徐元宏感染性疾病早期实验室诊断

脓毒症早期预警生物标志物的研究进展许程(综述);徐元宏(审校)【摘要】脓毒症是指由感染引起的全身炎症反应综合征（SIRS），临床上证实有细菌存在或有高度可疑感染灶。

近期关于脓毒症早期诊断的研究备受关注。

文章结合脓毒症的发病机制阐述细胞因子、降钙素原（PCT）、内毒素、高敏 C 反应蛋白（hs－CRP）、血清淀粉样蛋白A（SAA）、肝素结合蛋白（HBP）、（1，3）β－D 葡聚糖（BG）及半乳甘露聚糖（GM）等标志物诊断早期脓毒症、评估疾病严重程度及判断预后的研究进展，为脓毒症早期诊断和治疗提供新的思路。

%Sepsis is a kind of systemic inflammatory response syndromes (SIRS) induced by infection, which has been clinically confirmed the presence of bacteria or highly suspicious infections.More and more researchers have paid attention to the early diagnosis of sepsis recently.This review has focused on the capabilities of cytokine, procalcitonin (PCT), endotoxin,high-sensitivity C reactive protein(hs-CRP), serum amyloid protein A( SAA), heparin-binding protein(HBP), (1,3)-beta-D-glucan(BG) and galactomannan(GM) to diagnose sepsis early and assess the severity and prognosis, in order to provide new thoughts for the early diagnosis and treatment of sepsis.【期刊名称】《检验医学》【年(卷),期】2015(000)005【总页数】4页(P533-536)【关键词】脓毒症;细胞因子;降钙素原;内毒素;高敏 C 反应蛋白;血清淀粉样蛋白 A;肝素结合蛋白;(1,3)β-D 葡聚糖;半乳甘露聚糖【作者】许程(综述);徐元宏(审校)【作者单位】安徽医科大学第一附属医院检验科，安徽合肥 230022;安徽医科大学第一附属医院检验科，安徽合肥 230022【正文语种】中文【中图分类】R446.5脓毒症是指由感染引起的全身炎症反应综合征(systemic inflammatory response syndrome，SIRS)，临床上证实有细菌存在或有高度可疑感染灶。

感染性疾病的早期诊断方法课题申报：感染性疾病的早期诊断方法摘要：感染性疾病是威胁人类健康的重要因素之一。

早期诊断是感染性疾病有效控制的关键步骤，对于减少疾病传播、提高治疗效果、降低疾病死亡率具有重要意义。

本课题旨在探索感染性疾病早期诊断方法，提高感染性疾病的防控水平。

通过综合运用现代生物技术手段，结合临床诊疗实际，寻找适用于早期感染性疾病诊断的新型生物标志物及相应检测技术，为感染性疾病的早期诊断提供科学依据。

一、研究背景及意义：感染性疾病是指由各种病原微生物感染引起的疾病，如细菌性感染、病毒感染、真菌感染等。

世界卫生组织数据显示，每年全球约有数百万人因感染性疾病而死亡，给人类的生命安全造成了严重威胁。

感染性疾病的早期诊断对于及时采取有效的治疗措施、阻断传播链条具有重要意义。

然而，由于感染性疾病表现复杂多样，临床症状不一，传统的病原学检测方法存在诊断时间长、敏感性低等问题，导致延误诊断，影响治疗效果。

二、研究目标：该课题旨在探索感染性疾病的早期诊断方法，提高感染性疾病的防控水平，具体目标包括：1. 系统调研：对目前感染性疾病的检测手段、技术及流程进行广泛调研，了解技术的发展趋势和研究热点。

