973 蛋白质主要降解途径-细胞自噬的分子机制及功能
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自噬与泛素化蛋白降解途径的分子机制及其功能一、本文概述自噬与泛素化蛋白降解途径是细胞内蛋白质降解的两种主要方式,它们在维持细胞稳态、调控细胞生命周期、促进细胞适应环境变化等方面发挥着至关重要的作用。
本文旨在深入探讨这两种降解途径的分子机制及其功能,以期更全面地理解细胞内蛋白质降解的过程及其生物学意义。
我们将对自噬的分子机制进行详细介绍。
自噬是一种通过形成自噬体,将细胞内受损、变性或多余的蛋白质及细胞器运输至溶酶体进行降解的过程。
我们将从自噬体的形成、自噬底物的识别与选择、自噬体与溶酶体的融合以及降解产物的利用等方面,全面阐述自噬的分子机制。
同时,我们还将讨论自噬在细胞自稳、免疫应答、疾病发生发展等方面的生理功能。
我们将对泛素化蛋白降解途径的分子机制进行阐述。
泛素化是一种蛋白质翻译后修饰方式,通过泛素分子与底物蛋白的共价连接,标记底物蛋白以进行降解。
我们将从泛素化过程、泛素化底物的识别与降解、泛素化在细胞周期调控、信号转导等方面的作用等方面,深入探讨泛素化蛋白降解途径的分子机制。
我们还将讨论泛素化蛋白降解途径在细胞生长、分化、凋亡等过程中的生理功能。
我们将对自噬与泛素化蛋白降解途径的交叉点进行探讨,分析它们在蛋白质降解过程中的相互作用与协同作用,以及它们在维持细胞稳态、调控细胞生命周期等方面的共同功能。
通过对这两种降解途径的深入研究,我们有望为理解细胞内蛋白质降解的复杂过程提供新的视角,并为相关疾病的治疗提供新的思路和方法。
二、自噬途径的分子机制自噬是一种细胞内自我消化的过程,通过降解和回收细胞内受损、变性或多余的蛋白质及细胞器,来维持细胞的稳态和生存。
自噬过程涉及多个分子机制的协同作用,主要包括自噬体的形成、自噬体与溶酶体的融合以及底物的降解等步骤。
自噬体的形成是自噬过程的关键步骤。
在饥饿、压力等自噬诱导信号的作用下,细胞内的自噬相关基因(ATG)被激活,启动自噬体的形成。
ATG基因编码的蛋白质参与自噬体膜的形成和延伸,其中,ATG5和ATG12形成的复合物以及ATG8(也称为LC3)的脂化修饰是自噬体形成的关键事件。
细胞自噬的分子机制与调控研究
细胞自噬是一种通过降解细胞内受损或多余的蛋白质和细胞器,以维持细胞内稳态的过程。
它的分子机制和调控涉及多个步骤和复杂的信号网络。
一、分子机制
1. 自噬泡的形成:自噬泡是由双层膜结构形成的,包括内层膜和外层膜。
内层膜通常是由溶酶体或内质网等细胞器的一部分形成的,而外层膜则是由细胞膜的一部分形成的。
2. 自噬泡与目标物的结合:自噬泡会识别并包裹细胞内受损或多余的蛋白质和细胞器。
这个过程需要一系列的蛋白复合物和信号分子的参与。
3. 自噬泡的成熟和降解:自噬泡在形成后,会逐渐成熟并降解其内容物。
这个过程需要一系列的酶和蛋白参与,包括溶酶体酶、自噬相关蛋白等。
二、调控
1. mTOR和AMPK途径:mTOR和AMPK是细胞自噬过程中的重要调控因子。
mTOR可以通过抑制自噬的起始阶段来调节自噬,而AMPK则可以通过激活自噬相关蛋白来促进自噬。
2. ULK1和Beclin-1:ULK1和Beclin-1是自噬过程中的关键蛋白,它们在自噬的起始阶段发挥重要作用。
ULK1可以促进自噬相关蛋白的聚集,而Beclin-1则可以促进自噬泡的形成。
3. 营养和压力状态:细胞营养和压力状态也是影响自噬的重要因素。
在营养缺乏或应激条件下,细胞会启动自噬以适应环境变化。
总之,细胞自噬的分子机制和调控是一个复杂而精细的过程,需要多个步骤和信号网络的参与。
对这一过程的研究有助于我们更好地理解细胞的稳态维持机制,并为疾病治疗提供新的思路。
细胞自噬的机制和功能研究细胞自噬是一种通过溶酶体降解额外或有害的细胞成分的重要细胞内保护机制。
这个过程可以通过一些细胞器或胞质的生物发生来实现。
细胞自噬的机制和功能在细胞学、生物学和医学中具有重要意义。
在过去几十年中,研究者通过在各种器官和组织中观察细胞自噬的现象,实现了对这个过程的深入了解。
以下是对细胞自噬机制和功能的研究的总结。
细胞自噬的机制细胞自噬是由多种信号途径和分子机制调控的。
其中,根据形成位置和机制不同,细胞自噬被分为宏自噬和微自噬两种。
在宏自噬中,细胞通过形成双层膜来捕获或包裹细胞成分,将其转运到溶酶体,然后把其分解成单独的物质。
在微自噬中,呈膜结构的细胞成分被直接构成或毛细管系统被伪标记,然后融合到溶酶体中。
宏自噬的过程可以分为几个步骤:分别是加载、分泌、合并、淋巴酯酶(LIPA)降解、高分子碎片溢出。
细胞首先通过酪氨酸蛋白激酶mTOR抑制信号途径,启动细胞自噬过程。
ATG1-ATG13复合物(ATG:细胞自噬相关蛋白)会被蛋白酶范围B1(PRRB1)所磷酸化,并被解离成单独蛋白。
然后ATG9将蛋白质袋射向源液泡,ATG16L继续补充包翅膀袋的蛋白酶,形成汽车路线。
ATG16L 会与ATG7蛋白修饰酶结合,产生膜的存在。
接着,ATG9/ATG8与LC3/AA定量招聘,从而形成包囊。
包囊可通过光刻版等工具精确制备,并且可以清晰的观察。
一旦包袱出现,加载ATG9/ATG16L和LC3/AA的途径也变得更加显著。
通常,这些被指定为夹克球(topology-specific index),并且在细胞中具有非常强的存在感。
最后,细胞通过LIPA将细胞成分降解成单独的物质。
微自噬涉及的许多因子与宏自噬相同。
然而,微型成分的组织和细胞可以与宏自噬的物质不同。
这个过程通常与固定成分有关,包括蛋白,DNA人差一点没打成原来的去氧核糖核酸(DNA)。
在微自噬过程中,每个微自噬小囊泡是由内部单层囊泡贯穿对向的两个细胞膜创造的。
细胞自噬机制的分子机理与功能细胞自噬是一种细胞内分解废旧物质的重要过程。
