附录1常用基本词汇表

附录1 常用基本词汇表

英文名词中文名词解释

A（Adenine）腺嘌呤作为碱基的两种嘌呤中的一种。

active site活化位点蛋白质三维表面催化作用发生的区域。

alignment比对为了确定两个同源核酸或蛋白质序列的累计差

异而进行的配对称为比对。

alignment of alignments比对的比对即比对的对象不是简单的序列，而是序列的比

对。

alleles等位基因一个基因的不同版本。

alpha carbonα碳在氨基酸中与侧链（R-基团）相连的中心碳原子。

alternative splicing可变剪接从一个单独的hnRNA生成两个或多个mRNA

分子的过程。

amino terminus (N-terminal)氨基端（N端）在一个多肽中，具有自由氨基的分子端，对应

于基因的5’-端。

anti-parallel反向平行表示相反的方向；在双链DNA中，这意味着如果

一条链是5' 到3'的，则其互补链方向是3' 到

5'的。

backbone (of an amino

acid)

（氨基酸的）骨架包含一个氨基，一个α碳和一个羧酸或羧基。base pair 碱基对（1）在双链DNA中嘌呤和嘧啶之间的相互作用

（特别指A和T之间，G和C之间）；（2）双链

DNA序列长度的基本单位。

beta turnsβ转角在反向平行的β折叠片中，当β链反转方向的时

候蛋白质内部形成的U型结构。

Bioinformatics 生物信息学应用信息科学的理论、方法和技术，管理、分析

和利用生物分子数据。

Biocomputing生物计算本书中特指用计算机技术分析和处理生物分子

数据。

Basic Local Alignment Search Tool ( Blast) 基本的局部比对搜索工具

（Blast）

一种常用的序列数据库搜索工具。

blotting and hybridization印迹和杂交将分子（通常是核酸分子）从凝胶转移到膜上，

接着用绑定有特定感兴趣的分子的标记探针进

行洗脱的过程。

bootstrap test自举检验对置信程度进行量化的检验。

branch and bound method分支约束法一种空间搜索方法，通过约束条件减少搜索空间，

提高搜索效率。

branches 分支在系统发生树中，通过分支连接两个节点。

C (Cytosine)胞嘧啶作为碱基的两种嘧啶中的一种。

CAAT box CAAT盒大多数真核启动子具有的一段短序列，其片段模式

为C-A-A-T，通常出现在转录起始位点上游80

个核苷酸的地方。许多因子可以与CAAT盒结合。

carboxy terminus羧基端在多肽链中，含有羧酸基团(—COOH)的分子端，

对应于基因的3'-端。

cDNA Complementary

DNA

cDNA 互补DNA通过逆转录酶从RNA模板合成的DNA。

cDNA library cDNA文库从mRNA序列中产生的所有DNA序列的集合。

这种类型的文库只包含编码蛋白质的DNA（基

因）。

central dogma 中心法则从基因的核酸序列中提取信息并以此合成蛋白质

的过程（DNA→RNA→ protein）。

character 特征在系统发生树中，具有有限状态数的特征。charged amino acid 带电氨基酸在一定的生物pH值下，带有正电或负电的氨基

酸。

chromatin 染色质在真核生物细胞核内部由大量DNA以及与此相

关的组蛋白组成的近似均匀混合物。chromosome 染色体在原核生物，包含一个细胞基因组的DNA分子称

为染色体。在真核生物中，与蛋白质复合在一起、

包含大量遗传信息的线型DNA分子。

clone 克隆无性繁殖，如生物体克隆、基因克隆等。

cloning 克隆在类染色体载体中插入特定的DNA一段，使得它

们可以在活细胞中得以保存并复制。

coding sequence 编码序列DNA序列中为蛋白质编码的部分。

codon 密码子基因编码部分的三核苷酸组合，对应于一个特定的

氨基酸。

Complementary 互补的（1）通过氢键连接的核苷酸对（G 和C; A 和T;

A 和U）；（2）核苷酸链的反向平行对。

Computational Molecular Biology 计算分子生物学主要研究分子生物学数据的分析方法，开发分析

工具。

conformation 构象蛋白质的空间构象。

consensus sequence一致序列在两个或多个同源序列的每一个位置上多数出

现的核苷酸或氨基酸组成的序列。

conserved sequence 保守序列在进化过程中基本保持不变得核酸与蛋白质序

列，它们往往与特定得功能相对应。

contig 连续交叠群基因组测序过程中将许多短的序列片段链接成很

长的连续片段。

convergent evolution 趋同进化指相似基因型或表型性状的独立进化。例如，眼

睛在各种生物体（如哺乳动物、软体动物以及昆

虫）中独立进化，结构各异。

CpG island CpG岛在哺乳类动物基因组中的一个500bp到3000bp

的区域，该区域中的二核苷酸CpG的含量比其他

区域的正常水平要高。通常，与此相关的是真核

生物管家基因的启动子区域。

crystal 晶体由分子的规则排列组成的固体结构。

degeneracy 简并性指某些氨基酸可以被一个以上的三联密码子编

码的特性。