实验 溶菌酶的粗提取、分离纯化及酶活力、纯度及分子量测定

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(提取):把酶从生 物组织或细胞中以溶解状态释放出来的过程,即将尽可 能多的酶,尽量少的杂质从原料中引入溶液。
高度纯化(fine fractionation)
(精纯化):除去与产
物性质相似的杂质。
纯化方案评价:酶活力、蛋白浓度、纯度
6
粗纯化( 提取)目标:
a. 将目的酶最大限度地溶解出来。
b. 保持生物活性。
26
3. 操作
2)洗脱:
平衡
上样 冲洗 洗脱
再生
1)上样:上样体积不十分严格。 增加溶液的离子强度 梯度洗脱法 (连续、不连续)改变溶液的pH值 3)再生:0.5-1mol/L NaCl溶液处理。
4.应用
制备纯化生物大分子
27
梯度洗脱方式
28
图4-39 梯度溶液的制备方法和洗脱曲线 (a)线性梯度;(b)凸形梯度;(c)凹形梯度;(d)编程梯度
5. 酶活力及比活性计算:
U=(ODn-OD2)/0.001*T(min)*0.2 C(mg/ml)=A280/13 6. 纯化回收率及纯化倍数计算 US2*V2 US1*V1 S2比活力 S1比活力
回收率=
×100%
42
纯化倍数=
7. 完成下表
样品 S1 S2 体积 ml V1= V2= 蛋 白 浓 度 总蛋白 mg/ml mg 活力 u/ml 比活力 u/mg 总活力 U 回收率 提 纯 倍 数 % 100 1
(可吸附带负电的蛋白质)
阳离子交换剂
(可吸附带正电的蛋白质 ) 22
两种离子交换剂
阴离子交换剂: 常用二乙氨基乙基,二乙氨基乙基2-羟丙基 DEAE -C2H4N+(C2H5)2H

QAE

-C2H4N+(C2H5)2CH2CH(OH)CH3
阳离子交换剂: 常用羧甲基 CM 磺丙基 SP
10
高速离心机
6000〜 25000
超速离心机
>25000
离心的形式

角式及水平(外摆)式:水平式一般为低速。

角式由低速到超速均有。
11
角式离心机和离心头(转子)

角式离心头要配套,低温使用要预冷,操作 注意稳、盖、旋紧。
12
离心管
材质:玻璃, 塑料 强度:和离 心速度相配 大小:和转 子配套 高速超速管 要加盖
Gel Filtration
Ion Exchange
Hydrophobic Interaction
Affinity
Reversed Phase
17
实验二、溶菌酶的分离纯化及酶活力 、蛋白浓度测定
目的:
1. 掌握离子交换层析原理及层析操作所需的必须原
件。
2. 掌握层析柱填装方法及层析填料的保存
3. 掌握比色法测定溶菌酶的浓度与酶活
比色皿
PBS缓冲液/ml 细胞PBS悬液/ml 酶液S1/ml 酶液S2/ml
1
5 -
2
5 -
3
4.8 0.2
4
4.8
0.2
41
实验步骤:
4. 酶活性测定,以①管(PBS)为对照,每隔30s 测定2,3,4管的 OD600并记录
时间(s) 2号 3号 4号 0 30 60 90 120 150 180
测压法:产物中有气体,测气压增加量。
滴定法:产物中有酸生成,用碱滴定。 荧光法:产物中有荧光物质生成或产物与荧光试剂 反应生成荧光产物可用此法。 旋光法:产物中有旋光物质可采用此法。 除了以上方法外,还可根据产物的性质采用其它方法。
4. 回收率和纯化倍数
提纯后酶总活力 提纯前酶总活力
回收率=
×100%
纯化倍数=
每次比活力 第一次比活力
实验2.2溶菌酶的活性测定
实验材料: 1. 枯草芽孢杆菌悬液
2. S1,S2
3. PBS等
4. 分光光度计、比色皿、计时器、离心机等
40
实验步骤:
1. 取6ml 菌悬液,3500rpm*5min,弃上清,沉淀 6ml PBS重悬。
2. 测定OD600并记录(吸光度0.5~1.0,若读数过高可适当稀释) 3. 测定样品准备(酶液务必在仪器等条件准备好,临测定前加 入)

