利用高效CaCl2转化法实现质粒的共转化

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利用高效 K3K%- 转化法实现质粒的共转化
李刚! , 程度! , 李宝健! , 唐清泉- , 陆阳(! " 中山大学基因工程教育部重点实验室, 广东 广州 #!)-(#; - " Y,WN3U+>$ H+RW=6B,R%R>J KRNIRN3W+R,, ;R6FV+%%=, 1? -).#-, Z[5) 摘要: 为了提高共转化的效率, 对 《分子克隆》 中感受态制备和 K3K%- 转化法加以改良, 发展了 K3K%- 和 1>K%- 介导的高效的感 , 完全可以满足各种转化实验 (包括共转化) 的要求。使用该法, 我 受态制备和转化方法, 转化效率高达 !). 7 !)9 转化子 \! > ?25 们成功地将一个受体质粒和供体质粒共转化入 %&! 菌株中, 酶切结果证明供体质粒上的 ’()* 7 ( 基因 ! 人胰岛素样生长因子 7 !) 已经通过 %&! 酶介导的位点特异性重组连接到受体质粒的特定位点上。 关键词: 高效; 感受态制备; 共转化 K3K%- 转化法;
团小心缓慢地转移到 ! " #$% 的 &’ 管中, 用一次 ()* 乙醇和两 次无水乙醇浸泡沉淀各 ) " #$+,, 小心倒掉液体后, 让沉淀自然 干燥。 (视量多少而定) 。溶 ! " # " - " . 将沉淀溶解于 (#) % 或更多 /& ! , 混匀后即可保存于 冰柜。 解后, 加入 (# % 01 23456 7 -)8 ! 氯仿 ! " # " - " 9 将上述溶液用等体积的酚 7 氯仿抽提 - : 0 次, 抽提一次, 用室温的异丙醇沉淀后, 自然干燥, 再溶于 /&, 经 于 7 -)8 冰柜长期保存。 ;253<= 消化后, 机械打断 ?25 的程度。 毒性很强和具有一定挥发性的有机 0 " - 氯化苄是刺激性大、 物, 在操作过程中可对操作者的呼吸道、 眼睛造成强烈的刺 激, 甚至损害。因此在使用氯化苄时, 应戴好手套和口罩, 最 好的通风橱里进行操作, 尽量缩短氯化苄暴露在空气中的时 间, 做好自我保护。 操作 0 " 0 中性裂解法提取黑曲霉细胞基因组 ?25 步骤较少, 简单, 但用酚、 氯仿等直接抽提裂解液, 药品浪费大, 得率不 高, 且蛋白质没有有效去除, 需经多次抽提后才适合于分子生 物学研究。 在异丙醇 0 " C 对于二次沉淀法提取黑曲霉细胞基因组 ?25, 与提取液混合后就获得了大量丝状沉淀, 提示 ?25 产量可能 较高, 但离心后沉淀在 /& 中溶解不全, 溶解部分再经二次沉 淀后, 得率较低。通过摸索和比较, 本实验作了如下改进: 5" 用异丙醇进行第一次沉淀后, 不用离心, 而采取静置 #$+, 的方 以利于 ?25 在 /& 中 法集中沉淀, ?25 沉淀之间呈松散状态, 的溶解; H" 第一次沉淀的 ?25 再经一次 ()* 乙醇和两次无水 乙醇浸泡处理, 以除去更多的杂质, 并使 ?25 一定程度脱水, 以缩短干燥时间。经改进后的二次沉淀法提取黑曲霉细胞基 因组 ?25, 虽然步骤较多, 时间稍长, 但操作简单, 经过两次沉 淀、 酚 7 氯仿抽提、 获得的 /& 溶解及其引起的 ?25 损失后, ( 5-@) A5-.) D ! " 9 ) , 而且产量较高 ?25 不 仅 蛋 白 质 含 量 低 , 是提取用于分子生物学研究黑曲霉细胞基 (!0) >A> 菌丝体) ! 因组 ?25 的理想方法。采用本方法获取的黑曲霉 2-# 的基因 已经成功地用于植酸酶 IBJ5 全基因和表达片段的 组 ?25, [ ] 本实验室也已使用此法成功地提取了其 ’K; 扩增 C 。此外, 并有效地用于分子遗传分析及基 他多种真菌的基因组 ?25, 因克隆等研究。 综上所述, 上述三种提取黑曲霉细胞基因组 ?25 的方法 提取的 ?25 质量最好, 产量 中, 改良二次沉淀法耗时 # 7 @B, 其次为中性裂解法, 耗时 ! 7 -B, 产量约 高达 !0) >A> 菌丝体; ! 再次为氯化苄法, 耗时 0 7 CB, 蛋白质含量高, !0 >A> 菌丝体; ! 菌丝体。 产量约 0 >A> !