自噬是一种细胞自我消化的途径,通过此途径,细胞可以将其无用或者受损的组分分解成基本营养物质并循环利用,同时还能帮助免疫系统清除病毒、细菌和癌细胞等有害物质。
自噬在维持正常生理和基因组稳定方面发挥着至关重要的作用。
本文将对细胞自噬的分子机理和功能进行探究。
自噬是由一系列相互联系的分子机制和信号途径组成的。
自噬的初始阶段包括囊泡的形成和扩张。
这个过程在细胞膜上形成膜泡,然后这些膜泡在细胞内部扩张,形成所谓的自噬体。
最后,自噬体与溶酶体融合,内部分解产物被注入到细胞质内或进入循环系统中。
自噬过程中的关键分子包括Apaf-1,Atg7,Beclin-1,和PI3K,这些分子与调控自噬的磷酸裂解酶形成复合物,在囊泡伸展和合并时发挥着至关重要的作用。
自噬具有几个不同的形式,包括微噬体自噬、内质网自噬、线粒体自噬和细胞器自噬等。
其中,线粒体自噬(mitophagy)是目前最为广泛研究的一种自噬形式。
线粒体自噬能够将细胞内损坏的线粒体通过嫌氧作用和线粒体外膜蛋白螺旋酶的作用进行清理。
另一种自噬形式内质网自噬(ER-phagy)则在细胞内外排除损坏的内质网。
自噬对细胞的正常机能发挥着至关重要的调节作用。
第一,自噬能够调节细胞生长和代谢。
自噬能够减少细胞内部积累的有害物质,稳定细胞内环境,帮助细胞适应不良环境。
第二,自噬能够调节细胞增殖和分化。
自噬在间接抑制癌细胞增量中发挥着关键调节作用。
最近的研究表明,自噬和抗肿瘤疗法密切相关。
第三,自噬在维持细胞稳态方面也起着至关重要作用。
例如,酒精分解在肝脏中由于产生过量的有害代谢物会使细胞出现功能失调,在这种情况下自噬会通过降低癌细胞激酶活性来保护细胞免受损伤。
细胞自噬在人类健康和疾病中扮演着重要角色。
人体内自噬机制出现失调时可能会导致肿瘤、代谢性疾病以及神经系统退化性疾病的发生。
例如,帕金森病被认为与自噬失调有关。
蛋白质降解与自噬作用
蛋白质是构成生命体的重要基础物质之一,其在细胞代谢中发挥着重要的功能。
而随着人类的生活方式的改变,出现了许多导致蛋白质消耗过多或需要进行大量蛋白质降解的情况,如身体过度运动、饥饿、疾病、化疗药物等,因此人体需要能够运用一定机制进行蛋白质降解和利用。
自噬就是一种能够完成细胞内蛋白质降解和再利用的机制。
自噬产生于20世纪50年代,其机制不仅涉及到蛋白质降解,也涉及其他细胞代谢活动。
自噬是一种细胞自我消除机制,可分为微型自噬和巨型自噬两类。
微型自噬是指细胞自我消化的一个部分或微区,通过细胞自身的溶酶体完成吞噬小颗粒的过程。
巨型自噬则是指细胞将有机物长链末端部分酶解成小颗粒,进而由溶酶体去除细胞内部分废弃物质的过程。
自噬的作用机制是将吞噬的蛋白质转化为氨基酸通过酶的反应使其变成能够供能的小分子,以维持细胞的生命活动。
自噬进程中不仅包括细胞吞噬物质、运输、酶解等许多步骤,而且是一种相互作用且相当复杂的三维阶梯程序。
微型自噬还可以通过细胞自身的信号通路来调节自己的活动,以通过这种自我调节的方式来完成蛋白质降解和再利用。
同时,微型自噬在衰老等过程中也有重要作用。
自噬的缺陷也会导致许多疾病的发生,如癌症、肌萎缩等。
储备充足的蛋白质可以帮助修复骨骼肌和心脏的受损组织,在一定程度上缓解了这些疾病的不良影响。
因此,对于自噬的研究可以帮助我们了解一些内在机制,从而设计更安全高效的药物,以提高生命质量。
细胞自噬与蛋白质降解维持细胞健康的重要机制细胞自噬和蛋白质降解是维持细胞健康的重要机制。
它们能够清除细胞内的垃圾和异常蛋白质,调节细胞的新陈代谢,保持细胞内稳态的平衡。
本文将探讨细胞自噬和蛋白质降解的作用机制及其在维持细胞健康中的重要性。
一、细胞自噬的作用机制细胞自噬是细胞内溶酶体通过吞噬和降解细胞内的成分的过程。
它分为三个主要步骤:包裹、运输和降解。
首先,细胞自噬会将不需要的或损坏的细胞成分包裹到双层膜的囊泡中,形成自噬体。
自噬体随后与溶酶体融合,使其内容物得以降解为小分子物质。
最后,新的小分子物质可用于细胞代谢的需要。
细胞自噬主要通过三个主要的途径调控:mTOR信号通路、AMPK 信号通路和细胞内钙平衡。
mTOR信号通路是细胞自噬的主要负调控者,其通过抑制自噬基因的表达和活性来抑制细胞自噬。
而AMPK信号通路则能够激活细胞自噬,通过磷酸化mTOR和其他相关蛋白质来促进自噬的进行。
此外,细胞内钙离子浓度的变化也能够调控细胞自噬的进行。
低钙状态会抑制自噬,而高钙状态则能够促进自噬。
二、蛋白质降解的机制蛋白质降解是细胞内对蛋白质进行分解和清除的过程,它主要通过两个机制实现:泛素-蛋白酶体系统和泛素-溶酶体系统。
在泛素-蛋白酶体系统中,泛素蛋白连接酶将泛素连接到需要降解的蛋白质上,然后将其送入蛋白酶体进行降解。
而在泛素-溶酶体系统中,泛素连接酶将泛素连接到要降解的蛋白质上,然后将其送入溶酶体进行降解。
泛素连接酶的选择性非常重要,它能够识别和连接不同状态的蛋白质。
对于出现异常的蛋白质,泛素连接酶会将泛素连接到其上,并引导其被降解。
而正常的蛋白质则不会被泛素连接酶识别和连接。
这使得蛋白质降解能够高效地清除异常蛋白质,保证细胞的正常功能。
三、细胞自噬和蛋白质降解对细胞健康的重要性细胞自噬和蛋白质降解对细胞健康具有重要的保护作用。
首先,它们能够清除细胞内的垃圾和异常蛋白质,保持细胞内稳态的平衡。
当细胞中堆积大量的垃圾和异常蛋白质时,细胞可能会发生功能异常和凋亡。
蛋白质降解途径研究及其生物学功能蛋白质是细胞中最重要的分子之一,是细胞结构、功能和代谢的基础。
在细胞内部,蛋白质的合成与降解是一个动态平衡的过程,其中蛋白质降解途径对于细胞的正常生理过程起着至关重要的作用。
蛋白质的降解途径主要包括两种:泛素-蛋白酶体途径和自噬途径。
泛素-蛋白酶体是真核细胞中最重要的蛋白质降解途径之一,其主要作用是分解细胞内部的蛋白质废物和异常蛋白质,维持细胞内部蛋白质的稳态。
而自噬是另一种主要的蛋白质降解途径,它主要由溶酶体分解和回收细胞内部蛋白质及其他细胞成分。
