WB步骤
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Western blot 的详细操作步骤
一.蛋白样品的提取
1.先从-80°冰箱内取出sham 1d/3d组,SAH+PBS 1d/3d组,SAH+SP 1d/3d组,
SAH+Tregs 1d/3d组脑组织样品(区分脑皮层,海马区),并对这四种样品进行编号样品1,2,3,4,等脑组织在室温下复温后,用预冷的PBS将脑组织表面的血性物质冲洗掉,并用吸水纸吸掉组织表面多余的水分,然后分别把样品1,2,3,4放到预冷的培养皿1,2,3,4中,分别用眼科剪刀1,2,3,4将脑组织分别剪成一个大块以及几个小块。然后分别将样品1,2,3,4称重,每个脑组织样品秤取500mg(可变化)并分别装入2ml的预冷的EP管中,同时把匀浆器(编上编号)置于冰盒内预冷。
2.按照每250mg脑组织加入1ml的RIPA的比例加入对应量的RIPA于盛有脑组织的
EP管1,2,3,4中,同时按照裂解液:cocktail=1:500的体积比加入cocktail(我们有现成的试剂)(一种蛋白酶抑制剂,抑制蛋白酶降解蛋白),然后用眼科剪刀(注意:不同的样品用不同的剪刀,提前把剪刀编上号1,2,3,4)将脑组织剪碎,尽量剪的碎一点以利于下一步的匀浆。
注意:这一步的处理过程要在冰盒中进行以抑制蛋白质的降解。
3将已经剪碎的EP管1,2,3,4中的脑组织倒入对应序号的匀浆器1,2,3,4中,在冰上匀浆脑组织,直至匀浆液变得无颗粒(大致用30min,最少是1次/分钟,尽量多匀浆几次)。
4.匀浆结束后,用1ml的移液枪将匀浆好的脑组织匀浆液从匀浆器中转移到对应序号的
预冷的EP管1,2,3,4(提前将要用的EP管编上号1,2,3,4并置于冰上预冷)中.每个样品转移2ml样品匀浆液。
5. 先将盛有脑组织匀浆液的EP管配平(移液枪吸取等量)后,将其放入离心机内,4℃
离心,18000 rpm 20min。
6. 用移液枪从分层后的液体中抽取上清液(大约吸取0.5-1ml),并转移到在冰盒中预冷的另外4个EP管1,2,3,4中,保存上清于-80度冰箱内直至使用。
二,Western blot之蛋白定量(蛋白浓度测定)
采用96孔板法
(1.)试剂如下表配置
注意:样品BSA栏中加入稀释后的样品25ul,根据样品稀释倍数来决定PBS与原液的比例,最后保证加入的样品总体积达到25ul。
(2)将表一配制的溶液加到96孔板中,每个浓度的标准品以及样品都另设1-2个复孔。
(3)将96孔板37°干燥30min.
(4)将96孔板放入酶标仪中,490nm/630nm波长处测定吸光度值(BCA法预实验表明,490-630nm广谱测数据后,计算蛋白浓度基本一致)。
(5)根据得到的标准曲线和样品的OD值计算样品的浓度。
三.WESTERN BLOT 样品处理
1.按照每30μl蛋白样品加入10ul上样缓冲液的比例(就是将4xloading buffer稀
释4倍)来使用。
如果4xloading buffer中不含有DTT就按照4xloading buffer:DTT=4:1的比例加DTT.