中性裂解法 二次沉淀法
由表 ! 可知, 三种黑曲霉细胞基因组 ?25 提取方法中, 以 二次沉淀法用时最长, 但 ?25 产量最高, !> 菌丝体可获得多 达 !0) 而且蛋白质去除较完全, > 的基因组 ?25, 5-@) A5-.) D ! " ! 9。中性裂解法用时最短, ?25 纯度不高, 5-@) A5-.) E ! " (#, ?25 产量为 !0 菌丝体。氯化苄法用时较长, 纯度最低, 蛋 >A> ?25 ! 白质含量较高, 5-@) A5-.) E ! " #), ?25 产量为 0 >A> 菌丝体。上 ! 述三种方法提取的 ?25, 经相同倍数稀释后, 各取 % 电泳检 ! (见图 !) , 以二次沉淀法 测, 均可观察到 -0FG 左右的 ?25 片段 的泳道最亮, 其次为中性裂解法的泳道, 氯化苄法的泳道最 弱。
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讨论和结论
其菌丝体的细胞壁富含多糖。要 0 " ! 黑曲霉属于丝状真菌, 获取细胞内的 ?25, 首要的问题就是要破坏细胞壁, 使细胞内 并 有 效 溶 解 于 提 取 缓 冲 液 中。朱 衡 的 ?25 充分释放出来, [!] 等 发现, 在碱性条件下, 氯化苄可与细胞壁多糖上的羟基作 用生成醚, 从而破坏真菌细胞壁糖链, 胞内 ?25 因细胞壁破裂 而得以释放。本试验结果表明, 氯化苄法提取的黑曲霉细胞 ( 5-@) A5-.) E ! " #)) 、 产量较少 (0 基因组 ?25 蛋白质含量高 >A> ! 菌丝体) , 说明氯化苄对黑曲霉细胞壁的破坏作用有限, 并不 能充分释放胞内的 ?25, 或者是释放的 ?25 未能有效溶于提 取缓冲液中而损失到沉淀中。用液氮冷冻过的菌丝体进行研 磨, 可以充分破坏细胞壁, 而且不会引入杂质, ?25 可以充分 和有效溶解在提取缓冲液中。但在液氮研磨时, 特别是在同 时使用石英沙时, 容易将 ?25 打断。如果将菌丝体真空抽干 为蓬松的状态, 不使用石英沙, 并注意研磨的手法, 可以减轻
参考文献: 朱衡, 瞿峰, 朱立煌 " 利用氯化苄提取适于分子生物学分析的真菌 [!] [ L] (!) : ?25 " 真菌学报, !99C, !0 0C 7 C)M [-] 姚斌, 张春义, 王建华, 等 " 产植酸酶的黑曲霉菌株筛选及其植酸酶 基因克隆 [ L] ( : " 农业生物技术学报, !99., @ !) ! 7 @M [0] &BN%+6B O K, P=%%J Q ;, KR,,==%J 4 1, !" #$ " 1R%=6S%3N 6%R,+,>,=TIN=<<+R, [ L] 3,U =V3%S3W+R, RX IBR<IBRBJUNR%3<=< XRN IBJW3<= 7 U=>N3U+,> 36W+V+WJ " ! " "#$ " %&’()*&)+, !99#, !C: 09@ 7 C)-M [C] 王红宁, 吴琦, 刘世贵, 等 " 黑曲霉 2-# 植酸酶 IBJ5 基因的克隆及序 列分析 [ L] (@) : " 微生物学报, -))!, C! 0!) 7 0!CM
生 物 技 术 第 %; 卷第 J 期 ;$ ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! 特定位点上。但在应用这种技术的过程中, 必须把受体质粒 和供体质粒共同转入受体菌中。由于共转化的效率很低, 而 常规的 !"!#$ 转化法其转化效率最大只能达到 %&’ ( %&) 转化 [ ] 这种转化效率很多时侯无法满足共转化的要 子 *! + ,-. $ , 求, 因此使用电激转化法进行共转化是最常见的选择。虽然 [ ] 但需要 电激法的转化效率可达到 %&/ ( %&%& 转化子 *! + ,-. $ , 使用比较昂贵的电激仪。 而且转化前需要对电激参数进行探索, 以找出最佳的电 激参数, 否则也无法得到满意的转化效率。