泛素-蛋白酶体途径和自噬途径同样重要的一个共同点就是它们的调节网络非常复杂。
泛素-蛋白酶体途径的关键结点是泛素加工酶,而自噬途径的关键结点则是相应的自噬基因ATG。
通过复杂的信号传递与调控网络,泛素-蛋白酶体和自噬途径共同保证了细胞内部蛋白质的处理和稳态维持。
值得注意的是,蛋白质降解途径对于生物学功能的影响也是非常重要的。
例如,泛素-蛋白酶体途径在一些细胞增殖和存活调控中扮演着重要角色。
通过影响蛋白质降解途径,可以有效调控细胞周期、减少蛋白聚集疾病的发生,促进代谢活动及细胞凋亡等生物学功能。
同时,蛋白质降解途径的研究也对疾病诊断和治疗具有重要意义。
泛素-蛋白酶体途径在肿瘤发展和免疫系统的调节中起到了重要作用,而自噬途径的故障又和多种人类疾病有关,如神经退行性疾病、癌症以及炎症等。
对于蛋白质降解途径研究来说,还有一项最基础也最重要的工作就是酶促反应机理的研究以及活性位点和底物选择性的研究。
这些工作的开展通常涉及到一系列生物化学手段,如酶学研究、晶体学解析、荧光探针与荧光共振能量转移技术等。
总之,对于蛋白质降解途径的研究具有广泛的生物学意义和临床实际应用价值。
随着人类对于细胞生物学、疾病发病机理的深入了解,蛋白质降解途径的研究将会进一步加强和深化。
细胞内蛋白质降解的分子机理和应用细胞是生命的基本单位,其中最为重要的功能之一就是蛋白质的合成和降解。
蛋白质降解是维持细胞内稳态的重要过程,通过降解不需要的或损坏的蛋白质来回收氨基酸和能量,同时也能够清除一些病毒和异常蛋白,保持细胞内环境的稳定。
细胞内蛋白质降解主要通过两种途径进行,分别是泛素-蛋白酶体途径和自噬途径。
其中泛素-蛋白酶体途径是针对细胞内蛋白质的标准途径,大多数蛋白质会经过这个途径进行降解,而自噬途径则是细胞对自身营养不足或损伤时的反应。
泛素-蛋白酶体途径的分子机理泛素-蛋白酶体途径是通过泛素标记蛋白质,使其被蛋白酶体降解的过程。
它的分子机理主要包括两个步骤:泛素化和降解。
泛素化泛素化是将泛素结合到目标蛋白上的过程。
泛素是由约76个氨基酸组成的小分子蛋白,它能够在多个位点上与目标蛋白结合。
泛素化的过程由泛素激活酶、泛素结合酶和泛素连接酶共同完成。
其中,泛素激活酶能够将泛素与ATP结合,使其形成泛素-AMP中间体,同时释放出PPi。
泛素结合酶能够将泛素-AMP中间体转移给泛素连接酶,使其在C端结合泛素,形成泛素-蛋白复合物,从而完成泛素化的过程。
降解泛素化后的蛋白会被送入蛋白酶体进行降解。
蛋白酶体是一种大分子蛋白质复合物,主要由核心的20S囊泡和外部的19S蛋白质复合物组成。
19S复合物能够识别泛素标记的蛋白,并将其送入20S囊泡中进行降解。
20S囊泡中含有多种蛋白酶,能够将蛋白质分解为小片段或单个氨基酸,并回收和利用其中的氨基酸和能量。
自噬途径的分子机理和应用自噬途径是通过将细胞内蛋白质或细胞器包裹成自噬体,而在溶酶体内降解的过程。
它分为非选择性自噬和选择性自噬两种类型。
非选择性自噬主要是针对长期储存的细胞蛋白和细胞器,在调节能量代谢时发挥重要作用。
选择性自噬则是指特定蛋白或细胞器的降解,包括线粒体、内质网和紧密连接的细胞膜。
自噬途径的分子机理主要包括以下几个步骤:自噬体形成、自噬体的运输和自噬体的降解。
蛋白质降解的分子机理和生理学功能蛋白质是生命机体内最重要的基本成分之一。
它们发挥着许多生理学功能,包括构成骨骼、筋肉、韧带、细胞膜等组织和结构;调节代谢活动、免疫功能以及通讯和信号传递等。
然而,蛋白质的生产和代谢过程都是复杂的,而且只要有一个环节的失调,都可能导致多种疾病的发生和发展。
其中,蛋白质降解是一个特别值得研究和重视的过程。
一、蛋白质降解的分子机理1. 蛋白质降解的类型根据蛋白质降解的途径和分子机制,可以分为两种类型:质量控制和降解。
质量控制作用于蛋白质的折叠和拆分过程中,防止不正确的蛋白质积累;而降解则是一种更彻底的蛋白质清除过程,它在细胞中起着维持稳态、代谢废物清除和疾病防御等作用。
2. 蛋白降解的途径蛋白质的降解途径包括如下几种:(1)泛素降解系统(UPS,Ubiquitin-Proteasome System)是一个主要完成细胞中蛋白质降解的通路。
在这一过程中,泛素分子被联接到需要被降解的蛋白质上,并促使其向蛋白酶体中移动。
蛋白酶体是一个大分子复合物,它的功能是对蛋白质进行降解。
(2)自噬(Autophagy),也称细胞自噬,是一种在细胞内部的途径。
这一过程包含了膜包覆、递送和降解等步骤,在代谢途径和细胞应激时发挥着相当的作用。
(3)棘球蛋白酶体(Lysosome),是特定细胞中蛋白质降解的主要通路。
降解物质通过胞内运输运往棘球体中,在酸性的环境下进行降解。
二、蛋白质降解的生理学功能1. 帮助细胞保持稳态细胞内的蛋白质需要在一定的浓度范围内保持稳定,这样才能正常发挥其功能。
当蛋白质合成发生突发的或长期的异常情况时,过剩的蛋白质将会堆积在细胞内,引发生物逆境。
蛋白质降解通路,则可以有效地清除这些不稳定或过量的蛋白质,维持细胞内稳态,抗击环境的压力。
2. 调控代谢途径蛋白质降解与代谢途径密切相关。
例如,当身体需要能量时,肝、肌肉和脂肪组织中的蛋白质被分解成氨基酸,被转移到肝脏中,氨基酸经过酮基酸处理进入三羧酸循环(Citric Acid Cycle),从而被氧化反应产生能量。
细胞内蛋白质降解途径和生理功能研究细胞内蛋白质降解途径是生命体的一项重要功能。
无论是正常的代谢活动还是病理状态的发生,都需要细胞内蛋白质降解途径的参与。
因此,对于这一领域的研究一直备受关注。
本文将从分子层面入手,探讨细胞内蛋白质降解途径所涉及的分子机制和生理功能。
细胞内蛋白质降解途径的种类目前已知的细胞内蛋白质降解途径主要有两种,即泛素依赖性途径和自噬途径。
泛素依赖性途径是指细胞将不需要的蛋白质标记为“垃圾”,然后通过泛素-蛋白酶体(UPP)和泛素-蛋白酶体系统(UPS)将其降解。