2. 生物标志物的筛选与验证：通过基因组学、蛋白组学等技术手段，筛选和鉴定适用于感染性疾病早期诊断的生物标志物，并进行临床样本验证。

3. 早期诊断技术的建立：基于生物标志物的筛选结果，开发相应的检测技术，建立早期感染性疾病的诊断方法，并进行准确性和可行性的验证。

4. 临床验证与应用：在一定的临床样本中进行验证与应用，评估该方法的敏感性、特异性和临床实用性。

5. 剖析机制：通过实验室模型的建立，剖析早期感染性疾病发生、发展等机制，为手段的改进提供科学依据。

三、研究内容与方法：1. 系统调研阶段：通过文献查阅、实地考察和专家访谈等方式，了解当前感染性疾病诊断方法、存在问题及前沿技术，并分析总结，确定研究方向和目标。

2. 生物标志物筛选与验证阶段：采用基因组学、蛋白组学等方法，对感染性疾病的潜在生物标志物进行筛选和鉴定，并通过临床样本验证其可行性和准确性。

tNGS技术在基层医院感染早期精准诊断中的重要性
方超
【期刊名称】《当代医药论丛》
【年(卷),期】2024(22)8
【摘要】目的:在基层医院感染中进行tNGS检测对早期精准诊断的重要性。

方法:选取宏基因组下一代测序(mNGS)检测的肺泡灌洗液标本的检测结果,做好实验室检测结果、临床症状以及影像学检查结果分析,并做好结果比较。

结果:共有11例患者进行了手术治疗,2例患者进行了经支气管镜肺组织活检术(TBLB),3例患者进行了经皮肺穿刺活检术;10例患者的组织病理学诊断结果为肿瘤。

根据组织病理学检查结果,所有患者均未出现医院死亡。

结论:早期进行tNGS检测,能够有效提升诊断准确性,整体效果良好。

【总页数】3页(P70-72)
【作者】方超
【作者单位】江油市人民医院呼吸内科
【正文语种】中文
【中图分类】R446
【相关文献】
1.全球首发“基因＋荧光”精准猎杀癌细胞：癌症早期诊断与个体化医疗新技术研讨会暨2010纳奥生物产品发布会在杭州召开
2.降钙素原在心脏术后患者早期医院感染诊断中的价值
3.中性粒细胞在医院感染性新生儿败血症早期诊断中的价值
4.
内镜NBI技术对早期食管癌诊断精准度的影响5.规范合理使用分子生物学检测技术以早期精准诊断结核病
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感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南前言感染性疾病是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病，快速、准确的诊断是有效治疗、病情监测和控制疾病蔓延的重要前提。

随着分子检测技术的不断发展和完善，分子检测在病原微生物感染诊断及治疗监测上的临床应用日益广泛，已成为一些重要的感染性疾病的诊断和疗效评价中不可缺少的重要工具。

为使我国的感染性疾病分子检测临床应用健康有序发展，更好的为医患提供高质量的服务，有必要制订感染性疾病相关的分子检测技术指南，规范临床实验室相关分子检测操作程序，指导从事感染性疾病分子诊断的医务人员正确开展工作。

本指南以大量、丰富的临床实践为基础，同时消化吸取了大量国内外文献的精华，广泛征求相关学科专家的意见，遵循科学性、实用性、可行性的原则，反复修改而成。

我们衷心希望《感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南》能够对广大检验人员起到很好的帮助和指导作用，从而为提高感染性疾病临床诊治水平发挥积极的作用本指南起草单位：中国医科大学附属第一医院、国家卫生计生委临床检验中心本指南起草人：尚红、李金明、郭晓临、代娣、程仕彤目录1. 本指南适用范围 (3)2. 标准术语 (3)3. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测概述 (9)4. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析前质量控制 (12)4.1 标本采集 (13)4.2 标本的转运 (16)4.3 标本的接收 (17)4.4 标本的保存 (18)4.5 检验项目的选择 (19)5. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析中质量控制 (20)5.1 实验室的设计要求 (20)5.2常用的分子检测方法 (21)5.3 试剂和方法的选择 (29)5.4 设备维护和校准 (36)5.5 人员培训 (36)5.6 试剂性能验证 (37)6. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测分析后质量控制 (40)6.1 结果报告 (40)6.2 结果的解释及医患的沟通 (41)6.3 检测后标本的保存及处理 (42)7. 质量保证 (42)7.1 标准操作程序 (42)7.2 质控品 (42)7.3 室内质量控制 (43)7.4 室间质量评价 (47)8. 感染性疾病相关的个体化医学分子检测应用 (48)8.1 乙型肝炎病毒感染诊疗的个体化分子检测 (48)8.2 丙型肝炎病毒感染诊疗的个体化分子检测 (52)8.3 结核分枝杆菌感染诊疗的个体化分子检测 (56)8.4 人获得性免疫缺陷病毒感染诊疗的个体化分子检测 (57)附录 (65)参考文献 (66)1.本指南适用范围本指南由国家卫生计生委个体化医学检测技术专家委员会编订，是国家卫生计生委个体化医学检测技术系列指南之一，旨为临床实验室进行感染性疾病相关的个体化医学分子检测提供参考和指导。

