稻㊁中籼稻㊁粳稻的最低收购价分别比市场价高0.0368㊁0.0728㊁0.0634元/kg,至2014年,最低收购价达到最高值,2015年保持不变,2016年首次下调早籼稻最低收购价格,2017年开始全面下调稻谷最低收购价㊂与此同时,稻谷市场价格也在节节攀升㊂2004 2007年,在最低收购价格不变的背景下,早籼稻㊁中籼稻和粳稻市场价格平均每年以1.58%㊁2.37%㊁0.47%的幅度小幅上涨,但在2008年,当最低收购价格突然大幅上调之后,其市场价格迅速上升,早籼稻㊁中籼稻和粳稻当年的增幅分别达到19.41%㊁12.05%㊁7.08%㊂之后受市场规律的影响,市场价格在2009年增速明显放缓㊂2010 2011年,在粮食最低收购价连续提高之际,其市场价格呈现出更为强劲的上升趋势,早籼稻㊁中籼稻和粳稻的涨幅分别为21.04%㊁18.95%㊁4.62%㊂2012年之后,随着最低收购价格增速放缓,2017 2020年粮食市场价格的增速也明显回落㊂1.2㊀稻谷最低收购价与市场价的基本关系走势㊀为了更清晰和直观地了解稻谷最低收购价与市场价关系的走势,利用2004 2020年的有关数据,绘制二者的折线图(图1)㊂基于研究目的与数据的可获得性,该研究选取了2004 2019年早籼稻㊁中籼稻和粳稻的最低收购价与市场价的年度均值,数据来源于相关年份‘全国农产品成本资料收益汇编“和安徽农业科学,J.AnhuiAgric.Sci.2023,51(6):223-227㊀㊀㊀‘中国粮食发展报告“㊁2020年数据来自农业农村部㊁国家发改委及国家统计局官方网站㊂图1㊀稻谷最低收购价与市场价走势Fig.1㊀Trendofminimumpurchasepriceandmarketpriceofrice㊀㊀从图1可知,2004 2020年,稻谷最低收购价格与市场价格走势曲线非常相似㊂初期稻谷市场价相对低迷,最低收购价也保持低位运行;随后稻谷市场价格显著上涨,最低收购价格也进入快速上升通道;之后稻谷市场价格增速明显放缓,最低收购价也明显回落㊂2㊀粮食最低收购价与市场价关系的实证分析2.1㊀相关性分析㊀相关性分析是进行实证性分析的基础,只有相关程度显著,下一步的分析才有意义㊂相关系数反映了变量之间联系的密切程度,系数越高表明两者之间的关系越紧密,相关性越高,我国2004 2020年粮食最低收购价与市场价的相关性分析结果见表1㊂表1㊀稻谷最低收购价格与市场价格的相关系数Table1㊀Correlationcoefficientbetweenminimumpurchasepriceofriceandmarketprice序号No.项目Project相关系数Correlationcoefficient1早籼稻市场价(X1)与最低收购价格(Y1)0.9612中籼稻市场价(X2)与最低收购价格(Y2)0.9463粳稻市场价(X3)与最低收购价格(Y3)0.959㊀㊀从表1可以看出,早籼稻㊁中籼稻和粳稻的最低收购价格与其市场价格的相关系数均高于0.94,说明两者存在显著的相关关系㊂2.2㊀单位根检验㊀由于粮食最低收购价和市场价为时间序列数据,由于经济变量时间序列数据多为非平稳序列,因此有必要对变量进行平稳性检验,该研究采用ADF检验方法,检验结果见表2㊂㊀㊀通过检验发现,粮食最低收购价格与市场价格的水平序列是非平稳的,但其一阶差分数据平稳,即均服从一阶单整,故需要用协整理论进一步分析两者之间长期均衡关系㊂2.3㊀Johansen协整检验㊀由于粮食最低收购价格与市场价都是一阶单整序列,为检验其是否存在长期稳定的协整关系,采用Johansen协整检验方法,检验结果见表3㊂由表3中最大统计量和轨迹统计量对应的P值可知,在0.05的显著性水平下,早籼稻和粳稻的最低收购价与其市场价均存在1个协整方程,中籼稻的最低收购价和其市场价存在2个协整方程,即稻谷最低收购价和其市场价之间存在着长期稳定的均衡关系㊂2.4㊀Granger因果检验㊀虽已证明稻谷最低收购价格和市场价格存在长期的均衡关系,但这种长期均衡关系究竟是最低价格的变动引起市场价的变动,还是市场价的变动引起最低价格的变动,需要对稻谷最低收购价格和市场价格进行Granger因果检验,检验结果见表4㊂表2㊀粮食最低收购价与市场价的ADF检验Table2㊀ADFtestofminimumpurchasepriceandmarketpriceofgrain变量Variable检验形式(C,T,K)Inspectionform(C,T,K)ADF统计量ADFstatistics5%临界值5%thresholdP值PvalueX1(C,T,1)-2.503050-4.0081570.3211Y1(C,T,1)0.349165-4.1078330.9940X2(C,T,1)-2.337509-3.9333640.3842Y2(C,T,1)0.021352-4.1078330.9851X3(C,T,1)-2.008605-3.9333640.5339Y3(C,T,1)-1.197149-3.9333640.8570ΔX1(C,N,1)-3.942288-3.2598080.0192ΔY1(N,N,1)-3.108806-1.9881980.0061ΔX2(C,N,1)-3.410352-3.2598080.0404ΔY2(N,N,1)-3.025015-1.9881980.0072ΔX3(C,N,1)-3.646369-3.2126960.0261ΔY3(N,N,1)-3.794029-1.9823440.0016㊀注:检验形式中C㊁T㊁K分别表示常数项㊁趋势项和滞后阶数(遵循SIC准则),Δ表示差分形式㊂㊀Note:Inthetestform,C,TandKrespectivelyrepresentconstantterm,trendtermandlaggingorder(followingSICcriterion),Δindicatesthedifferenceform.