而自噬途径是指细胞通过自身的机制将膜包裹住的蛋白质降解。
泛素依赖性途径的分子机制泛素依赖性途径涉及的主要分子机制包括:泛素化、底物识别、聚集体形成和最终降解。
泛素依赖性途径的第一个步骤是底物蛋白的泛素化。
泛素化是指将泛素分子与底物蛋白共价结合,然后形成泛素标记的底物蛋白。
泛素化的过程是由泛素激活酶(E1)、泛素结合酶(E2)和泛素连接酶(E3)共同进行的。
泛素依赖性途径的第二个步骤是底物的识别。
底物蛋白中的特定序列或结构可能会被泛素连接酶所识别,然后将泛素化的底物蛋白送至聚集体。
泛素依赖性途径的第三个步骤是聚集体形成。
聚集体是指由泛素标记的底物蛋白所形成的、由UBA(ubiquitin-associated)和UBX(ubiquitin-regulated X)蛋白介导的分子团块,聚集体的形成是通过具有聚集体形成能力的小分子组成大分子的过程来实现的。
泛素依赖性途径的最后一个步骤是降解。
泛素蛋白酶体系统将聚集体包裹在泛素标记底物的降解环境中。
在这个过程中,泛素化的底物蛋白被泛素连接酶水解,然后底物蛋白被形成的蛋白酶体降解。
自噬途径的分子机制自噬途径的分子机制包括:识别和包裹、融合和降解。
自噬途径的第一个步骤是识别和包裹。
通过自噬小体膜的形成、包裹和固定底物蛋白,完成底物蛋白的目标捕获。
自噬小体是通过Vps34和其介导的PI3K(phosphatidylinositol 3-kinase)的激活来形成的。
蛋白质降解途径在细胞代谢中的作用及调控机制研究蛋白质代谢是生物体内一个重要的代谢过程,这个过程包括蛋白合成和蛋白降解。
蛋白质降解途径在细胞代谢中起着重要的作用,可以控制细胞内蛋白质的稳态,维持细胞正常的代谢活动,并且回收蛋白质碎片来维持细胞能量和氮平衡。
本篇文章将详细介绍蛋白质降解途径在细胞代谢中的作用及调控机制的研究进展。
一、细胞内蛋白质降解途径的种类在细胞内,蛋白质降解大致可以分为两种途径:酶体途径和自噬途径。
酶体途径主要是通过细胞内的酶体将降解的蛋白质储存在酶体内部,这种途径的主要优点是能够高效地将蛋白质降解,并保护细胞免受老化等因素的破坏。
同时,酶体还起到提供溶质的场所,并能通过miRNA的调节来控制降解过程。
而自噬途径则是通过细胞自身的噬菌体来降解蛋白质,这种途径具有灵活性高、缺乏特异性和协同作用等特点。
二、细胞蛋白质降解的重要作用蛋白质降解在细胞代谢中起着极其重要的作用。
它可以控制细胞内蛋白质的稳态,维持细胞正常的代谢活动,并且其中一些蛋白质降解产物可以用于回收细胞内的营养及能量。
此外,蛋白质降解还可以清除细胞内可能会出现的异常蛋白质,维持细胞内部环境的稳定。
当人体内免疫系统出现问题时,这种降解作用也可用于清除外来物质。
三、蛋白质降解的调控机制蛋白质降解的调控机制非常复杂,其中包含多种酶的调节机制、信号转导途径、特殊消化酶的活化等。
下面我们来具体介绍一下这些机制。
1、酯酶类和蛋白酶类细胞内蛋白质降解首先大部分需要的是通过酯酶类酵素降解,它能够水解部分蛋白质的新的氨基酸和水解产物,其机理是激活氨基酸驱动器以消耗能量水解香豆素。
2、信号通路和转录因子与此同时,蛋白质的降解过程也与信号转导途径和转录因子的活化有关。
比如,人体内的肌肉丝蛋白来通过调节mTOR,AKT等信号通路来对蛋白的降解过程进行调节。
此外,调节mRNA的絮葛或miRNA、coregulators等机制也能够通过转录因子来调节蛋白的降解过程。
细胞自噬与蛋白质降解讨论细胞如何通过自噬和蛋白质降解维护蛋白质质量细胞自噬与蛋白质降解讨论细胞自噬和蛋白质降解是维持细胞蛋白质质量的两种主要机制。
在这篇文章中,我们将讨论这些机制对于调节蛋白质代谢和保护细胞免受蛋白质异常聚集的作用。
细胞自噬是一种通过溶酶体降解细胞内垃圾的过程。
通过自噬体形成,细胞可以将包括蛋白质在内的细胞组成部分运输到溶酶体进行降解。
结果是,已受损的蛋白质被分解成氨基酸,这些氨基酸可以重新合成为新的蛋白质,为细胞提供必要的原料。
需要指出的是,细胞自噬对于保护细胞免受蛋白质异常聚集和运输受体介导的蛋白质降解中起着至关重要的作用。
例如,在神经退行性疾病中,细胞导向信号分子可以调节自噬通路,以促进蛋白质的有效降解,减少突触前蛋白的异常积累,从而减轻神经元死亡并减缓疾病进程。
此外,缺乏正常的蛋白质降解机制会导致蛋白质聚集异常,诱导各种疾病的发生和发展。
例如,动脉粥样硬化和神经细胞退行性疾病都与蛋白质聚集异常有关。
对于这些疾病,蛋白质降解和自噬通路的理解是至关重要的。
自噬和蛋白质降解通路的复杂性和相互作用在近年来已经得到广泛研究。
研究人员发现,自噬和蛋白质降解的通路不仅存在着竞争性相互作用关系,而且还存在协同作用。
这些通路的不同特点,可以让细胞根据代谢、生长、修复和应激等需要来选择使用其中的某些方式和相关因子。
例如,一项最新研究表明,一种名为Ubiquilin-1的蛋白质可以同时与自噬相关蛋白和特定的热休克蛋白结合。
这种蛋白质还特异性地调节蛋白质降解和自噬通路,从而维持健康细胞状态和预防疾病。
总之,细胞自噬和蛋白质降解机制是细胞维持蛋白质质量和延长细胞寿命的必不可少的过程。
对于理解许多疾病的病理生理机制以及开发药物治疗新策略具有重要意义。
细胞自噬机制的结构与功能解析细胞自噬(autophagy)是细胞内一种非特异性的溶酶体依赖性膜结构形成和参与代谢废物融合、分解和再利用的重要细胞代谢途径。
自噬是一种保持细胞内环境稳定性的方式,能够有效地清除细胞内垃圾、蛋白、代谢产物等废弃物,同时也是身体对于蛋白瘤、肿瘤等病变维持体内平衡的一种重要途径。
自噬通常分为微型自噬和宏观自噬两种,其中宏观自噬又分为包括酵母细胞法、Cvt途径和微管相关自噬(MAA)在内的各种途径,而微型自噬则被认为是自噬的起始阶段,与细胞质基质中融合的小囊泡-自噬小体(AV),是特定的膜结构,内衬有膜蛋白酸性肉苷酸酯酶(acidic-hydrolysis enzymes),能够降解各种内源性和外源性食物残渣、损坏的膜蛋白、蛋白质以及细胞核酸等分子。
