微生物的分类和鉴定
第十章微生物的分类和鉴定
一、名词解释：
01.系统学（systematics）：是研究生物多样性及其分类和演化关系的科学。分子
系统学是检测、描述并揭示生物在分子水平上的多样性及其演化规律的科学。研究内容包括了群体遗传结构、分类学、系统发育和分子进化等领域。
02.系统树：在研究生物进化和系统分类中，常用一种树状分支的图型来概括各
种（类）生物之间的亲缘关系，这种树状分支的图型也称为发育树（phylogenetic tree）。
03.分子系统树：通过比较生物大分子序列差异的数值构建的系统树称为分子系
统树。
04.微生物分类学（microbial taxonomy）：是一门按微生物的亲缘关系把它们安
排成条例清楚的各种分类单元或分类群的科学，其具体任务有三，即分类、鉴定和命名。
05.分类（classification）：根据文献资料，经过科学的归纳和理性的思考，整理
成一个科学的分类系统。即解决从个别到一般或从具体到抽象的问题。06.鉴定（identification）：通过详细观察和描述一个未知名称纯种微生物的各种
性状特征，然后查找现成的分类系统，以达到对其知类、辨名的目的。即解决从一般到特殊或从抽象到具体的问题
07.命名（nomenclature）：为一个新发现的微生物确定一个新学名的过程。
08.培养物（culture）：是指一定时间一定空间内微生物的细胞群
或生长物。如微
生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。如果某一培养物是由单一微生物细胞繁殖产生的，就称之为该微生物的纯培养物（pure culture)。
09.菌株（strain）：从自然界分离得到的任何一种微生物的纯培养物，都可以称
为微生物的一个菌株；用实验方法（如通过诱变）所获得的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌株，以便与原来的菌株相区别。菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体。
10.标准菌株：指能代表这个种的各典型性状的一个被指定的菌株。
11.种群（population）：也有人译为群体、居群或群丛等，是指一定空间中同种
个体的组合。每一个物种在自然界中的存在，都有一定的空间结构，在其分散的、不连续的居住场所或分布区域内，形成不同的群体单元，这些群体单元就称为居群。
12.种（species）：是生物分类中基本的分类单元和分类等级。它是一大群表型特
征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属的其他物种有明显差异的一大群菌株的总称。
13.型（form / type）：常指亚种以下的细分，当同种或同亚种不同菌株之间的性
状差异，不足以分为心的亚种时，可以细分为不同的型。例如，按抗原特征的差异分为不同的血清型；按对噬菌体裂解反应的不同分为不同的噬菌型等等。
14.亚种/变种（subspecies / variety）：当某一个种内的不同菌株存在少数明显而
稳定的变异特征或遗传性而又不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元—亚种。亚种是正式分类单元中地位最低的分类等级。变种是亚种的同义词。
15.真菌（fungi）：是不含叶绿体、化能有机营养、具有真正的cell核，含有线
粒体、以孢子进行繁殖、不运动的典型的真核微生物。
16.粘菌（slime molds）：又称粘质霉菌，是非光合营养的真核微生物，不含叶绿
素，吞噬方式摄食，产孢子和子实体等表型特征使它们介于真菌和原生动物之间。
17.热原体（Thermoplasma）：在古生菌中，有一类无细胞壁的原核生物很像支
原体，由于他们无细胞壁、嗜热、嗜酸、行好氧化能有机营养，所以称为热原体。
二、填空：
01.细菌分类鉴定的主要文献是《伯杰氏细菌学鉴定手册》。
02.对生物系统发育进行研究，最合适的揭示各类生物亲缘关系的大分子物质是
rRNA，特别是16SrRNA。
03.rRNA序列测定和分析方法有：寡核苷酸编目法和全序列分析法。
04.对于序列目录资料进行分析比较，常采用相似性系数和序列印迹法来比较各
微生物之间的亲缘关系。
05.系统树分为无根树和有根树两种形式
06.在系统树图型中分枝的末端和分枝的连接点，称为结（nod），代表生物类群；
分枝末端的结代表仍生存的种类。
07.构建分子系统树，最常用的是最节省分析法或称简约法。这种推断谱系的原
则是：在所有可能的谱系关系中，涉及进化改变的序列特征数最少的谱系是最可信的。
08.20世纪70年代，Woese根据16SrRNA（18SrRNA）序列分析，将生物界分
为三界（后改称三个域）：古细菌、真细菌、真核生物。1990年
他又把它们改成为Bacteria（细菌）、Archaea（古生菌）和Eukarya （真核生物），并构建了三界（域）生物的系统树。
09.分类单元（taxon，复数taxa）是指具体的分类群。它有七个基本的分类等级
（或分类阶元）即：界、门、纲、目、科、属、种。在微生物分类中，还有一些非正式的类群术语，如种以上的有群、组系；亚种以下的有培养物、菌株、居群、型。
10.根据国际命名法规，证实分类单元的学名，必须用拉丁词或其他词源经拉丁
化的词命名，种名的命名是用双名法（binominal nomenclature）。命名，即种的学名由属名加种名加词两部分组合而成。
11.微生物数据存储、检索和分析中心是世界微生物数据中心（WDC）。我国微
生物资源数据库（MRDC）包括微生物的性状库、产品市场信息库、名称库、
名词库、国际交流用RKC代码库和一个微生物数值分析软件包MINTS。12.微生物多样性是生物多样性的一个重要组成部分，生物多样性包括遗传多样
性、物种多样性和生态系统多样性等。
13.产甲烷古生菌进行自养生长时，CO2是碳源，利用H2作为CO2的还原剂以
合成有机物，利用甲烷发酵或乙酸盐呼吸来获取能量，乙酸可以刺激生长。
14.所有的产甲烷古生菌都能利用NH4＋作为氮源，少数种可以固定分子态的氮。
15.绝大多数的超嗜热古生菌专性厌氧，以硫作为电子受体，进行化能有机营养
或化能无机营养的厌氧呼吸产能代谢。
16.超嗜热古生菌种的热网菌属（Pyrodictium）的细胞最高能在