13
离心机操作

平衡、定温、定速、定时。
14
实验一、 溶菌酶的粗提取——略
15
酶精纯化常用技术
透析

膜分离技术
超滤
凝胶过滤(分子筛/排阻)层析 离子交换层析 疏水层析 吸附层析

柱层析技术
亲和层析

蛋白质结晶
反相层析
16
Principles of Operation for Chromatography Techniques
44
1.原理
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳
十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳
(sodium dodecyl sulphate- polyacrylamide gel 用于蛋白纯度及蛋白质亚基相对分子量
electrophoresis, SDS- PAGE)简称SDS- PAGE。 (relative molecular mass, Mr)测定。
29
层析柱的制备与层析操作 柱层析的设备:
层析柱、蠕动泵(恒流泵)、检测仪、 部分收集器、梯度洗脱器。
30
层析设备
层析装置: 梯度混和器 蠕动泵 层析柱 监测仪 记录仪 收集器

31
记录仪
32
现代化层析设备 ——AKTA
层析柱 XK BPG
实验2.1 层析柱的填装

制,能被Mg2+,Ca2+、NaCl所激活
3
4
溶菌酶理化性质:相对分子质量14700 Da,由 129个氨基酸残基构,pI:~10.8,最适温度为 50℃,最适pH为6~7左右。280nm的消光系数 为13.0
5
背景知识: 酶的提取、分离纯化
初步纯化(rough fractionation)
实验1-3 溶菌酶的提取分离及鉴定 (酶活力、纯度及分子量测定)
1
实验内容
1. 溶菌酶的粗提取 2. 溶菌酶的分离纯化及酶活力、蛋白浓度测定 3. 溶菌酶纯度鉴定与分子量测定
2
背景知识
溶菌酶(lysozyme):胞壁质酶(muramidase)或N-乙酰胞壁质
聚糖水解酶(N-acetylmuramide glycanohydrlase),是一种能水 解致病菌中黏多糖的碱性酶。 生物学效应:主要通过破坏细胞壁中的N-乙酰胞壁酸和N-乙酰 氨基葡糖之间的β-1,4糖苷键,使细胞壁不溶性黏多糖分解成可 溶性糖肽,导致细胞壁破裂内容物逸出而使细菌溶解。该酶活 性可被一些金属离子Cu2+,Fe2+,Zn2+以及N-乙酰葡萄糖胺所抑

c. 填料倾倒入柱管内前先加入少量水覆盖柱底 d. 柱拆卸后填料务必回收,并保存于20%乙醇中。
35
二、酶的活力单位及酶活测定:
1. 酶活单位: 1961 年国际生化协会酶学委员会统一规
定,酶的国际单位( IU )规定为:在最适反应条件(温度 25℃)下,每分钟内催化 1微摩尔(μmol)底物转化为产物 所需的酶量(或1分钟内转化底物生成1微摩尔产物的酶量)
Fra Baidu bibliotek
2.离子交换填料:
离子交换剂由载体、电荷基团和反离子构成。
纤维素 琼脂糖 —O—CH2—COO-—Na+ 葡聚糖
载体 电荷基团 反离子
21
离子交换剂
--带有电荷基团的不溶性载体
CH2CH3
载 -O-CH CH N-H Cl2 2 体
CH2CH3
Diethylaminoethyl (DEAE)
阴离子交换剂
因此,蛋白质—SDS复合物(SDS-denatured protein)在凝胶中
的迁移率不受蛋白质原有电荷和形状的影响,只与椭圆棒长度 (蛋白质分子量)有关。
46
SDS-PAGE separates proteins by MW
47
蛋白质的迁移率与分子量的对数呈线性关 系,符合下式:logMW=K-bX MW:分子量;X:迁移率;k、b均为常数 将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子 量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质 在相同条件下进行电泳,根据其相对迁移率即可

溶菌酶的活力单位(U):在室温,pH8.0的条件下,
OD600每分钟降低0.001为1个活力单位。

280nm的消光系数为13.0,根据 A=ECL 可粗略测定溶菌酶 浓度,用于酶比活的评价。
19
离子交换层析
(ion exchange chromatography,IEC)
20
1.原理:根据待分离物质带电性质不同的分离 纯化方法。