自噬小体的形成一般包括以下几个步骤:1.随着自噬物聚集,自噬囊成为了一个扩大的小泡,进一步被分为两层膜结构,并与旁边的内质网融合形成一种被称为自噬体鼓浪鼓的结构体。
2.此时,自噬体的外层膜会与高度表达的蛋白LC3绑定,在膜结构内壁上形成一个LC3-II(一种与细胞器膜的蛋白)结构体,进而刺激自噬体与胞浆中体积大、陈旧、异常蛋白等物质聚集在一起。
3.在AV结构内,钙离子依赖性的脂蛋白A2(LIPA,一种催化细胞内脂低温-鱼油的酯化)进一步促进了废弃物膜蛋白的氧化。
4.在自噬体与内质网等膜结构的融合中,Autophagy-related Atg12-ATg5复合物(是一种能够作为一个桥梁连接Atg7和Atg10的因子,另外一侧与ATG18形成复合物)通过显微观下可见的Atg8/LC3-I形成Atg12-ATg5-LC3-I复合物形式。
5.最后,自噬小体与细胞质囊泡-膜蛋白二者之间的膜会发生逐渐的融合过程,从而将这些化合物与废弃物合并成簇,被运送到一个翻转的膜结构-嫁接体,膜内带有螺旋的室网筒,维持着AV被内部蛋白质酵素分解的不断旋转。
细胞自噬的机制与功能细胞自噬是一种重要的细胞生理过程,它通过分解细胞内部的蛋白质和细胞器来提供新的细胞组分和能量。
在细胞自噬过程中,细胞形成包裹囊泡,将需要降解的细胞成分包裹进去,然后将其降解并回收重复利用。
这一过程对于维持细胞的内稳态、应对环境压力以及清除老化和异常细胞具有重要的意义。
细胞自噬的机制可以分为三个主要步骤:包裹囊泡形成、囊泡后期融合与降解。
首先,在包裹囊泡形成阶段,细胞膜会包裹需要降解的细胞成分,形成一个称为自噬体的结构。
这个过程依赖于一组细胞自噬相关基因(Atg)的调控。
这些基因编码了多种蛋白质,它们协同工作,参与到自噬体的形成中。
其中,Atg8是自噬体主要的标记蛋白,它可以在自噬体形成过程中与自噬体膜结合。
其次,囊泡后期融合是细胞自噬的关键步骤。
在这一阶段,自噬体会与溶酶体融合,形成自噬体-溶酶体复合体。
最后,被降解的细胞成分在自噬体-溶酶体复合体中被降解为小分子物质,并释放出来。
细胞自噬在细胞生理中发挥着重要的功能。
首先,细胞自噬是维持细胞内部稳态的关键过程。
通过细胞自噬,细胞可以清除老化、损坏和异常的细胞成分,保持细胞内环境的稳定。
其次,细胞自噬在应对环境压力和代谢应激中起到了重要的作用。
当细胞面临营养不足、氧气供应不足或其他应激因素时,细胞可以通过调节细胞自噬的水平来适应环境。
细胞自噬可以分解细胞内部的非必需蛋白质和细胞器,提供新的生物大分子和能量,帮助细胞维持生存并应对应激。
此外,细胞自噬还参与了细胞生长和发育过程。
在早期胚胎发育中,细胞自噬可以帮助维持胚胎的正常发育,调控细胞的增殖与分化。
细胞自噬的功能异常与多种疾病的发生和发展密切相关。
当细胞自噬过程发生异常,如自噬体形成或融合障碍,细胞内大量的垃圾物质无法被及时降解,会导致异常积累,威胁细胞的健康。
例如,许多神经性疾病如阿尔茨海默病和帕金森病与细胞自噬功能障碍有关。
此外,肿瘤发生和发展中也存在细胞自噬的异常。
细胞自噬可以帮助正常细胞清除癌基因突变和维持基因稳定性,从而起到抑制肿瘤发生的作用。
项目名称:蛋白质主要降解途径-细胞自噬的分子机制及功能首席科学家:刘玉乐清华大学起止年限:2011.1至2015.8依托部门:教育部二、预期目标本项目的总体目标:本项目围绕细胞自噬研究中关键的科学问题细胞自噬的分子机理和功能开展研究,聚焦于哺乳动物全基因组范围细胞自噬新分子的鉴定及功能分析、细胞自噬在动物个体发育中的功能研究,细胞自噬在人类肿瘤和自身免疫中的作用,以及细胞自噬在植物发育、病原-寄主相互作用中的作用,在不同生物模式中系统地开展细胞自噬领域的基础研究,揭示细胞自噬的分子机理和功能,在细胞自噬研究上取得若干突破,产出与我国日益增长的国力相称的重要科学成果,对我国的国民经济发展、人民健康产生积极的推动作用;同时建立和培养一支具有国际领先水平的细胞自噬研究队伍。
五年预期目标:(1)在多种模式生物中鉴定一批新的细胞自噬分子,鉴定其分子结构和功能及其与已知Atg蛋白的相互作用,进一步阐述自噬体膜的来源,以及自噬性溶酶体再生的分子机制,获得一批原创性的成果;(2)在现有的基础上,建立细胞自噬研究的平台技术体系,重点加强以多种模式生物为基础建立细胞自噬分子筛选体系,进一步强化自噬体体外重装的关键技术,并争取实现若干关键技术的自主创新;(3)阐述细胞自噬的异常与发生人类重大疾病的相互关联,针对我国多发的癌症、免疫性疾病种类,寻找一些以细胞自噬为基础的新药物靶标或新的生物标记物,获得一批有自主知识产权的研究成果;(4)通过培养博士后和博士研究生,扶植一批在细胞自噬研究领域具有国际竞争力的优秀中青年科学家,造就一支结构合理、具备攻坚能力的国际先进水平的研究队伍;争取培养国家杰出青年基金获得者2~3,长江学者1~2名。
(5)以研究论文和独立开发的技术成果(专利)的形式公布项目研究成果,五年内争取发表影响因子大于5的SCI刊物上发表学术论文50篇左右,在国际高水平杂志(影响因子大于10)上发表论文4-6篇,力争在国际顶尖杂志Cell, Nature或Science上发表论文,并申报专利3-5项。
自噬的分子机制、调控及其与肾脏病理生理学的关系摘要自噬是细胞自我吞噬的一个过程。
在自噬的过程中一部分的细胞质被一个叫做自噬体的双层膜结构包裹,自噬体成熟后与溶酶体融合并发生降解。
与自噬的核心分子机制相关的是一个特定的家族基因或蛋白,称为Atg,最初这个基因是在酵母中被发现的,现在Atg的同源序列在哺乳动物中也被发现,并且被证明在自噬中起到关键作用。
传统上认为自噬是细胞在应对营养缺乏或者饥饿时所发生的细胞器和大分子物质的回收,以支持自身营养供给。
然而,过去几年的研究表明,自噬是一个细胞在应激条件下的普遍反应。