表3㊀CPI与PPI的Johansen协整检验Table3㊀JohansencointegrationtestofCPIandPPI协整序列CointegrationsequenceH特征值Characteristicvalue迹统计量Tracestatistics5%临界值5%thresholdP值PvalueY1X100.84305322.23128018.3977100.013810.1556441.8609963.8414660.1725Y2X200.71824918.18974015.4947100.019210.3208294.2557083.8414660.0391Y3X300.79274119.00652015.4947100.014210.1427961.6948673.8414660.1930㊀㊀由表4可知,在0.10的显著性水平下,早籼稻和中籼稻均只存在单向的Granger因果关系,即稻谷市场价格是导致其最低收购价格的Granger原因,最低收购价格不是其市场422㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀安徽农业科学㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀2023年价变化的Granger原因,而粳稻的最低收购价格和市场价格互为Granger原因㊂为准确反映稻谷最低收购价格和市场价的关系,从两者因果关系出发,利用Excel构造了两者的非线性回归模型:㊀㊀Y1=30.037e0.0109X(R2=0.9467)(1)㊀㊀Y2=32.313e0.0105X(R2=0.9253)(2)㊀㊀Y3=28.993e0.0109X(R2=0.9479)(3)㊀㊀X3=55.045e0.0067Y(R2=0.9063)(4)㊀㊀从式(1)㊁(2)可知,早籼稻和中籼稻市场对最低收购价有显著正向影响,市场价每变化1个单位,早籼稻最低收购价将同向波动1.09%,中籼稻最低收购价也将同向波动1.05%㊂从式(3)㊁(4)可知,粳稻市场价与最低收购价之间显著正相关,粳稻市场价每变化1单位,会带动最低收购价同向波动1.09%;当粳稻最低收购价每变动1个单位,其市场价也将同向波动0.67%㊂2.5㊀脉冲响应函数㊀脉冲响应函数测量内生变量对误差的反映程度,即通过在扰动项上加上一个标准差大小的信息以观其对内生变量的现值和未来值的影响㊂2.5.1㊀早籼稻市价与最低收购价的脉冲响应函数分析㊂利用Eviews8.0模拟的早籼稻市价与最低收购价的脉冲响应路径曲线见图2㊂表4㊀CPI与PPI的Granger因果检验Table4㊀GrangercausalitytestofCPIandPPI零假设Zerohypothesis滞后阶数LagorderF⁃统计量F⁃statisticP值Pvalue结论Conclusion(0.10显著性水平)X1doesnotGrangercauseofY1199.71464.E-06拒绝零假设Y1doesnotGrangercauseofX110.448030.5201接受零假设X2doesnotGrangercauseofY21143.2188.E-07拒绝零假设Y2doesnotGrangercauseofX210.994190.3448接受零假设X3doesnotGrangercauseofY323.915210.0816拒绝零假设Y3doesnotGrangercauseofX327.338820.0244拒绝零假设图2㊀早籼稻市价与最低收购价的脉冲响应路径曲线Fig.2㊀Impulseresponsepathcurvebetweenmarketpriceandminimumpurchasepriceofearlyindicarice㊀㊀从图2(a)可知,最低收购价格对于来自市场价格一个标准差的冲击,在当期反映仅1%,但随后增大,并于第3期达到最大值10%,随后呈现下降趋势;从图2(b)来看,市场价面对早籼稻最低收购价一个标准差的冲击,并无显著反应㊂对比图2(a)说明,早籼稻市场价对最低收购价的影响显著大于最低收购价对市场价的影响,与之前Gromger因果检验的结果相吻合㊂从图2(c)来看,早籼稻最低收购价格对自身一个标准差的冲击,在当期也只是作出2%的反应,随后持续减弱;从图2(d)来看,早籼稻市场价格对自身一个标准差的冲击,在当期就表现出较大反应,接近9%,随后出现下降趋势㊂这说明,早籼稻最低收购价受市场价的影响大于受自身的影响;早籼稻市场价受自身的影响要大于来自最低收购价格的影响㊂2.5.2㊀中籼稻市价与最低收购价的脉冲响应函数分析㊂利用Eviews8.0模拟的中籼稻市价与最低收购价的脉冲响应路径曲线见图3㊂㊀㊀根据图3(a)可知,中籼稻最低收购价对于来自市场价一个标准差的冲击,在当期反映极小仅0.1%,但随后上升,在第3期达到最大值5.4%,之后呈下降趋势;从图3(b)看,中籼稻市场价对于其最低收购价的一个标准差冲击,当期反应为0,存在滞后效应,随后上升,也在第3期达到最高点4.9%,随后逐渐下降㊂对比图3(a)说明,中籼稻市场价格对最低收购价格的影响要大于其最低收购价格对市场价的影响,也进一步验证了之前Gramger因果检验的结果㊂从图3(c)来看,中籼稻最低收购价对于自身一个标准差的冲击,在当期反应较小,仅为1.6%,在第2期继续降低,但之后开始上升,在第4期达到最大值4.9%,随后呈现出下降趋势;从图3(d)来看,中籼稻市场价对于自身一个标准差的冲击,当期反52251卷6期㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀肖翔霞等㊀粮食最低收购价与市场价关系的实证分析应较大,接近5%,在第二期达到最大值6.8%,随后呈现出下降趋势㊂以上表明,中籼稻最低收购价受其市场价的影响要大于受自身的影响;中籼稻市场价受自身的影响大于受其最低收购价的影响㊂图3㊀中籼稻市价与最低收购价的脉冲响应路径曲线Fig.3㊀Impulseresponsepathcurvebetweenthemarketpriceandthelowestpurchasepriceofmediumindicarice2.5.3㊀粳稻市价与最低收购价的脉冲响应函数分析㊂利用Eviews8.0模拟的粳稻市价与最低收购价的脉冲响应路径曲线见图4㊂图4㊀粳稻市价与最低收购价的脉冲响应路径曲线Fig.4㊀Impulseresponsepathcurvebetweenmarketpriceandminimumpurchasepriceofjaponicarice㊀㊀从图4(a)来看,粳稻最低收购价格对于来自市场价格一个标准差的冲击,在当期仅2%的反应,随后增大,在第3期达到最大值8%,随后呈现下降趋势;从图4(b)来看,粳稻市场价对于来自最低收购价一个标准差的冲击,在当期没有反应,存在时滞,之后增大,并于第3期达到最高值11%,之后开始下降㊂对比图4(a)说明,在当期粳稻市场价格对其最低收购价格的影响稍强于最低收购价格对市场价格的影响,但后期最低收购价格对市场价格的影响要大于市场价格对其最低收购价格的影响,亦与前文的Granger因果检验结果相呼应㊂从图4(c)来看,粳稻最低收购价格对自身一个标准差的冲击,在当期反应在4%左右,第2期保持平稳,随后上升,并于第4期达到最大值11%,且持续至第5期,之后呈下降趋势;从图4(d)来看,粳稻市场价对自身一个标准差的冲击,在当期反应为6%,并于第2期达到最大值8%,之后呈下降趋势㊂以上说明,对于粳稻最低收购价而言,在前期主要受自身的影响,后期主要受市场价的影响;对于粳稻市场价而言,当期受自身的影响要大于来自其最低收购价的影响,但后期主要受最低收购价的影响㊂3㊀结论与建议3.1㊀结论㊀运用相关性分析㊁协整分析㊁Granger因果检验和622㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀安徽农业科学㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀2023年脉冲响应函数分析等方法,对稻谷最低收购价和市场价进行了实证分析,得出如下结论:(1)稻谷最低收购价和市场价之间存在显著的因果关系㊂在0.10的显著性水平下,早籼稻和中籼稻的最低收购价与市场价只存在单向因果关系,即其稻谷市场价格是其最低收购价变化的显著原因;而粳稻的最低收购价和市场价互为Granger原因㊂(2)从长期来看,稻谷最低收购价和市场价之间具有长期均衡关系㊂即早籼稻和中籼稻最低收购价的提高主要是市场价格的推动,粳稻的最低收购价和市场价的走势是在其双方的长期博弈中形成㊂(3)从短期来看,稻谷最低收购价与市场价相互作用关系存在品种差异㊂对于早籼稻和中籼稻而言,市场价对最低收购价的影响显著大于最低收购价对市场价的影响,最低收购价受市场价的影响大于受自身的影响,市场价主要受自身影响;与之相反,粳稻最低收购价对市场价的影响大于市场价对最低收购价的影响,粳稻最低收购价在前期主要受自身的影响,后期主要受市场价的影响,粳稻市场价受自身当期的影响要大于来自其最低收购价的影响,但后期主要受最低收购价的影响㊂故就最低收购价对市场价影响的范围和时间长度而言并不足以撼动稻谷市场自身的规律,即最低收购价格对市场价格的影响终究是有限的㊂3.2㊀对策建议㊀在新的历史关口时期,粮食安全和农民增收是实现中华民族伟大复兴最广泛最深厚的基础[13-15]㊂因此,深刻认识粮食最低收购价和市场价关系对全面实施乡村振兴具有重要的现实意义㊂3.2.1㊀进一步增强政策弹性,深化稻谷价格形成机制改革㊂粮价作为百价之基,是最低收购价政策保驾护航的对象,故最低收购价的调整复杂而敏感,且暂时无法提供更好的替代方案,因此继续保留最低收购价政策框架实属必要㊂鉴于2016年早籼稻最低收购价的首次下调已作为改变市场价预期的 首发 ,2017年全面下调稻谷最低收购价又已打破价格水平 只升不降 坚冰,因此,赋予最低收购价政策更强的灵活性和弹性是大势所趋,具体可从适当延后最低收购价执行起止时间㊁提高预案启动条件㊁加大预案执行时间的跨度弹性以及相应提高收购稻谷的质量标准等方面入手㊂3.2.2㊀准确把控稻谷最低价调整的节奏和力度㊂早籼稻㊁中籼稻和粳稻最低收购价对其市场价的影响存在差异,因此区别稻谷品种针对性调整最低收购价改革的力度与重点,逐步将最低收购价调整至合理水平㊂(1)早籼稻与中籼稻需保持政策框架基本稳定,引导稻谷产品结构调整㊂在早籼稻与中籼稻的最低收购价与市场价的博弈中,市场价占据着主导地位,最低收购价的影响相对有限㊂即早籼稻与中籼稻最低收购价政策已趋于托底功能,兜底线㊁稳预期的政策效用较突出,可供早籼稻和中籼稻最低价政策调整的空间有限,因此政策调整的重点在于,要充分利用有限的可调控空间充分发挥最低价政策对稻谷品种结构的导向作用㊂考虑到稻谷种植结构的调整是一个长期的过程,需要最低收购价政策的逐步引导,故其后期调整的幅度不宜过大,需保持政策框架基本稳定,为优化稻谷产品结构提供明显指向性;品种上,重点调减早籼稻㊁增加粳稻生产;品质上,重点抓好质量提升和品牌创建㊂(2)粳稻最低收购价改革要更加强调稳中求进㊂基于粳稻最低收购价对市场价存在较强的托市效应,为更好地发挥市场机制作用,进一步激发市场活力,粳稻最低收购价的调整显得更为迫切㊂一方面,可以适当加大粳稻最低收购价下调的幅度,逐步将粳稻最低收购价调整至合理水平;另一方面,为了平减粳稻最低收购价大幅下调所产生的冲击,降低粳稻生产主体对最低收购政策的依赖性,可从粳稻入手开展粮食作物完全成本保险和收入保险试点,充分发挥农业保险在保护农民利益中的重要保障作用㊂(3)节本增效缩短改革阵痛期,实现增加农民收入和保障有效供给的双重目标㊂在稻谷价格提升受限的背景下,为分散最低收购价下调给粮农带来的收益风险,必须另辟蹊径,在有效控制稻谷种植成本㊁保障稻谷供给的同时,促进农户增收㊂一是提高资源环境利用集约度,将单一水稻种植发展为稻鱼㊁稻虾㊁稻蟹或稻虾鳅共作等立体农业,实现种养结合㊂二是从稻谷分布区域出发,将区域优势与品牌打造相结合,在全国形成 