本文对分子克隆 发展了一种 中常规的感受态制备法和 !"!#$ 转化法加以改良, 稳定、 高效的感受态制备和转化方法, 转化效率高达 %&) ( %&/ 转化子 *! 完全可以满足各种转化实验 (包括共转化) 的 + ,-., 要求, 可作为电激法的一种替代方法。使用该法, 我们成功地 并通过 !01 酶介 将受体质粒和供体质粒共转化入 !01 菌株中, 导的位点特异性重组将供体质粒上的 2345 ( % ( 人胰岛素样生 长因子 ( %) 基因连接到受体质粒的特定位点上。 % 6 % 材料 % 6 % 6 % 菌种和质粒 0 分子生物学实验中常用的一种大肠杆菌转化 ,78 "( 9% : 菌株, 本实验室储存。 含有 BCDE 位点的受体 : :--%;$( <=%&’ >?) !01 菌株, @"A0 , # 质粒和供体质粒共转化进入该菌体后, 可以发生 !"# 酶介导 的特异性体内重组。该菌株由美国 3AF0"GH+I 公司惠赠。 该质粒为供体质粒, 长度为 K 6 ;>O, M,-N ( 2345 ( %: .IM0 , 具有两个 BCDE 位点, 两个 BCDE 位点之间为待克隆的目的基因 该基因长度为 K;&OM。该质粒由本室程度博士构建。 2345 ( %, 该 质 粒 为 受 体 质 粒, 长 度 为 J>O, 经过与 M3AFPM"9: .IM0 , 载体将从供体质粒上 !01 * BCDE 系统介导的供体质粒重组后, 获得目的 基 因 2345 ( %, 并且原来沉默的四环素抗性基因 也会恢复表达, 据此可以筛选出共转化的重组子。该质 (!I0 ) 粒由美国 3AF0"GH+I 公司惠赠。 以上试剂中, 氯化镁、 硫酸镁、 葡萄糖、 氯化钙、 甘油、 氯化 钠、 氯化钾购自上海生工生物技术有限公司, 为分析纯级试 剂。W1"RF 1DF0"?F 和 90UFCA1 购自 .I01R?C 公司。 % 6 $ 方法 % 6 $ 6 % 感受态制备: 接种 $IB 过夜培养的菌液到 $&&IB B: 培养基中。 ;’Z 转移培养液到离心管中, 立 $8&0VIHA 振荡培养至 X,88& [ & 6 8; 即放 入 冰 浴 中, 轻 轻 旋 转 至 完 全 冷 却。 KZ 8&&&0VIHA 离 心 冰 %&IHA。菌体沉淀重悬于 %&&IB 用冰预冷的氯化镁溶液中; 浴中放置 8IHA, KZ K&&&0VIHA 离心 %&IHA。然后重悬于 %&&IB 用冰预 冷 的 氯 化 钙 溶 液 中, 冰 浴 $&IHA。 KZ K&&&0VIHA 离 心 %&IHA。重悬于 $&IB 氯化钙 * 甘油溶液。最后将感受态细胞分 装并储藏于 ( ’&Z 。 % 6 $ 6 $ 共转化程序 取 8& ( %&& 加入 % ( 8 # 感受态细胞, B ,-. 连接液或以 ! ! 适当比例混合的两种质粒, 轻轻混匀。冰浴 ;&IHA 后, K$Z 水 浴热激 ;&R。加入 8&& ! B ;’Z 预热的 PX! 溶液, ;’Z 、 $8&0VIHA 振荡培养 K8IHA。取 %&& ( $&& ! # 转化液涂含有筛选抗生素的 B: 平板。;’Z 倒置培养过夜。 转化效率的确定 利用本文所述的方法, 将受体质粒 M3AFPM"9 转化到大肠杆 0 菌菌株 ,78 经多次实验统计, 转化效率约为 %&) ( "( 9% 中, / 转化子 之间。 *! + ,-. %& $ 6 $ 共转化转化子的获得 将供体质粒 M,-N ( 2345 ( % 和受体质粒 M3AFPM"9 按照 %: 共转化 :--%;$ 感受态细胞, 取 %&& % 比例混合, B 涂含有 8& + ! ! 上转化子的数目约为 %&& ( * IB !I 的 B: 平板。过夜培养后, (转化子数目为多次实验的结果) 。随机挑取几个转化 8&& 个 子提取质粒后进行酶切鉴定。 $ 6 ; 共转化转化子的酶切鉴定 提取转化子质粒后, 获得了 J 6 K>O 长度的重组质粒。