有趣的是,基于不同的实验条件,特别是不同的应激水平,自噬可以诱导细胞死亡或者作为影响细胞生存的机制。
在本文中,我们将讨论自噬的分子机制、调控以及功能。
此外,我们还分析了,近期关于自噬在肾脏系统及可能相关的肾脏病理生理学中作用的发现。
关键词凋亡自噬相关基因细胞保护作用哺乳动物雷帕霉素靶位磷脂酰肌醇3激酶正常细胞的生长和发育的过程需要一个平衡,以控制大分子物质的生物合成和代谢。
这个平衡通过许多调节机制来实现,这些机制对不同的环境调节作出反应,引发特定的信号,促使系统性的生长和发育反应。
在这个连续的过程中,会产生一些固定的,具有细胞毒性的产物。
适当的、不可逆损伤的蛋白降解对于细胞的生存和功能非常重要。
通常,受损的蛋白会产生异常的分子间作用,并形成聚合物。
当包裹在其他的细胞成分内时,是有细胞毒性的。
在真核细胞中,主要降解蛋白的系统有泛素化蛋白酶体通路和溶酶体系统。
蛋白酶体途径仅限于胞质、核以及参与寿命较短的蛋白的降解。
相反,溶酶体系统由含不同水解酶包括蛋白酶的囊状细胞器降解物质。
通常溶酶体被认为是作用于寿命较长的蛋白的降解的。
自噬是细胞将蛋白之类细胞质内含物运送到溶酶体的主要通道。
自噬研究的进展自噬源于一个希腊的词汇,意思是自我吞噬。
在细胞中有三种类型的自噬:大自噬、小自噬和伴侣介导的自噬。
大自噬始于杯状双层隔离膜的形成(也称为自噬膜或者隔离膜),吞噬一部分细胞质。
细胞自噬的机制与应用随着生物医学研究的深入,细胞自噬作为一种分解和回收物质的重要机制,成为了近年来备受关注的研究热点。
细胞自噬是一种通过细胞自身产生的分解酶来分解和回收细胞内垃圾的过程。
该机制在细胞生存和代谢途径中扮演着重要角色,不仅能够清除陈旧蛋白、损坏细胞器和有毒物质,还能够在缺乏养分的情况下提供细胞内部分解出的营养物质,从而维持机体的稳态和健康。
细胞自噬机制的三个步骤细胞自噬的机制涉及到多种蛋白质和细胞器的作用。
一般来说,细胞自噬的机制可分为三个步骤:自噬体的形成、自噬体与赤道体的连接和自噬体的降解。
这些步骤涉及到多种蛋白质和细胞器的作用,其中最重要的就是自噬体的形成过程。
在细胞内,自噬体的形成是由一系列蛋白质分子的作用而产生的。
当细胞内含有垃圾物质的小囊泡(即自噬前体)与自噬体相关基因(ATG)群蛋白质相互作用时,会引发自噬体形成的过程。
在这个过程中,ATG蛋白质群组织成一个复合物,该复合物在自噬小体形成的过程中,调节相关酶的作用,催化生成ATP酶,使得自噬小体能够适度的自融合和分解,最终产生若干可供细胞代谢使用的分解产物。
细胞自噬的应用细胞自噬的应用可以应用在许多领域,例如药物研究、疾病治疗、营养学等。
自噬系统与许多疾病的关联性越来越明显,该系统在疾病治疗上也有广阔的应用前景。
药物研究自噬对于癌症等疾病的治疗具有重要的作用,因此,自噬在药物研究中也扮演着重要的角色。
许多药物研究的针对对象都是通过抑制自噬来对癌症等疾病进行治疗。
近年来,一些基于自噬的药物研究已经取得了一些初步成果。
疾病治疗除了癌症,自噬还与许多其他疾病的发生和发展密切相关,例如阿尔茨海默病、帕金森病等。
在治疗这些疾病的过程中,通常是通过影响自噬来调节蛋白质、细胞器以及营养等的代谢,从而实现对疾病的治疗。
营养学细胞自噬的另一个应用领域是营养学。
在缺乏养分的情况下,细胞内部分解出的营养物质可供生物维持生命基本需要,从而维持机体的健康。
蛋白质分解途径蛋白质是生物体内重要的有机分子,它们在细胞结构和功能中起着关键作用。
然而,蛋白质不能永久存在,它们会经历一系列的分解途径。
本文将介绍蛋白质分解途径的几个重要过程。
1. 蛋白质降解的起始:泛素化蛋白质的降解通常以泛素化作为起始。
泛素是一种小分子蛋白质,能够与目标蛋白特异性地结合并形成泛素-目标蛋白复合物。
这一过程涉及到泛素激活酶、泛素结合酶和泛素连接酶等多个酶的参与。
2. 蛋白质的泛素降解:泛素-蛋白酶体途径泛素化的蛋白质通常被送往蛋白酶体进行降解。
蛋白酶体是一种细胞内的蛋白质降解系统,它包含有蛋白酶,能够将泛素化的蛋白质降解为小肽或氨基酸。
3. 蛋白质的自噬降解:自噬体途径蛋白质也可以通过自噬体途径进行降解。
自噬是一种细胞内的降解过程,其特点是通过自噬体包裹目标蛋白质,然后将其运送到溶酶体内部进行降解。
自噬体途径在应对细胞应激、维持细胞内营养平衡等方面起着重要作用。
4. 蛋白质的泛素-蛋白酶体途径和自噬途径的调控蛋白质的泛素-蛋白酶体途径和自噬途径的调控非常复杂。
涉及到多个信号通路和调控因子的参与。
例如,磷酸化、泛素连接酶的活性调节以及蛋白酶体和自噬体的融合等都能够影响蛋白质降解的效率和速度。
5. 蛋白质的降解产物利用蛋白质降解产物如小肽和氨基酸可以被细胞进一步利用。
小肽和氨基酸可以通过转运蛋白进入细胞质,参与新蛋白质的合成。
此外,氨基酸还可以通过三羧酸循环进入能量代谢途径,提供能量。
总结:蛋白质分解途径包括泛素-蛋白酶体途径和自噬体途径。
这两个途径通过将蛋白质降解为小肽和氨基酸,维持细胞内蛋白质的动态平衡。
蛋白质降解途径的调控非常复杂,涉及到多个信号通路和调控因子的参与。
蛋白质降解产物可以通过转运蛋白进入细胞质,参与新蛋白质的合成,或者通过三羧酸循环进入能量代谢途径,提供能量。
蛋白质分解途径的研究对于理解细胞代谢和生物学过程具有重要意义。
细胞自噬的分子调节机制研究随着生命科学技术的不断发展,越来越多的生物学家开始关注细胞自噬这个重要的生命过程。
细胞自噬是一种通过溶酶体系统将细胞内的有害物质和垃圾结构进行降解的过程,其中嗜酸性颗粒、三磷酸腺苷(ATP)和 lysosomal蛋白酶等中介物质都发挥着至关重要的作用。
然而,关于细胞自噬的分子调节机制的研究还存在很多未解之谜,本文将重点探讨细胞自噬的分子调节机制研究的最新进展。
一、INITIATION细胞自噬的第一步是初始步骤,包括细胞自噬膜的突起、絮状体的形成和随后的两层膜小泡的形成。
该过程的发生需要细胞内的一些关键分子参与调控。