一区一品 的稻谷格局㊂立足于稻谷各个品种主产区,优化区域布局,整合小散乱品牌,集中培植发展主产区域公共品牌,突出绿色优质稻谷的打造和生态服务供给㊂参考文献[1]曹慧,张玉梅,孙昊.粮食最低收购价政策改革思路与影响分析[J].中国农村经济,2017(11):33-46.[2]王双进.粮食托市收购的困境及改革取向[J].经济纵横,2015(11):87-92.[3]李国祥.为什么要继续执行并完善最低收购价政策[J].农村经济,2016(4):3-7.[4]陈亭.我国粮食最低收购价的完善建议[J].改革与战略,2017,33(5):30-32.[5]兰录平.我国粮食最低收购价政策的效应和问题及完善建议[J].农业现代化研究,2013,34(5):513-517.[6]张建杰.对粮食最低收购价政策效果的评价[J].经济经纬,2013(5):19-24.[7]丁声俊.正确认识㊁评价和改进粮食 托市收购 政策[J].价格理论与实践,2013(10):11-15.[8]胡锋.政府因何提高2008年稻谷最低收购价[J].中国粮食经济,2008(2):23.[9]武拉平.新时代粮食安全观的新特点与新思维[J].人民论坛,2019(32):30-31.[10]刘兴舟,张建,庄晓林,等.中国粮食安全现状与应对策略[J].农业工程,2019,9(7):61-64.[11]陈锡文.粮食安全面临三大挑战[J].中国经济报告,2014(2):43-45.[12]郭惠武.营养供给角度的中国粮食安全分析[J].中国畜牧杂志,2022,58(9):314-320.[13]王一飞.我国粮食价格的影响因素分析[J].经济经纬,2016,33(6):54-59.[14]吴玲霞.贸易战和新冠疫情背景下中国稳定粮食价格策略研究[J].价格月刊,2020(8):20-23.[15]张昌,余炳文.粮食价格与居民消费价格水平联动效应研究[J].价格月刊,2022(2):28-34.[16]胡海燕,高志强.构建国家粮食安全长效机制的思考[J].安徽农业科学,2022,50(9):244-246.72251卷6期㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀肖翔霞等㊀粮食最低收购价与市场价关系的实证分析。
第43卷第1期2020年1月河北农业大学学报JOURNAL OF HEBEI AGRICULTURAL UNIVERSITY Vol.43 No.1Jan. 2020收稿日期:2019-05-05基金项目: 国家自然科学基金(3117022);华北理工大学研究生创新项目(2018S42).第一作者: 袁嘉庆(1989-)男,陕西佳县人,硕士,主要从事比较基因组学研究.E -mail:yuanjiaqing1013@ 通信作者: 王希胤(1972-)男,河北唐山人,博士,教授,主要从事比较基因组学研究.E -mail:wangxiyin@ 本刊网址:http: // hauxb. hebau. edu. cn: 8080 /CN/ volumn / home. shtml文章编号:1000-1573(2020)01-0048-07DOI :10.13320/ki.jauh.2020.0007柚子基因组比较分析以及祖先染色体重构袁嘉庆,王金朋,王希胤(华北理工大学 生命科学学院,河北 唐山 063210)摘要:柚子(Citrus grandis Osbeck )全基因组测序完成为柑橘植物乃至整个芸香科植物提供了研究机会。
本研究通过对柚子基因组结构分析,鉴定柚子基因组中存在的由多倍化产生的重复基因,构建了葡萄基因组和柚子基因组之间与多倍化、物种分化相关联的同源共线性基因列表,为柚子基因组进化和基因功能演化提供了重要的比较基因组学数据资源;通过与外类群葡萄保留的同源染色体区域进行比较,发现柚子基因组在多倍化之后发生了大量的片段化重组;利用葡萄基因组保留有较完整的染色体结构相对于真双子叶六倍体(ECH),结合葡萄和柚子基因组之间的同源关系,推断出柚子祖先基因组结构。
本研究对理解柚子基因组乃至柑橘植物基因组以及其进化提供了重要的比较基因组学的基础。
关 键 词:柚子;共线性;多倍化;片段化;染色体重构中图分类号: Q 949.752.7 开放科学(资源服务)标志码(OSID):文献标志码:AComparative analysis of pummelo genome and reconstruction of its ancestorYUAN Jiaqing, WANG Jinpeng, WANG Xiyin(School of Life Sciences, North China University of Science and Technology, Tangshan 063210, China)Abstract: With rich nutrition in fruits, pummelo has very important economic value. The sequencing of genome structure of pummelo has