实验室诊断技术在感染病诊治中的应用随着生命科学的飞速发展，实验室诊断技术在临床病诊治中得到了广泛的应用。

其中，感染病诊治是实验室诊断技术应用的重要领域之一。

实验室诊断技术能够从微观的角度对感染源进行判断，确定感染的致病菌，以及菌株的药敏性等信息，为感染病的诊治提供重要依据。

本文将从实验室诊断技术的原理、方法、优势等多个角度来阐述实验室诊断技术在感染病诊治中的应用。

实验室诊断技术的原理实验室诊断技术主要是利用微生物学、免疫学、生物化学、分子生物学等学科的知识和技术，通过扩增、检测致病微生物DNA 等手段，从感染源、病原体等微观层面利用专业设备和试剂迅速准确地检测出病原体及其相关信息，从而为医生的临床诊治提供了重要的依据。

实验室诊断技术的方法实验室诊断技术包括微生物学检测、免疫学检测、生物化学检测、分子生物学检测等多种检测方法。

其特点是快速准确、结果稳定、专业性强、对不同类型的感染病都有很好的适用性，可以提高感染病的诊断率和治疗效果。

微生物学检测是最常用的实验室检测方法之一。

它包括细菌、真菌、病毒等病原体的检测，主要应用于血液、尿液、各种体液等样本的检测。

其优点是能够快速地获得诊断结果，对抗生素治疗的指导有很大的帮助。

免疫学检测主要是通过检测机体内的抗体、抗原等免疫物质来对感染病的诊断和治疗提供帮助。

这种方法的优势是检测操作简单、快速、灵敏，而且适用于大批量样品检测。

生物化学检测主要是对感染病病原体内部代谢产物、细胞壁等分子结构进行检测，通过检测致病物质的分泌产物来确定病原体，从而为感染病的治疗提供重要依据。

分子生物学技术指通过扩增、检测细胞核酸来对感染病进行精准的诊断、治疗指导。

是目前最为先进、灵敏和特异的检测方法之一，可最大限度提高病原体的检测水平，从而提高了感染病的诊断准确度。

实验室诊断技术的优势实验室诊断技术在感染病诊治中的应用的优势主要体现在以下四个方面：一是提高了感染病的诊断准确度。

其快速检测和准确性，可以对感染病的抗生素使用提供有益的支持，提高感染病的治疗效果。

分子诊断技术在感染性疾病诊断中的应用研究方案：分子诊断技术在感染性疾病诊断中的应用一、研究目的与背景感染性疾病是临床上常见的疾病之一，它的早期准确诊断对于治疗和预后至关重要。