在这些分子中最重要的是细胞自噬基因(Atg),它是参与自噬生理过程的基因家族,包括Atg13、Atg101、Atg17、Atg29、Atg31、Atg40、Atg11和Atg9等多种主要成分。
最近的研究表明,Atg基因家族的表达水平对细胞自噬的启动非常重要,其中Atg13在细胞自噬的初始步骤中不可或缺。
Atg13能够作为Atg1的激活器,从而引起细胞自噬的启动。
同时,Atg13还能够与另外一些Atg成分,如Atg101等分子发生相互作用,进一步增强细胞自噬启动的效果。
二、PHAGOPHORE ASSEMBLY细胞自噬的第二步是噬菌体形成过程,这一过程也被称为phagophore assembly过程。
在这个过程中,细胞自噬膜的突起和扩张得到了进一步的发展。
这一过程主要涉及到多种Atg成分的相互作用和参与。
其中最重要的是Atg5和Atg12。
Atg5是一个由Atg7和Atg10催化作用形成的调节分子,能够促进Atg12的结合。
Atg12在细胞自噬启动之后会与Atg10发生反应,形成一个结构紧密的共价化合物。
该化合物可以与Atg5结合,形成更加稳定的复合物,并在噬菌体形成过程中发挥着重要的作用。
三、AUTOPHAGOSOME FORMATION细胞自噬的第三步是AUTO-phagosome的形成过程。
973 蛋白质主要降解途径-细胞自噬的分子机制及功能项目名称:蛋白质主要降解途径-细胞自噬的分子机制及功能首席科学家:刘玉乐清华大学起止年限: 2011.1至2015.8依托部门:教育部一、研究内容本项目重点围绕细胞自噬的信号调控和分子机制和细胞自噬在生理活动中的功能及其在人类重大疾病中的作用2个关键科学问题,系统开展以下研究(1)开展细胞自噬的分子细胞生物学机制研究,细胞自噬的细胞生物学模型可以概括为前自噬体的装配、自噬体膜的延伸、自噬体的形成、自噬体同溶酶体的融合、细胞自噬底物的降解以及我们最近发现的自噬溶酶体再生等6个步骤,目前只有32个细胞自噬相关分子被鉴定出来,这些分子主要参与和调控自噬体膜的延伸、自噬体的形成,而细胞自噬的其它步骤的分子机制了解甚少。
我们将在哺乳动物全基因组范围内进行高通量细胞自噬新基因的筛选、研究新细胞自噬蛋白的定位、转运、修饰、同已知细胞自噬功能蛋白的关系等。
重点研究自噬体膜的来源,以及自噬性溶酶体再生的分子机制等细胞自噬领域的关键问题。
(2)开展细胞自噬在动物个体发育中的功能研究,在秀丽线虫中,体细胞中的P颗粒通过细胞自噬作用而被降解。
这一发现为利用正、反向遗传学手段来发现细胞自噬通路中的新组分提供了独特的模式系统。
通过遗传突变可以筛选体细胞中P颗粒不能被降解的突变体并利用图位克隆方法来克隆相关基因,进而综合运用遗传学、细胞生物学和生物化学等研究手段阐明这些新基因在细胞自噬系统中的分子机制以及它们对个体发育的调控机制。
(3)开展细胞自噬在肿瘤和自身免疫病中的作用的研究,对从不同模式生物中筛选出的新的细胞自噬分子,进行人类同源分子的功能分析,利用各种肿瘤细胞系和裸鼠模型,研究新细胞自噬分子与肿瘤细胞生物学行为之间的联系,制备细胞自噬新基因的转基因或基因敲除小鼠,从正反两个方面分析细胞自噬新基因在肿瘤发生发展中的作用以及分子机制;分析细胞自噬分子对淋巴细胞发育、外周淋巴细胞活化、增殖等的影响,以及免疫分子对细胞自噬调节等,了解信号转导通路和分子机制,利用现有的疾病动物模型分析细胞自噬新基因的功能,利用临床标本,检测常见肿瘤和免疫病病人病变部位、外周淋巴细胞以及亚型中细胞自噬新基因的表达,分析其表达水平与病程的相关性,同时筛选细胞自噬新基因的突变体,为细胞自噬分子的疾病关联研究及临床应用提供基础。
从而从动物模型到临床病例,全面阐述人类新细胞自噬分子在肿瘤以及自身免疫中的重要作用,确定潜在药物靶标和新的生物标记物,为进一步的应用研究奠定基础。
(4)开展细胞自噬在植物发育、病原-寄主相互作用中的功能研究,分离鉴定与已知细胞自噬蛋白相互作用的蛋白的基因,研究这些基因如何调控细胞自噬以及它们如何调控植物对病原入侵的反应及植物发育。
二、预期目标本项目的总体目标:本项目围绕细胞自噬研究中关键的科学问题细胞自噬的分子机理和功能开展研究,聚焦于哺乳动物全基因组范围细胞自噬新分子的鉴定及功能分析、细胞自噬在动物个体发育中的功能研究,细胞自噬在人类肿瘤和自身免疫中的作用,以及细胞自噬在植物发育、病原-寄主相互作用中的作用,在不同生物模式中系统地开展细胞自噬领域的基础研究,揭示细胞自噬的分子机理和功能,在细胞自噬研究上取得若干突破,产出与我国日益增长的国力相称的重要科学成果,对我国的国民经济发展、人民健康产生积极的推动作用;同时建立和培养一支具有国际领先水平的细胞自噬研究队伍。
五年预期目标:(1)在多种模式生物中鉴定一批新的细胞自噬分子,鉴定其分子结构和功能及其与已知Atg蛋白的相互作用,进一步阐述自噬体膜的来源,以及自噬性溶酶体再生的分子机制,获得一批原创性的成果;(2)在现有的基础上,建立细胞自噬研究的平台技术体系,重点加强以多种模式生物为基础建立细胞自噬分子筛选体系,进一步强化自噬体体外重装的关键技术,并争取实现若干关键技术的自主创新;(3)阐述细胞自噬的异常与发生人类重大疾病的相互关联,针对我国多发的癌症、免疫性疾病种类,寻找一些以细胞自噬为基础的新药物靶标或新的生物标记物,获得一批有自主知识产权的研究成果;(4)通过培养博士后和博士研究生,扶植一批在细胞自噬研究领域具有国际竞争力的优秀中青年科学家,造就一支结构合理、具备攻坚能力的国际先进水平的研究队伍;争取培养国家杰出青年基金获得者2~3,长江学者1~2名。
(5)以研究论文和独立开发的技术成果(专利)的形式公布项目研究成果,五年内争取发表影响因子大于5的SCI刊物上发表学术论文50篇左右,在国际高水平杂志(影响因子大于10)上发表论文4-6篇,力争在国际顶尖杂志Cell, Nature或Science上发表论文,并申报专利3-5项。
