实验一 大肠杆菌基因组提取
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在实验开始,首先对实验的一些必须步骤(注:在几乎每一次小实验都会使用到的试验方法)做一定的解释。避免在写实验报告的过程中太过混乱!并且这些过程并不是每一位同学都参与了的,故在本实验报告的开篇写出。
(一)制备1%的琼脂糖凝胶
称取1g琼脂糖,放入锥形瓶中,加入100 mL的1 × TAE缓冲液,在微波炉中加热。完全融化后,取出摇匀。
(二)胶板的制备
1. 用橡皮膏将胶板的两端边缘封闭好。
2. 将胶板放在水平处,放好样品梳子。
3. 将冷却到60℃左右的琼脂糖凝胶缓慢倒入胶板中,注意不要产生气泡。胶的厚度在3-5mm之间。
4. 待胶凝固后,取出梳子,取下橡皮膏,放入电泳槽内(注意:梳子的方向靠近负极)。
5. 向电泳槽中加入1 × TAE缓冲液,缓冲液要浸没凝胶。
(三)加样
1. 在样品中加入适量的10 ×上样缓冲液,使缓冲液的终浓度为1×。
2. 用微量移液器将已加入缓冲液的样品加入上样孔中。记录加样的顺序和加样量。(注意:加样的过程中不要让样品溢出上样孔)
(四)电泳
1. 接通电泳槽与电泳仪的电源(注意DNA片段是从负极向正极移动)。DNA 的迁移速度与电压成正比。最高电压不超过5V/cm。
2. 当溴酚蓝染料移动到凝胶的2/3处时,停止电泳。
(五)染色
将电泳后的凝胶浸入溴化乙锭染色液中(带手套操作)。
(六)观察实验结果
在紫外灯(360 nm或254 nm)下观察染色后的凝胶,DNA处显出橘红色的荧光条带。
实验一大肠杆菌基因组提取
【实验目的】
1.学习并掌握细菌基因组的提取方法
【实验原理】
DNA是一个环形的大分子DNA,真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内。不同种属的生物,以及不同形式的细胞(如菌类、培养细胞、植物组织,动物组织)基因组提取的方法是不同的,但其基本原则是类似的,即既要将DNA 与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含十二烷基硫酸钠(SDS)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。SDS的作用机理是由于其能结合蛋白,中和蛋白的电性,使蛋白质的非共价键受到破坏,失去二级结构,从而变形失活,蛋白酶K的重要特性是能在SDS和EDTA(乙二胺四乙酸二钠)存在的情况下保持很高的活性。在匀浆后提取DNA的反应体系中,SDS可通过失活蛋白破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离;而蛋白酶K可将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分离出来。CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中((0.7 mol/L NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时,从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB-核酸的复合物与蛋白,多糖类物质分开。最后通过乙醇或异丙醇沉淀DNA,而CTAB溶于乙醇或异丙醇而除去。
【实验材料】
大肠杆菌DH5α菌液
【实验试剂】
LB液体培养基,TE溶液,10%SDS,蛋白酶K,5mol/L NaCl, CTAB/NaCl 溶液,酚/氯仿/异戊醇,异丙醇,70%乙醇
【实验仪器与用具】
微量移液器,低温离心机,水浴锅,eppendorf管,恒温摇床
【实验步骤】
(1)将2mL培养至对数期的大肠杆菌DH5α菌液5000rpm冷冻离心10min 弃上清;
(2)加190μL TE悬浮沉淀,并加10μL 10%SDS,1μL 20mg/mL蛋白酶K,混匀,37℃保温1h;
(3)加30μL 5mol/L NaCl,混匀;
(4)加30μL CTAB/NaCl溶液,混匀,65℃保温20min;
(5)加入300μL酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)抽提,5000rpm离心10min,将上清液移至干净离心管;
(6)加入300μL氯仿/异戊醇(24:1)抽提,取上清液移至干净管中;
(7)加300μL异丙醇,颠倒混合,室温下静止10min,沉淀DNA;
(8)5000rpm离心10min,沉淀DNA,加入500μL70%乙醇,5000rpm离心10min,弃乙醇,吸干;
(9)溶解于20μLTE,取3μL 用于琼脂糖凝胶电泳验证,其余-20℃保存。【实验结果与分析】
10 9 8 7 6 M
如图所示,8号为本组实验结果。对比maker,第一条带为正常大肠杆菌基因组,中间可以看见模糊的两条带,可能为断裂的基因组片段,下面最亮的为RNA。出现断裂的基因组可能是由于操作过于剧烈。本组电泳带还比较清晰整齐,其他组不整齐的带可能是电泳技术问题。RNA含量很大,所以出现拖尾现象。
实验二大肠杆菌感受态细胞的制备及验证
【实验目的】
1.掌握感受态的制备和转化的原理
2.学习大肠杆菌感受态细胞的制备方法
3.为重组子的转化做准备
【实验原理】
本实验采用CaCl
2
制备大肠杆菌的感受态细胞。所谓的感受态,即指受体(或者宿主)最易接受外源DNA片段并实现其转化的一种生理状态,它是由受体菌的遗传性状所决定的,同时也受菌龄、外界环境因子的影响。Ca2+也可大大促进转化的作用。细胞的感受态一般出现在对数生长期,新鲜幼嫩的细胞是制备感受态细胞和进行成功转化的关键。制备出的感受态细胞暂时不用时,可加入占总体积15%的无菌甘油或-70℃保存。
在基因克隆技术中,转化特指将质粒DNA或以其为载体构建的重组DNA导入细菌体内,使之获得新的遗传特性的一种方法。它是微生物遗传、分子遗传、基因工程等研究领域的基本实验技术之一。
受体细胞经过一些特殊方法(如:电击法,CaCl
2
等化学试剂法)处理后,使细胞膜的通透性发生变化,成为能容许外源DNA分子通过的感受态细胞。进入细胞的DNA分子通过复制、表达实现遗传信息的转移,使受体细胞出现新的遗传性状。
大肠杆菌的转化常用化学法(CaCl
2法)。其原理是细菌处于0℃,CaCl
2
的
低渗溶液中,菌细胞膨胀成球形,转化混合物中的DNA形成抗DNase(DNA酶)的羟基--钙磷酸复合物粘附于细胞表面,经42℃短时间热冲击处理,促使细胞吸收DNA复合物,在丰富培养基上生长数小时后,球状细胞复原并分裂增值。被转化的细菌中,重组子中基因得到表达,在选择性培养基平板上,可选出所需的转化子。
【实验材料】
大肠杆菌DH5α
【实验试剂】
LB液体培养基,0.1mol/Lcacl
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溶液
【实验器材】
恒温摇床,超净工作台,高压灭菌锅,低温离心机,微量移液器
【实验步骤】
一、感受态细胞的制备