been completed, which provides an opportunity to study Citrus plants and the Rutaceae plants. By comparatively analyzing the relationships among genomes and within genomes, we deduced the duplicated genes produced by polyploidization and indentified the orthologies between the compared genomes. After then, we performed a colinear list between grape and pummelo associated with polyploidization and speciation, which provided an important genomic comparative resource to study the genome evolution and gene functions of pummelo. Comparing with the homologous region of the outgroup grape, we found that the pummelo had suffered severe fragmentation recombination. Furthermore, considering the outgrowp grape genome with a relatively complete structure as to ECH, we deduced the ancestor genome structure of pummelo. Finally, this study provides an important comparative genomics resource for understanding the evolution of pummelo, even of Citrus plants.Keywords:pummelo; colinearity; polyploidization; fragmentation; chromosome reconstruction柚子(Citrus grandis Osbeck ),是芸香科(Rutaceae )、柑橘属(Citrus )下重要的植物,起源于东南亚,现主要分布在北纬35°以南的亚热带地域[1]。
54卷水稻抗稻瘿蚊的离子组研究蒋哲1,范晓苏1,2,3,曹振宇1,周桂花1,陈英之1,3,莫怿1,覃宝祥1,邱永福1,2,3*(1广西大学农学院,广西南宁530004;2广西农业环境与农产品安全重点实验室,广西南宁530004;3广西高校作物栽培学与耕作学重点实验室,广西南宁530004)摘要:【目的】探索水稻中不同营养元素响应稻瘿蚊取食的差异,为稻瘿蚊防治及水稻抗稻瘿蚊机理阐释提供新思路。
【方法】以稻瘿蚊抗性近等基因系43W-NIL和感性品系9311为材料,利用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)测定抗感水稻材料在接种稻瘿蚊后第0、5、7和9d时植株体内的营养元素含量;利用水培法验证关键元素受稻瘿蚊取食诱导的变化;通过qRT-PCR测定与营养元素代谢相关基因在抗感材料中的表达量。
【结果】离子组分析共鉴定25种营养元素,大部分元素在抗感材料及稻瘿蚊取食前后差异明显。
接种稻瘿蚊后,与9311的第0d相比,43W-NIL中Ti、K、P 和S元素含量较高,而Pb、Sr和Ca元素含量较低。
离子组的主成分分析发现,PC1和PC2分量分别解释40.0%和24.7%的变异。
主成分载荷分析结果表明,Ca、Sr、Co、Pb、Be、Sb、Fe、Ti、P、S和K的含量变化可以区分抗性和感性材料,且影响稻瘿蚊抗性最重要的5种元素依次为Ca、Sr、P、K、Co。
水培植株的接虫试验发现,高浓度的外源Ca处理可促进稻瘿蚊幼虫在抗性水稻中生长,而低浓度P、K处理会抑制稻瘿蚊幼虫在感性材料中生长。
qRT-PCR结果显示,钙调蛋白基因(OsCML20)表达量与Ca2+含量的变化趋势相同;钾转运蛋白基因(OsHAK12)的表达量在抗感材料中均表现为先下降后上升。
【结论】Ca、P和K等3种元素可能在水稻响应稻瘿蚊取食中发挥关键作用。
OsHAK12和OsCML20基因可能是稻瘿蚊抗性表达机制中的重要基因。
离子组学可从元素、营养的角度发现水稻在被稻瘿蚊取食时的差异,为植物抗虫机理研究提供新思路。
引文格式:王石华. 不同海拔产生的水稻F 2群体孕穗期耐冷性遗传相关性分析[J]. 云南农业大学学报(自然科学), 2023,38(5): 725−731. DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).202211049不同海拔产生的水稻F 2群体孕穗期耐冷性遗传相关性分析*王石华(曲靖师范学院 教育教学质量监控中心,云南 曲靖 655011)摘要: 【目的】研究海拔引起的环境温度变化对籼、粳稻细胞质背景下的F 1配子基因型选择效应及其对后代分离群体孕穗期耐冷性遗传相关性的影响,以期为水稻耐冷育种提供参考。
【方法】以耐冷性极强的粳稻老品种小麻谷和具有籼稻细胞质背景的改良粳稻品种南34为亲本,将在3个海拔条件下产生的正、反交杂合体F 2群体种植于海拔2 200 m ,对其生物学性状间的相关性进行比较分析,并在此基础上对孕穗期耐冷性主要指标小穗育性进行回归分析和通径分析。