三、研究方案一、学术思路本项目的一个核心思想是根据细胞自噬分子在不同模式生物中的高度同源性,利用各系统分别所具有的优势,运用一系列分子生物学、细胞生物学、遗传学等手段,对新鉴定出的细胞自噬分子进行系统地研究。
并基于多种模式生物建立一定规模的细胞自噬研究的平台,从蛋白质-蛋白质、蛋白质-脂类相互作用、蛋白质定位、转位、运输、蛋白质降解以及细胞自噬膜组成成分的动态变化入手,在分子、细胞以及个体水平等多层次阐明细胞自噬的分子机理和信号调控机制,并在整体水平上阐明这些蛋白在动植物生理活动、重大疾病中的作用,深入探讨潜在的临床应用价值。
可望在细胞自噬研究上取得若干突破,提升我国细胞自噬的水平和国际影响力,使我国该领域在国际上占据重要的地位。
二、技术途径:(1)本研究采取系统筛选和重点研究相结合的方法,在多种系统中筛选鉴定细胞自噬相关蛋白,然后针对个体蛋白进行重点研究;(2)本课题采用多层次、多空间尺度的研究手段,在分子水平上研究蛋白-蛋白相互作用,蛋白-脂类相互作用,在细胞生物学水平上研究蛋白的修饰、定位、降解以及在细胞自噬中的作用。
在个体水平上研究这些蛋白对不同模式生物的发育、重要生理功能的影响以及在重要疾病中的作用(3)本研究采用多系统、多手段综合的方式对主要科学问题进行多层次、多角度的研究,利用线虫、哺乳动物细胞和植物各自具有的优势和特点,对细胞自噬这一在进化上保守的生命活动进行跨系统的综合研究。
(4)本课题将进行遗传学、分子生物学、细胞生物学、生物化学和发育生物学等多学科的交叉,利用突变体库筛选、RNAi文库筛选、蛋白-蛋白相互作用分析,静态、动态显微成像,数学建模等一系列前沿手段,对主要科学问题进行跨学科的深入研究(5)本课题将动态和静态结合,利用活细胞,使用多光子、高分辨、萦光共聚焦显微成像系统等,对蛋白在细胞自噬的细胞生物学过程中的作用进行高时间分辨率的实时动态观察。
利用TIRF、STORM等新兴显微技术对蛋白在自噬体上进行超高空间分辨率的定位,从时空上对目的蛋白在细胞自噬中的作用进行研究(6)离体和在体的结合,利用重组蛋白建立自噬体外重建系统,利用纯化的目的蛋白深入研究其作用机制,并在细胞水平上进行在体实验验证。
三、创新点与特色:(1)细胞自噬新基因的高通量筛选,以及功能研究的技术平台具有一定创新性,筛选方法技术也有显著改良等。
(2)新的具有潜在药物靶标和生物标记物的细胞自噬分子的鉴定,将申请具有自主知识产权的专利。
(3)采用多系统、多手段在不同模式生物对新细胞自噬分子进行跨系统的综合研究,为从蛋白水平、亚细胞和细胞水平、个体水平研究生命活动和规律提供新的思路,有利于揭示自主发现的新型细胞自噬分子在疾病发生、发展过程中的作用及其潜在的临床应用前景,为重大疾病的预测、诊断、治疗,以及农作物产量和品质的提高提供科学依据和新的增长点,形成源头创新和自主知识产权的研究成果,研究内容新颖,意义重大。
(4)该项目整合我国细胞自噬及相关分子细胞学研究领域的优势实验室,联合攻关,较好地体现了多学科的交叉综合研究优势。
四、可行性分析:1. 参加项目的各个课题组,近几年来在细胞自噬新分子的鉴定和功能研究方面积累了丰富的研究经验,并取得了令人瞩目的研究成果。
通过高水平论文的发表,已经获得国内外学术界的承认,知名度甚高。
例如:1)刘玉乐教授在植物细胞自噬研究方面取得了开创性的工作,在国际上首次发现在植物抗病反应中,细胞自噬在限制病原(包括病毒,细菌,真菌)诱导的细胞死亡到病原侵染点起关键作用(Liu et al, Cell, 2005),提出细胞自噬在植物抗病反应中是细胞死亡的负调控因子,是植物面对病原侵染的存活机制,这一工作开创了研究植物抗病和细胞死亡的新方向,多个杂志对该工作发表了专评。
2)俞立教授第一次在分子水平上证明了细胞自噬也可以作为一种细胞死亡机制(Yu et al, Science,2004)并提出了一种细胞自噬性细胞死亡可能的分子机制(Yu et al, PNAS,2006)。
俞立教授还发现并描述了细胞自噬在结束期的细胞生物学过程和分子机制 (Yu et al, Nature, in press)。
3)张宏研究员实验室发现线虫的性别因子(p-granule)在发育中的降解由细胞自噬介导(Zhang et al, Cell, 2009), 并以此为基础利用线虫为模型进行细胞自噬基因的全基因组筛选和部分基因的功能分析(Tian et al, Cell, in press)。
4)杨崇林研究员实验室发现了介导自噬体与溶酶体融合的HOPS复合体在凋亡细胞的清除过程中起着不可或缺的作用(Xiao et al., MBC, 2009),并发现retromer在细胞吞噬中重要作用(Chen et al., Science, 2010).5)谢志平副教授发现了自噬体的大小由Atg8的表达量控制(Xie et al, MBC, 2008)。
6)马大龙教授领导的课题组在人类功能基因组的研究中,建立了人类细胞自噬新分子的细胞芯片筛选平台以及检测系统,鉴定了三个人类细胞自噬相关新分子,分别是TMEM166 (Wang et al, Apoptosis, 2007), TMEM74 (Yu et al, BBRC, 2008), TM9SF1 (He et al, Autophagy, 2009)。
7)课题组主要成员在国际细胞自噬领域内受到认可, 撰写了多篇有影响力的综述如:Xie et al, “Nature cell biology,” Yu L et al, “Autophagy”, Zhang H et al, “Autophagy”)并应邀在该领域内主要会议上做报告( Zhang, 5th international symposium for autophagy,2009; Yu, 5th international symposium for autophagy, 2009, Yu, 2010 Gordon Research Conference)。