对该 重组质粒进行 Q?CN3 酶切分析, 电泳结果如图 % 所示。 由于酶切位点的原因, 无法直接将目的基因 2345 ( % 从重 组载体上切下来。只能采用间接的方法鉴定 2345 ( % 是否被 重组到受体质粒 M3AFPM"9 上。受体质粒上原来只有一个 Q?CN3 单酶切位点, 而目的基因 2345 ( % 上具有一个 Q?CN3 位点。从 理论上分析, 如果重组质粒 2345 ( % 被位点特异性地重组到受 体质粒 M3AFPM"9 上, 用 Q?CN3 酶切将会从重组质粒上切下来一 段 %>O 大小的片段, 剩余的片段大小约为 8 6 K>O。从上图可以 看出, 重组质粒用 Q?CN3 酶切后, 切成两条片段, 大小约为 %>O 和 8 6 K>O, 实际的酶切分析结果与理论分析相符, 从而证明了 转化子中的重组质粒为 !01 * BCDE 系统介导的含有 2345 ( % 基 因的重组质粒。因此本文所建立的高效感受态制备和 !"!#$ 转化法用于共转化实验是完全可行的。 $ 6 K 讨论 本方法 $ 6K 6 % 与分子克隆中的感受态制备和转化方法相比, 的改进之处主要有三点: 第一, 在制备感受态细胞时, 增加了一步用氯化镁溶液重 悬菌体细胞的操作, 这是得到高转化率的感受态细胞的关键。 第二, 第二次重悬菌体细胞时用含有 90HR ・!# 的氯化钙溶 液而不是单纯用氯化钙溶液, 进一步促进了细胞感受态的形 成。 第三, 制备好的感受态细胞进行转化时, 热激时间缩短为 而不是 《分子克隆》 中推荐的 /&R。据作者研究, 虽然 K8R、 K8R, J&R、 /&R 的热激时间对于上述方法制备的感受态细胞都可以实 现外源质粒的转化, 但转化子的数目明显不同, K8R 热激处理 的转化子数目最多。 上述改进, 有利于细胞感受态的形成, 增加了处于感受态 的细胞的数目, 有利于外源基因的进入, 使得转化效率比常规 的氯化钙转化法提高了 %& ( %&& 倍。 [$] 上的感受态制备和转化方法进行 $ 6K 6 $ 作者曾使用文献 上述质粒的共转化, 实验结果或者没有转化子, 或者转化子只 有几个至十几个, 转化效率比作者建立的方法低 %& 倍以上, 而且其中往往相当一部分是假阳性转化子。共转化转化效率 低所带来的困难是往往筛选不到所需的转化子。 结果稳定。作者先后使用该法进行 $ 6 K 6 ; 本方法重复性好, 过几十次共转化或单一转化实验, 每次转化效率都很高, 单质 ) / 共转化转化子 粒转化效率介于 %& ( %& 转化子 *! + ,-. 之间, 每个平板则有几百甚至上千个之多, 完全可以满足各种转化 试验。 综合上述几点, 本方法操作简单、 迅速, 转化效率高, 结果 稳定。既可以应用于两个或多个质粒的共转化, 也可以直接 应用于一些连接效率比较低 (如平端连接等) 的连接反应的转 化, 而且不需要特殊的仪器和设备, 值得推广。 $6%
第 !0 卷第 @ 期: 0! -))0 年 !- 月
生 物 技 术 HY4/&KP24_4‘c
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中图分类号: ](.# 文献标识码: 5 文章编号: (-))0) !))C 7 0!!^ )@ 7 ))0! 7 )0
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-
结果
三种方法分别从 !> 菌丝体中提取出的 ?25 溶液, 经 -#) 被稀释后测定其 -@),$ 和 -.),$ 的 4? 值, 计算 5-@) A5-.) 值、 (见表 !) 。 ?25 浓度及总产量
表 ! 三种黑曲霉细胞基因组 ?25 提取方法的比较 方法 提取时间 (B) 5-@) A5-.) 总产量 (! >) 氯化苄法 07C ! " #) 0 !7#7@ ! " (# - " !!0 !0)