目前传统的诊断方法存在时间较长、特异性较差等缺点，无法满足对感染性疾病快速准确诊断的需求。

分子诊断技术应运而生，并被广泛应用于感染性疾病的诊断中，具有高灵敏度和高特异性的优势。

本研究旨在进一步探讨分子诊断技术在感染性疾病中的应用，并提出新的观点和方法，为解决实际问题提供有价值的参考。

二、研究方法1.实验设计本研究采用前瞻性观察设计，共招募X名感染性疾病患者和X名非感染性疾病患者作为对照组。

在患者入组后，采集其血液和其他相关样本，进行分子诊断技术的检测，并与传统的诊断方法进行对比。

2.采集样本2.1 血液样本：每例患者采集X ml抗凝血液样本，其中X ml用于传统的检测方法，X ml用于分子诊断技术的检测。

2.2 其他相关样本：根据疾病特点，采集适当的其他相关样本，如尿液、唾液或者呼吸道分泌物等，用于分子诊断技术的检测。

3.分子诊断技术检测3.1 核酸提取：将采集到的样本进行离心分离，分离出核酸。

3.2 PCR扩增：采用特异性引物和逆向转录酶，对核酸进行PCR扩增。

3.3 实时荧光定量PCR：将扩增产物与特异性探针结合，进行实时荧光定量PCR检测。

3.4 基因芯片：将样本中的核酸转录为亮点，通过基因芯片检测亮点的信号强度和分布来进行分子诊断。

4.数据采集与分析4.1 观察指标：观察指标主要包括分子诊断技术的准确性、灵敏度、特异度和重复性等。

4.2 数据采集：根据实验设计采集患者的临床信息、实验结果等数据，并将其录入电子表格。

4.3 数据分析：采用统计学方法对数据进行描述性统计和比较分析，如计算灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值等。

三、数据整理与分析1.整理数据1.1 检查测定数据：将分子诊断技术的检测结果根据不同疾病分类整理，并计算其准确性、灵敏度和特异度。

宏基因二代测序技术在感染性疾病诊断中的前沿应用随着二代测序技术的快速发展，宏基因组测序逐渐成为研究微生物群落结构和功能的重要工具。

在感染性疾病的诊断中，宏基因组测序技术具有独特的优势，能够提供丰富的信息，包括病原微生物的种类、数量、功能和耐药性等。

下面将从感染性疾病的诊断、监测和个体化治疗等方面介绍宏基因组测序技术在感染性疾病中的前沿应用。

一、感染性疾病的诊断1. 病原体鉴定和丰度分析：宏基因组测序技术能够在短时间内检测到病原微生物并确定其丰度，包括细菌、病毒、真菌和寄生虫等。

通过高通量测序分析样本中的16S rRNA基因、ITS区序列或全基因组数据，可以获得微生物群落的组成信息，为感染性疾病的诊断提供精确的依据。

2. 新型病原体的发现：宏基因组测序技术的高灵敏性和高通量性能可以帮助科学家快速发现和鉴定新型病原体。

研究人员可以通过对未知病原微生物基因组的整体测序和比对分析，推进病原体识别的精准性和速度，为传染病的控制和治疗提供有效的手段。

二、感染性疾病的监测1. 疫苗安全和有效性评估：宏基因组测序技术可以对疫苗接种后人群的微生物群落进行监测，评估疫苗的安全性和有效性。

通过比对疫苗接种前后的微生物组成差异，研究人员可以评估疫苗对微生物群落结构和功能的影响，为疫苗的改进提供理论支持。

2. 疫情监测和溯源研究：宏基因组测序技术可以用于疫情监测和溯源研究，追踪传染病的来源和传播途径。

通过对感染源、患者和环境中微生物群落的比对分析，可以追踪和确定疫情的来源，为疾病的控制和防范提供科学依据。

三、感染性疾病的个体化治疗宏基因组测序技术可以为感染性疾病的个体化治疗提供重要依据。

个体化治疗主要包括病原微生物的耐药性检测和药物选择、微生物组转录组和代谢组等功能分析。

1. 病原微生物的耐药性检测和药物选择：通过宏基因组测序技术，可以快速鉴定病原微生物的耐药基因和突变位点，为临床医生选择合适的抗生素和药物提供指导。

2. 微生物组转录组和代谢组等功能分析：通过宏基因组测序技术，可以获得微生物群落的转录组、代谢组等功能信息，进一步了解微生物的致病机制和代谢特征，为精准治疗和药物开发提供理论依据。

血液细菌感染中全程CRP、WBC、ANC联合检测分析聂丽华【摘要】目的分析在血液细菌感染中应用全程CRP、WBC以及ANC联合检测的应用价值.方法选取40例健康体检者为对照组,以血液细菌培养阳性患者40例为研究组1,以血液细菌培养阴性且发热患者40例为研究组2,检测三组患者的CRP、WBC、ANC水平.结果细菌主要包括金黄色葡萄球菌、粪肠球菌、大肠埃希氏菌、白色念珠菌、凝固酶阴性葡萄球菌、棒状杆菌等,其中以金黄色葡萄球菌为主,其次为凝固酶阴性葡萄球菌,研究组1的CRP、WBC、ANC指标结果均比研究组2、对照组的结果高,差异有统计学意义(P<0.05).结论全程CRP、WBC、ANC联合检测对诊断患者是否患有血液细菌感染具有重要的诊断价值.【期刊名称】《中国卫生标准管理》【年(卷),期】2018(009)004【总页数】3页(P104-106)【关键词】超敏C反应蛋白;白细胞;中性粒细胞绝对值;血液细菌感染【作者】聂丽华【作者单位】福建省汀州医院检验科,福建汀州 366300【正文语种】中文【中图分类】R446血液细菌感染是指入侵到血液循环中的致病菌通过生长繁殖产生毒素以及相关的代谢产物，进而引起急性全身性感染[1]。

