各类鉴定试验
糖发酵产酸试验
微生物具有不同的利用各种碳源的能力，其原理在于不同微生物具有不同的酶系。绝大多数细菌都能利用糖类作为碳源，但是它们在分解糖类物质的能力上有很大差异。有些细菌能分解某种糖产生有机酸（如乳酸、醋酸、丙酸等）和气体（如H2、CH4、CO2等），有些细菌只产酸不产气。
溴甲酚紫是一种酸碱指示剂，在中性时为紫色，碱性时为深红色，而在酸性时呈现黄色。微生物在进行碳源代谢时可以产生不同的代谢产物，有些产物为酸性物质。酸性物质的积累有时会超出培养基的缓冲范围，导致pH下降，溴甲酚紫的颜色由紫色转为黄色。在产酸过程中有时会伴随气体的产生，这可以在杜氏管中的气泡反映出来。若碳源代谢的终产物为中性化合物，既无颜色变化也无气体产生，表明此时的代谢较为复杂。
不同细菌分解糖类的能力和代谢产物不同。例如大肠埃希菌能发酵葡萄糖和乳糖；而伤寒沙门菌可发酵葡萄糖，但不能发酵乳糖。即使两种细菌均可发酵同一糖类，其结果也不尽相同，如大肠埃希菌有甲酸脱氢酶，能将葡萄糖发酵生成的甲酸进一步分解为CO2和H2，故产酸并产气；而伤寒沙门菌缺乏该酶，发酵葡萄糖仅产酸不产气。
过氧化氢酶试验
试剂：3%过氧化氢溶液：临用时配制。
试验方法：挑取固体培养基上菌落一接种环，置于洁净试管内，滴加3%过氧化氢溶液2mL，观察结果。结果于半分钟内发生气泡者为阳性，不发生气泡者为阴性。
硝酸盐还原试验
有些细菌具有还原硝酸盐的能力，可将硝酸盐还原为亚硝酸盐、氨或氮气等。亚硝酸盐的存在可用硝酸试剂检验。
试验方法：临试前将试剂的A（磺胺酸冰醋酸溶液）和B（α-萘胺乙醇溶液）试液各0.2ml 等量混合、取混合试剂约0.1ml、加于液体培养物或琼脂斜面培养物表面，立即或于10min 内呈现红色即为试验阳性，若无红色出现则为阴性。用α-萘胺进行试验时，阳性红色消退很快、故加入后应立即判定结果。进行试验时必须有未接种的培养基管作为阴性对照。α-萘胺具有致癌性、故使用时应加注意。
产生吲哚试验
有些细菌如大肠埃希菌、变形杆菌、霍乱弧菌等能分解培养基中的色氨酸生成吲哚（靛基质），经与试剂中的对二甲基氨基苯甲醛作用，生成玫瑰吲哚而呈红色，是为吲哚试验阳性。
明胶液化试验
有些细菌具有明胶酶（亦称类蛋白水解酶），能将明胶先水解为多肽，又进一步水解为氨基酸，失去凝胶性质而液化。
试验方法：挑取18~24h待试菌培养物，以较大量穿刺接种于明胶高层约2/3深度或点种于平板培养基。于20~22℃培养7~14天。明胶高层亦可培养于36±1℃。每天观察其结果，若因培养温度高而使明胶本身液化时应不加摇动、静置冰箱中待其凝固后、再观察其是否被细菌液化，如确被液化，即为试验阳性。平板试验结果的观察为在培养基平板点种的菌落上滴加试剂，若为阳性，10~20min后，菌落周围应出现清晰带环。否则为阴性。
硫化氢试验
测定微生物自含硫氨基酸或无机硫化物等受质中产生硫化氢的能力。
实验原理：微生物产生硫化氢之酦酵途径，主要有两种。
途径一：硫化氢由培养基中蛋白质成份之半胱氨酸还原而产生。蛋白质经微生物酵素分解，形成含硫之半胱氨酸，此氨基酸经半胱氨酸脱硫酵素作用失去硫原子，而自水分子加入氢形成硫化氢。
途径二：硫化氢由无机硫化合物如硫代硫酸盐（S2O32-）、硫酸盐（SO42-）或亚硫酸盐（SO32-）等所产生，当培养基含硫代硫酸钠时，有些微生物可将其还原为亚硫酸盐，并释出硫化氢。本实验使用SIM培养基，内含蛋白质与硫代硫酸钠作为硫受质，另含硫酸铵亚铁（Fe(NH4)2SO4）作为硫化氢指示剂（硫化氢为无色气体，不易察觉，硫酸铵亚铁之亚铁离子可与硫化氢反应生成不溶性黑色沉淀硫化亚铁）培养基含0.3%琼脂使其成半固体状，以增强厌氧呼吸，亦可观察微生物的运动性，如具运动性，则微生物生长沿接种线向四周扩散，使培养基呈混浊；如无运动力，则生长仅限于接种线。
实验材料：
菌种：Escherichia coli , Enterobacter aerogenes , Proteus vulgaris
培养基：SIM agar deep tube三支
器材：酒精灯、接种针
试验步骤：
将每支SIM agar deep tube分别标示接种菌及组别。以无菌操作将各菌分别穿刺接种至培养基中。将所有试管置于37℃下培养24-48小时。
结果分析：
检视所有SIM培养基，观察接种线有无黑色产生，将结果记录于表格中。依观察所见，判断各菌是否具有产生硫化氢的能力。观察微生物是否沿接种线向四周扩散，并判断其是否具运动性。