2.混匀后,100°水浴加热5-10分钟(8分钟即可),使蛋白变性。
注意:水浴时,将盛有样品的EP管置于“浮子”上,要保证蛋白液面在水浴液面之下,以及EP管的底不要接触到水浴锅的底。一定要保证水开后(开始沸腾后)再把盛有样品的EP
管放进去。
3.水浴结束后,从水浴锅内取出EP管,迅速置于冰上,至温度降下来后再将EP管放到-20°或者是-80°冰箱内备用。如果后续工作准备就绪,也可以将EP管从水浴锅内取出冷却至室温后,14000rpm离心5分钟,取上清直接上样电泳即可(EP管内样品呈紫蓝色,只有底层有少量的沉淀,上清占大部分)。
四.Western blot之聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)
1.1. 清洗玻璃板:双手戴乳胶手套,一只手扣紧玻璃板,另一只手蘸点洗洁精轻轻擦洗(注
意玻璃板周围的擦洗,容易被忽略)。两面都擦洗过后用自来水冲,再用洗瓶蒸馏水冲洗干净后用电吹风吹干。
2.灌胶与上样
①.玻璃板对齐后放入夹中卡紧(要保证两块玻璃板的下缘平齐,尽量往下压玻璃板使其
与底部的海绵垫充分接触以免漏胶),然后垂直卡在架子上准备灌胶。
②.对于MMP-9,灌注8%的分离胶,对于Active caspase-3,灌注12%的分离胶。
50ml的烧杯1配制8%的分离胶,10ml的配方以及加入的顺序如下:
5.3ml的超纯水---2.5ml的1.5M的Tris(PH=8.8)--- 0.1ml的10%的SDS--- 0.1ml
的10%的过硫酸胺---2.0ml的30%的丙烯酰胺---最后加入0.008ml的TEMED.
50ML的烧杯1配制12%的分离胶,10ml的配方以及加入的顺序如下:
3.3ml的超纯水---2.5ml的1.5M的Tris(PH=8.8)--- 0.1ml的10%的SDS---0.1ml 的10%的过硫酸胺---
4.0ml的30%的丙烯酰胺---最后加入0.004ml的TEMED.
③加入TEMED后立即摇匀(可以用枪吹打均匀)即可灌胶,灌胶时,用1ml枪吸取1ml
胶沿玻璃板的一边加入(灌胶时开始可以快一点,胶面快到所需高度时要放慢速度,而且操作时胶一定要沿着玻璃板流下,这样胶中才不会有气泡),待到胶面升到绿带中间线高度时即可(分离胶的高度要保证灌完浓缩胶,插梳子后梳齿的下沿不要接触到分离胶的上缘,
要保持一段距离),然后在分离胶上加入异丙醇封胶(加异丙醇封胶时要慢,),1-1.5个小时后(在异丙醇和胶之间会有一条折射线出现,这就说明胶已经凝了)倒掉异丙醇,用自来水先反复洗涤10遍,然后用超纯水洗3次(因为异丙醇为有机溶剂,要洗到油光消失),
最后用条状定性滤纸将残留的超纯水吸干。
④配制Tris-甘氨酸SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳5% 浓缩胶溶液
用50ml的烧杯2配制5%的浓缩胶溶液,6ml的浓缩胶的加入的顺序如下:
4.1ml的超纯水---0.75ml的1M的Tris(PH=6.8)---0.06ml的10%的SDS---0.06m10%过硫酸胺---1.0ml 30%丙烯酰胺---0.006ml TEMED
加入TEMED后立即用1ml的移液枪吹打均匀即可灌胶。
⑤.灌胶时用1ml的移液枪沿一侧缓缓加入,不要打到头,以免带入气泡!将剩余空间灌满
浓缩胶然后将梳子插入浓缩胶中。(插梳子时要使梳子的一边先插到位,再缓缓将梳子的另一边压下去)这样可以避免气泡的产生。
⑥. 在浓缩胶凝固的过程中要经常在两边补胶,待到浓缩胶凝固以后,大概需要1-1.5个小
时,两手分别捏住梳子的两边竖直向上轻轻将其拔出。(注意:拔梳子的时候双手平衡用力将梳子平行拔出,不要把孔拔歪)。
配方:5×电泳缓冲液
Tris 30.2 g
甘氨酸188g
SDS 10 g
溶解后用浓盐酸调pH至8.3,用超纯水定容至2L,室温保存。
电泳液的配制:用5xTris-甘氨酸电泳缓冲液(索龙宝公司的500ml每瓶)