注意:温度升高,溶解度加大。但为防止酶失活,
一般采用低温下(0~10℃)操作。
提取原则
a. 相似相溶。
b. 远离等电点的pH值,溶解度增加。
7
离心分离 (一)基本原理 1. 离心力
Fc = m ac = m r ω 2 = m r (2 N/60)2 N为离心机每分钟转数 (r/min ); Fc通常以相对离心力RCF(relative centrifugal force)表 示,即离心力F的大小相当于地球引力(重力常数g)的多少 倍。一般用g(或数字g)表示。 RCF = m r (2 N/60)2 /mg= 1.12 10-5 N2 r 此公式描述了相对离心力与转速之间的关系 旋转半径用r平均代替
称为1标准单位。
2.酶的比活力:
每单位酶蛋白所含的活力单位数。
对固体酶:用活力单位 /mg 酶蛋白、或活力单
位/mg酶蛋白氮来表示;
对液体酶:用活力单位/ml酶液来表示。
很明显,比活力越大,酶的活力越大。
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3.具体测定方法
分光光度法:产物与适当的化学试剂生成有色物质 或产物有紫外吸收的能力可采用此法。
18

原理:

根据溶菌酶 pI 10.8,pH 8.0 PBS 中携带?电,与阴/阳
离子层析填料可结合,通过吸附后,提高pH或离子强度将 溶菌酶与其他蛋白进行分离达到纯化目的。

溶菌酶对革兰氏阳性菌细胞壁的酶解作用导致细菌完整性 破坏,OD600值会下降,通过单位时间内(每分钟) OD600值的下降评价酶活性。
r平均=1/2(r大+r小)cm
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通常:
•低速离心以每分钟的转数表示,如:4000r/min。
•高速离心(超速),常以相对离心力(RCF)表
示,如:65000g。 两者可换算或查测算图。
9
离心机的种类
名称 低速离心机 转速(r/min) 6000 注意事项 常温,注意样品热变性和离 心管平衡 冷冻(防止温度升高), 离心管的精确平衡 冷冻+真空系统(减少空气 阻力和摩擦), 离心管的精确平衡
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1.原理
SDS是一种阴离子去污剂,带有大量负电荷,与蛋白质结合
后使蛋白质所带负电荷大大超过了天然蛋白质原有的负电荷,因
而消除或掩盖了不同种类蛋白质间原有电荷的差异。 SDS破坏蛋白质氢键、疏水键,引起蛋白质构象改变,使蛋白 质-SDS复合物形状近似椭圆形,短轴相同(1.8nm),长轴与蛋 白质分子量成正比。
—CH2COO- —C3H6SO3-
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化学原料合成 : sephadex sepharose 载体
天然材料制成: cellulose
如:DEAE-Sepharose, CM-Sepharose
24
实验设计原理
利用不同的蛋白质分子在溶液中所带电 荷不同,因而与离子交换剂有不同吸附力
而分离。 溶菌酶pI:~10.8
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实验3溶菌酶的纯度鉴定与分子量测定
实验目的: 1、通过实验的学习与操作,在实验过程更好的理解SDS-聚丙
烯酰胺凝胶(PAGE)测定蛋白质纯度与分子量的原理与依据;
2、掌握电泳原理以及SDS-PAGE垂直板电泳分析蛋白质技术; 3、熟悉垂直板电泳操作原理和方法,凝胶染色与脱色方法, SDS-PAGE分子量测定图谱的绘制与计算; 4、了解在电泳中分子量标准物的使用。

1.观摩 2.实验步骤 1)测定酶浓度(S-2) C(mg/ml)=A280/13 2)若填料载量为20mg/ml,计算拟纯化100mg 蛋 白需要的填料量和量取量。
34

3)装柱要点: a. 用纯水将乙醇保存液置换 b. 柱头及柱底适配器确保无气泡,可用注射器推注 赶气泡,并确保连接管路密闭无泄漏。
pI < 8.0 蛋白质带负电
pI > 8.0 蛋白质带正电
pH8.0
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2. 阴离子交换剂分离蛋白质的过程
- ClCl Cl-Cl -
Cl-
- ClCl Cl Cl- - Cl Cl Cl- Cl Cl- - Cl Cl Cl- - Cl ClCl
+
平衡
吸附
去吸附
低 盐
分离结束
高 盐
再生
利用不同盐浓度将不同蛋白质洗脱下來
在标准曲线上求得分子量。
48
49
2. 分离效应
PAGE根据其有无浓缩效应,分为: 连续电泳(continuous electrophoresis) 采用相同孔径的凝胶和相同的缓冲系统 不连续电泳(discontinuous electrophoresis) 采用不同孔径的凝胶和不同缓冲体系