【结果】产生F 2群体的海拔与其各性状间的相关性具有明显效应,该效应受到籼、粳细胞质背景的影响。
所有F 2群体中实粒数和总粒数对小穗育性都有明显的贡献度,其中实粒数为正向贡献且贡献度最大,总粒数为负向贡献,株高、主穗长和着粒密度等要素也在不同的F 2群体中表现出一定的贡献值。
【结论】海拔对水稻F 2群体孕穗期耐冷性遗传选择具有明显的影响。
在水稻耐冷性育种中可选择耐冷性强的亲本进行杂交,将F 1杂合体种植于海拔或温度差异较大的不同环境条件下,再将其分离群体种植于低温条件下进行筛选,即能够选择到耐冷性更强的单株。
关键词: 籼、粳稻细胞质;海拔变异;F 2群体;孕穗期耐冷性;间接选择中图分类号: S511.035.1 文献标志码: A 文章编号: 1004–390X (2023) 05−0725−07Genetic Correlation Analysis of Cold Tolerance at Booting Stage inRice F 2 Populations Generated at Different AltitudesWANG Shihua(Control Center of Education and Teaching Quality, Qujing Normal University, Qujing 655011, China)Abstract: [Purpose ]To study the selection effects of environmental temperature change caused by altitude on F 1 gamete genotype under the cytoplasmic background of indica and japonica rice and its effects on genetic selection of cold tolerance at booting stage in segregation population, providing ref-erence for rice cold tolerant breeding. [Methods ]The correlation of biological characters were ana-lyzed in F 2 populations generated from reciprocal hybrids at three different altitudes planted at 2 200 m altitude. The material parents were Xiaomagu, japonica rice landrace that had strong cold tol-erance, and Nan 34, an improved japonica variety that cytoplasm donated by indica rice. On this basis, regression analysis and path analysis were conducted on spikelet fertility, which was a main in-dex of cold tolerance at booting stage. [Results ]The altitude of the F 2 population had a significanteffect on the correlation among the traits in the F 2 population, and this effect was affected by the cyto-云南农业大学学报(自然科学),2023,38(5):725−731Journal of Yunnan Agricultural University (Natural Science)E-mail: ********************收稿日期:2022-11-22 修回日期:2023-09-26 网络首发日期:2023-10-11*基金项目:国家自然科学基金项目(30860065)。
曾晋,臧敏,张瑞琪,等.水稻幼苗对As (Ⅲ)胁迫差异响应的离子组学研究[J].农业环境科学学报,2023,42(3):511-519.ZENG J,ZANG M,ZHANG R Q,et al.Ionomic studies of rice seedling differential responses to arsenite stresses [J].Journal of Agro-Environment Science ,2023,42(3):511-519.水稻幼苗对As (Ⅲ)胁迫差异响应的离子组学研究曾晋,臧敏,张瑞琪,李利梅,马丽*(河南农业大学林学院,郑州450002)Ionomic studies of rice seedling differential responses to arsenite stressesZENG Jin,ZANG Min,ZHANG Ruiqi,LI Limei,MA Li *(College of Forestry,Henan Agricultural University,Zhengzhou 450002,China )Abstract :Ionomic profiles of plants display correlations with the stress inducing heavy metals to which they are exposed.Investigation of ionomic variation can provide insights into the