分子生物学复习题
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一、名词解释(每题5分)
C – value :C-value :每种生物的单倍体基因组的DNA总量总是恒定的,所以称生物单倍体基因组中的DNA含量为C-值(C- value is the quantity of DNA in the genome (per haploid set of chromosomes.)。
C值悖论(C-value paradox):生物体形态学的复杂程度与C-值大小的不一致称为C-value paradox。
overlapping gene:重叠基因(overlapping gene):是指两个或两个以上的基因共有一段DNA序列或称嵌套基因nested gene
顺反子就是一段核苷酸序列,能编码一条完整的多肽链。这种多肽链既可以是一种具有生物活性的蛋白质,又可以与其他多肽链聚合形成复杂的蛋白质。
interrupted gene:这种不连续的基因又称断裂基因或割裂基因(split gene)。指基因的编码序列在DNA分子上不连续排列,而被不编码的序列所隔开.
RNA editing: 基因转录产生的mRNA分子中,由于核苷酸的缺失,插入或置换,基因转录物的序列不与基因编码序列互补,使翻译生成的蛋白质的氨基酸组成,不同于基因序列中的编码信息,这种现象称为RNA编辑
RNA processing:初级转录物转变为成熟的RNA的过程。如通过剪接切除内含子,信使核糖核酸(mRNA)的5′加帽、3′加尾,tRNA 3′接CCA,以及许多修饰过程
Replicon: 作为含有一个复制起始点的独立复制单元的一个完整DNA分子或DNA分子上的某段区域。质粒、细菌染色体和噬菌体等通常只有一个复制起始点,因而其DNA分子就构成一个复制子;真核生物染色体有多个复制起始点,因而含有多个复制子。
transcription unit :从转录起始位点到转录终止位点所对应的、作为RNA聚合酶模板的基因序列范围。可以是单一基因、也可以是多个基因
(Molecular) chaperon :一组从细菌到人广泛存在的蛋白质,非共价地与新生肽链和解折叠的蛋白质肽链结合,并帮助它们折叠和转运,通常不参与靶蛋白的生理功能。主要有三大类:伴侣蛋白、热激蛋白70家族和热激蛋白90家族. 存在于原核生物和真核生物细胞质以及细胞器中可协助新生肽链正确折叠的一类蛋白质
signal peptide : 分泌蛋白新生肽链N端的一段20~30氨基酸残基组成的肽段。将分泌蛋白引导进入内质网,同时这个肽段被切除。现这一概念已扩大到决定新生肽链在细胞中的定位或决定某些氨基酸残基修饰的一些肽段
nonsense mutation :由于某个碱基的改变使代表某种氨基酸的密码子突变为终止密码子,从而使肽链合成提前终止。
missense mutation:基因中的碱基突变导致翻译产物中相应位置形成错误的氨基酸残基,其结果是一个不同的氨基酸参入到多肽链的相应位置
house-keeping gene:生物体各类细胞中都表达,对维持细胞存活和生长所必需的蛋白质编码的基因。如糖酵解和柠檬酸循环所需酶的编码基因等。
luxury gene : 奢侈基因(Luxury gene):在特别细胞类型中大量(通常)表达并编码特殊功能产物的基因。
cis-acting element: DNA、RNA或者蛋白质中的一些特殊的核酸或氨基酸残基序列,只作用于与其连接在一起的靶,而不作用于不与其相连的靶
trans-acting factor:通过直接结合或间接作用于DNA、RNA等核酸分子,对基因表达发挥不同调节作用(激活或抑制)的各类蛋白质因子。
polycistronic mRNA:两个以上相关基因串在一起转录所得到的信使核糖核酸(mRNA)。多顺反子mRNA一般可同步翻译产生功能相关的多个蛋白质或酶。
monocistronic mRNA:能翻译成一条肽链的信使核糖核酸(mRNA),来自单顺反子
multiple cloning sites :DNA载体序列上人工合成的一段序列,含有多个限制内切酶识别位点。能为外源DNA提供多种可插入的位置或插入方案
二、问答题(每题10分)
1、哪些经典的实验证明了DNA是遗传物质?简要对实验做以说明。
⏹1868年F. Miescher从脓细胞中提取“核素”。
⏹1928年Grifths肺炎双球菌毒性实验。
⏹1944年Avery肺炎双球菌转化实验,说明DNA是遗传物质。
⏹1952年Hershey和Chase噬菌体侵染大肠杆菌实验证实了DNA是遗传物质。
2、列出你所知道的分子标记的名称、定义及原理。
•分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平遗传多态性的直接的反映。随着分子生物学技术的发展,现在DNA分子标记技术已有数十种,广泛应用于遗传育种、基因组作图、基因定位、物种亲缘关系鉴别、基因库构建、基因克隆等方面。
•①RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)by Botstein(1980)
•1974年Grodzicker等创立了限制性片段长度多态性(RFLP)技术,它是一种以DNA—DNA杂交为基础的第一代遗传标记。
•利用特定的限制性内切酶识别并切割不同生物个体的基因组DNA,得到大小不等的DNA片段,所产生的DNA数目和各个片段的长度反映了DNA分子上不同酶切位点的分布情况。
•通过凝胶电泳分析这些片段,就形成不同带,然后与克隆DNA探针进行Southern 杂交,即获得反映个体特异性的RFLP图谱。
•它所代表的是基因组DNA在限制性内切酶消化后产生片段在长度上差异。
•由于不同个体的等位基因之间碱基的替换、重排、缺失等变化,导致限制内切酶识别和酶切发生改变,从而造成基因型间限制性片段长度的差异。
•②RAPD(Random Amplified Polymorphism DNA)
•1990年,由美国杜邦公司的科学家Williams推出。与RFLP相比的优越之处:检测效率高、样品用量少、灵敏度高等。
•RAPD方法是在PCR技术基础上发展起来的,它利用一系列随机引物(通常为8-10个核苷酸),对所研究的基因组DNA进行PCR扩增,引物与基因组DNA某一区段互补时,就与其结合,就可对引物下游DNA进行合成,即扩增。
•RAPD的引物:(1)为随机引物,(2)序列较短(通常为10个核苷酸)
•③AFLP(Amplified Restriction fragment polymorphism)
•AFLP技术是1992年Zabeau Mare等发明,结合了RFLP和PCR技术的特点,具有RFLP技术的可靠性和PCR•技术高效性。
•对基因组DNA进行酶切,连上双链人工接头,根据接头的核苷酸序列和酶切位点设计引物,进行选择性扩增。
•它将RAPD随机性和专一性扩增巧妙结合,再选用内切酶以达选择的目的。
•④SSR(Simple sequence Repeat )=(microsatellite)=(Short Tandem Repeat,STR)