血液细菌感染患者具有较高的死亡率，严重威胁患者的生命安全。

在临床实验室的诊断中，传统细菌培养是主要的诊断依据，但是传统细菌培养的报告时间相对较长，且阳性率低，影响临床患者病情的诊断[2]。

临床发现超敏C反应蛋白（全程CRP）、白细胞（WBC）、中性粒细胞绝对值（ANC）联合检测血液细菌感染，具有较高的诊断价值，现将结果总结如下。

1 资料与方法1.1 标本来源研究选取2015年1月—2017年1月我院临床科室住院患者的血培养结果。

根据培养结果分为2组，分别为研究组1、研究组2，研究组1（血液细菌培养阳性患者）：40例，男性27例，女性13例，平均年龄（41.53±6.12）岁，所有患者无外科手术患者，无肿瘤、血液病等疾病患者；研究组2（血液细菌培养阴性且发热患者）：40例，男性29例，女性11例，平均年龄（41.48±6.07）岁，患者临床体温检测均高于38.5℃，选取同期体检健康的40例患者作为对照组，男性25例，女性15例，平均年龄（41.51±6.09）岁，上述患者的WBC计数均在（3.50～9.50）×109/L内，且无肝功能异常患者。

病原宏dna流程检测结果阳性第一章：引言随着现代医学技术的发展，病原宏DNA检测已成为微生物学、生态学、医学和环境科学领域的重要研究手段。

病原宏DNA检测可以检测种群内的微生物群落结构及其遗传多样性，为疾病防控、环境污染监测、生态系统功能研究等提供了有效的工具。

本文将以一例病原宏DNA流程检测结果为例，详细描述其检测过程及阳性检测结果。

第二章：材料和方法2.1 样本搜集本次检测样本为来自患者血液样本，患者年龄为40岁，患有不明原因发热症状。

患者病史中未发现明显的其他疾病史，因此怀疑可能为病原微生物感染导致的发热。

为了确定患者是否存在病原微生物感染，对其血液样本进行病原宏DNA检测。

2.2 DNA提取从患者采集的血液样本中提取DNA，随后进行质量检测和纯度评估。

2.3 病原宏DNA测序提取的DNA样本进行病原宏DNA测序，使用Illumina MiSeq平台进行高通量测序，得到原始测序数据。

2.4 数据分析使用专业的生物信息学软件对原始测序数据进行分析，包括序列质控、序列比对、微生物分类以及功能注释分析等步骤。

第三章：结果3.1 数据分析结果经过数据分析，发现患者血液样本中存在大量的病原微生物群落，包括细菌、病毒、真菌等。

其中，细菌属于革兰氏阴性菌，而病毒属于RNA病毒。

这些微生物的存在可能与患者发热症状密切相关。

3.2 病原微生物群落结构分析通过分析病原微生物群落结构，发现细菌属于肠道菌群中的某些种类，可能源自于体内的肠道菌群。

而病毒则可能是由外界环境或其他人群传播而来。

3.3 抗菌药敏试验通过对细菌的抗菌药敏试验发现，该细菌对多种抗生素呈现耐药性，对治疗极为不利。

第四章：讨论通过病原宏DNA检测，我们发现患者血液样本中存在大量的病原微生物群落，包括细菌和病毒。

这些微生物的存在可能是导致患者发热症状的原因。

细菌的耐药性也对治疗带来了一定的困难。

因此，在治疗过程中需要针对性地选择抗生素，并严密监测病情的变化。