mechanisms that promote element uptake or detoxification in plants.In this research,nine main rice varieties obtained from Linwu County,Hunan Province were treated with arsenate during hydroponic growth.The elements P,K,Mg,Ca,Mn,Fe,Cu,Zn,As,Cr,Co,Cd,Ba,Pb,and Sr in shoots and roots of rice seedlings subjected to As(Ⅲ)stress were quantitatively analyzed by ICP-MS.Associations between the ionome and arsenic in each tissue were further clarified using multivariate statisticalanalysis.Arsenic increased in both roots and shoots with increasing concentration of As(Ⅲ)exposure,and roots were more likely to accumulate arsenic than shoots.Fe,Ba,Pb,and Sr showed the same distribution trend as As,whereas the nutrient elements (P,K,Mg,Ca,and Mn )accumulated to higher levels in shoots than roots.The effects on distribution of each element in the two tissues of rice seedlings varied with stress condition,indicating that external As stress interfered with ion distribution in rice tissues.Cluster heat map and principalcomponent analyses showed that ion groups appeared separately in shoots and roots,with Mg,K,P,Mn,Ca,Cr,Co,and Zn tending to be收稿日期:2022-08-18录用日期:2022-10-25作者简介:曾晋(1999—),女,河南南阳人,硕士研究生,研究方向为生态毒理学。
Comparative Transcriptome Analysis of Acanthochitona rubrolineata and Liolophuura
japonica
作者: 张倩[1];吴一晶[1]
作者机构: [1]闽江学院海洋研究院,福建福州350108
出版物刊名: 闽江学院学报
页码: 92-101页
年卷期: 2021年 第5期
主题词: 红条毛肤石鳖;日本花棘石鳖;比较转录组;Pax基因家族
摘要:多板纲动物具有独特的形态结构,而且在软体动物的系统进化中占有重要地位,但目前有关多板纲的分子生物学研究十分欠缺.该研究通过RNA-seq技术对红条毛肤石鳖和日本花棘石鳖进行了转录组测序,组装后分别获得121 892和83 776个Unigene,虽然两个物种属于不同的科,但GO和KEGG功能富集分析结果显示二者表达基因较为一致,SSR在转录本中的数量与分布也无显著差异.此外,鉴于Pax基因与动物形态结构发育密切相关,且在多板纲中的研究几乎为空白,所以该研究着重关注了Pax基因.通过转录组数据分析,共筛选到8条Pax基因,在系统进化树中均与相对应的软体动物Pax基因亚族聚为一支,表明多板纲的Pax基因进化保守.该研究获得的转录组信息丰富了多板纲的分子数据,为进一步探究多板纲动物生物学性状提供了良好的遗传信息基础.。
木贼镰刀菌最适营养条件筛选【摘要】本研究旨在通过木贼镰刀菌的营养条件筛选,探讨其最适生长条件及菌株特性。
首先介绍了菌株的来源,并详细描述了营养条件筛选方法。
通过实验研究,确定了木贼镰刀菌的最适生长条件,并进行了菌株特性分析及基因测序结果分析。
结论部分指出了木贼镰刀菌最适营养条件筛选的重要性,展望了研究成果,并提出了未来研究方向。
本研究为深入了解木贼镰刀菌的生长规律及菌株特性提供了重要参考,对相关领域的研究具有一定的指导意义。
【关键词】木贼镰刀菌、营养条件、筛选、最适生长条件、菌株特性、基因测序、重要性、研究成果、展望、未来研究方向1. 引言1.1 背景介绍随着对木贼镰刀菌的研究不断深入,人们发现其在生物医药和环境保护等领域具有潜在的应用价值。
木贼镰刀菌的生长条件和营养需求却鲜为人知,这给其在应用研究中带来了一定的困难。
本研究旨在通过对木贼镰刀菌的营养条件进行筛选,找出最适宜其生长和繁殖的环境因素,为进一步研究其生物学特性和应用潜力奠定基础。
通过对木贼镰刀菌的生长条件进行深入研究,希望能够为其在医药领域和环境修复领域的应用提供科学依据和技术支持。
1.2 研究目的研究目的:本研究旨在探究木贼镰刀菌在不同营养条件下的生长情况,寻找最适合其生长的营养条件,并深入分析菌株的特性。
通过对木贼镰刀菌最适营养条件的筛选研究,可以为该菌种的生长与繁殖提供科学依据,为进一步开发利用其潜在功能提供重要数据支持。
研究木贼镰刀菌在不同营养条件下的生长特性,有助于了解其生物学特性和适应能力,为环境修复和资源利用等领域的应用提供理论依据。
