山东师范大学生科院分子生物学重点知识点
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名词解释
核酶
一类具有催化活性的RNA 分子,通过催化靶位点RNA链中磷酸二酯键的
断裂,特异性的剪切底物RNA 分子,从而阻断基因的表达。P472
DNA呼吸
DNA配对碱基之间的氢键迅速断裂和再生的过程。
拓扑异构酶
所有的DNA超螺旋都是由DNA拓扑异构酶产生的。DNA拓扑异构酶催化
反应的本质是先切断DNA的磷酸二酯键,改变DNA的链环数之后再连接
之。DNA拓扑异构酶兼具DNA内切酶和DNA连接酶的功能。
手脚架
大肠杆菌染色体是由4.2 106碱基对组成的双链环状DNA分子,在DNA
结合蛋白质的作用下压缩成一个手脚架形(scaffold)结构,形成100个
左右的小区(domain),小区内都是负超螺旋。
操作子/操纵元operon
原核生物中由一个或多个相关基因以及转录翻译调控元件组成的基因表
达单元。(乳糖操纵元pozya,p启动子;o操纵基因;zya结构基因)
基因家族gene family
在基因组进化中,一个基因通过基因重复产生了两个或多个拷贝,这些
基因即构成一个基因家族,是具有显著相似性的一组基因,编码相似的
蛋白质产物。真核细胞中许多相关的基因常按功能成套组合。
(来源相同,结构相似,功能相关)
基因簇
同一家族的基因成员有时紧密的排列在一起,成为一个基因簇。
假基因
来源于功能基因,但是已丧失活性的DNA序列。可能原因:重复加工残
缺出现了终止密码子。
转座子(transposon 或transposable element)
转座子是基因组内相对独立的、可移动序列,它们不必借用噬菌体或质
粒的形式就可以从基因组的一个部位直接转移到另一个部位。
D环复制滚环复制
在一定时期内DNA只复制一条链的情况。
例如线粒体的D-环复制和一些噬菌体的滚环复制方式。
冈崎片段
在DNA半不连续复制中产生的长度为1000~2000个碱基的短的DNA片段,
能被连接成为一条完整的DNA链。
引发体primosome
DNAF复制过程中引发合成每个冈崎片段时所需要的多蛋白复合物,包括
预引发蛋白、具有ATP酶活性的蛋白质以及引物酶。
引发体与DNA结合后由引物酶合成RNA引物并合成与RNA引物连接的冈
崎片段。引发体延不连续合成的DNA链移动,其移动的方向与DNA及
RNA合成的方向相反。引发体移动需要来自ATP水解酶的能量。
复制体replisome
由聚合酶Ⅲ、引发体、螺旋酶等构成的蛋白质复合体,使DNA前导链和
滞后链得以同时复制。
启动子promoter
DNA分子上被RNA聚合酶识别并结合形成转录起始复合物的一个区域,如
果没有启动子,基因是不能够转录的。
RNA剪接RNA splicing
从mRNA前体中切除被称为内含子的非编码区,并使被称为外显子的编
码区拼接形成成熟的mRNA的过程
可变剪接/选择性剪接alternative splicing
用不同的剪接方式(选择不同的剪切位点组合),从同一个mRNA前体产
生不同的mRNA剪接异构体的过程。
核内不均一RNA heterogeneous nuclear RNA, hnRNA
细胞核中有一类RNA,十分不稳定,平均长度比mRNA要长,序列的复
杂程度非常高,称为核内不均一RNA
hnRNP 核糖核蛋白颗粒
核内不均一RNA以与蛋白质结合的状态存在,形成hnRNP(核糖核蛋白
颗粒)
转酯反应(transesterification)
剪接过程中的反应为转酯反应,即酯键由一个位置转移到另一个位置。
转酯反应只是磷酸酯键的直接转移,没有水解反应的出现,不需要外部
的能量,不需要供能物质如ATP或GTP的参与。
剪接体Splicesome
在剪接过程中形成的剪接复合物称为剪接体,剪接体的主要组成是蛋白
质和小分子的核RNA
摇摆假说wobble hypothesis 摆动假说
密码子的前两位碱基在和反密码子配对时遵循碱基互补配对原则,而第
三位碱基则有一定的灵活性。
氨酰tRNA合成酶(aaRS)
一类催化氨基酸与tRNA结合的特异性酶。可识别一个特定的氨基酸和与
此氨基酸对应的TRNA的特定部位。
SD序列Shine-Dalgarno sequence
原核生物30S小亚基能够识别mRNA编码区上游的一段核糖体结合位点
叫做Shine-Dalgarno序列,SD序列
信号肽signal peptidase
一段疏水氨基酸,常位于膜蛋白N端,它负责把蛋白质引导到细胞含膜
结构的亚细胞器内。
弱化子attenuator
原核生物操纵子中能显着减弱甚至终止转录作用的一段核苷酸序列,该
区域能形成不同的二级结构,利用原核微生物转录与翻译的偶联机制对
转录进行调节。
弱化作用
由于基因内部弱化子形成不同的二级结构,提前终止转录而抑制基因表
达。
DNA结合基序DNA-binding motif
转录因子上的一小段与DNA结合的蛋白,具一定的结构。
锌指结构(zinc finger)
锌指基序是由保守氨基酸的小基团与锌离子结合形成类似手指状的DNA
结构域。
螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix, HLH)
与DNA结合的二聚体蛋白结构,含两个既亲水又亲脂的α- 螺旋,两个
α-螺旋被不同长度的环分开。
亮氨酸拉链(leucine zipper)
一个富含亮氨酸残基的结构域,参与形成二聚体。二聚体形成本身作为
蛋白质识别特异DNA序列的一般规则出现。
螺旋/转角/螺旋(Helix-turn-helix,HTH)基序
两段螺旋被一短的转角结构分开,其中一段螺旋为DNA识别螺旋
同源异型框简称同源框,即homeobox,
是同源异型基因中一段高度保守的DNA序列,主要是跟发育调控有关的