为了达到这一目的,我们将对木贼镰刀菌的菌株来源、营养条件筛选方法、最适生长条件研究、菌株特性分析以及基因测序结果分析等方面展开系统深入的研究,为木贼镰刀菌最适营养条件的筛选奠定科学基础。
1.3 研究意义木贼镰刀菌是一种古老的真菌,其在分解植物残体和有机物质中起着重要作用。
关于木贼镰刀菌生长的营养条件及其最适生长条件的研究相对较少。
测定水稻硅含量的一种简易方法戴伟民1 ,2 张克勤1 段彬伍3 孙成效3 郑康乐1 蔡润2 庄杰云1 , 3(1中国水稻研究所国家水稻改良中心/ 水稻生物学国家重点实验室, 浙江杭州310006 ; 2上海交通大学植物科学系, 上海201101 ; 3中国水稻研究所农业部稻米及制品质量监督检验测试中心, 浙江杭州310006 , 3 通讯联系人, E2mail :jz1803 @hzcnc. com)Rapid Determination of Silicon Content in Rice (Ory z a sat iv a)DAI Wei2min1 ,2 , ZHANG Ke2qin1 , DUAN Bin2wu3 ,SUN Cheng2xiao3 , ZHENG Kang2le1 , CAI Run2 , ZHUANGJie2yun1 , 3( 1 N ational Center f or Rice Imp rovement and S tate Key L aboratory of Rice Biology , China N ational Rice Research I nsti tute , Hangz hou310006 , China; 2 Plant Science Department , S hanghai J iaotong Universit y , S hanghai 201101 , China; 3 Rice Product Qual it y I nspection andS upervision Center , Chinese Minist ry of A gricult ure , China N ational Rice Research I nstitute , Hangz hou 310006 , China; 3Corres pondingaut hor , E2mai l : j z1803 @hzcnc. com)Abstract : A method for rapid determination of silicon content in rice was int roduced. The reliability of this method was verified by using a recombinant inbred line (RIL) population of rice combination Zhenshan 97B/ Milyang 46. Two hundred and forty nine RILs were t ransplanted in two replications. Simple correlation coefficient s of the silicon content in the hull , flag leafand culm in rice between duplicate samples of 498 rice materials were 0. 97954 , 0. 97026 and 0. 98848 , respectively. Simple correlation coefficient between the silicon content determined by the high2temperature alkaline fusion method and by the pres2 ent method with 10 representative samples was 0. 9993.Key words : rice ; silicon content ; determination method 摘要: 介绍了一种简易的测量水稻硅含量的方法,其主要特点为准确、方便、能批量化测定水稻硅含量。
暖地杓兰基因组
暖地杓兰(Nandinia binotata)是一种生活在暖地地区的哺乳动物。
它们属于杓兰科,是小型的食肉动物。
暖地杓兰的基因组是其生命的基础,它们的基因组中包含了决定其形态、生理特征和行为的遗传信息。
暖地杓兰的基因组研究对了解其适应暖地环境的生理机制具有重要意义。
通过研究暖地杓兰基因组,科学家们可以揭示出其对高温环境的适应性进化过程。
这有助于我们更好地理解生物是如何应对不同环境压力的,并为人类在应对全球气候变化中找到启示。
在暖地杓兰的基因组中,科学家们发现了许多与热适应相关的基因。
这些基因参与了调节暖地杓兰的体温、代谢和免疫系统等重要生理过程。
通过研究这些基因,科学家们可以了解到暖地杓兰是如何通过调节自身生理来适应高温环境的。
暖地杓兰的基因组也包含了一些与行为特征相关的基因。
它们的基因组中的这些基因可能与其社会行为、繁殖行为和食性选择等方面有关。
通过研究这些基因,我们可以更好地理解暖地杓兰的行为特征及其背后的遗传机制。
对于保护暖地杓兰这一濒危物种来说,研究其基因组也具有重要意义。
通过了解其基因组,我们可以更好地制定保护策略,并避免过度捕猎和栖息地破坏等威胁暖地杓兰生存的因素。
暖地杓兰基因组的研究对于了解其适应暖地环境的生理机制、行为特征以及保护该物种具有重要意义。
通过深入研究其基因组,我们可以更好地认识和保护这一珍贵的生物资源。
希望未来能有更多的科学家投入到暖地杓兰基因组研究中,为我们揭示更多关于暖地杓兰的奥秘。