2013/5/23br生物信息学概论br2013-5br提纲br1. 发展简史 2. 主要研究领域 3. 软件和工具br1. 发展简史br1946年 1946 年br美国生产出第一台全自动电子数字计算机“埃尼阿克”br1brbr
生物信息学软件及使 刘吉平 liujiping@ 用概述 生 物秀-专心做生物！ w w w .b b i o o .c o m 生物信息学是一门新兴的交叉学生物信息学的概念： 科，它将数学和计算机知识应用于生物学，以获取、加工、存储、分类
25生物信息学当前的主要研究任务 生物信息学研究都有其特定的、不断创新 的方法学。以系统优化、软件并行化和数 据处理技术为主体的海量生物学数据处理 体系的建立将基于新的思路和设想。26生物信息学的特点 它是一门基于数据积累，尤其是原始数据
Drosophila melanogaster 果蝇Arabidopsis thaliana 拟南芥基因组测序计划 海量DNA序列数据DNA序列是生命的真谛，这个世界上发生的一 切事情都与这一序列息息相关。 人类基因组计划（HGP）结果：
生物信息学概述文稿演示（优选）生物信息学概述生物分子信息生物分子至少携带着三种信息 遗传信息 与功能相关的结构信息 进化信息生物分子信息的特征 生物分子信息数据量大 生物分子信息复杂 生物分子信息之间存在着密切的联系遗传信息的载体——DNA
01 功能基因组学后基因 组阶段 02（2001--蛋白质组学03生物信息学快速发展研究内容生物信息学数据库构建 同源性序列查找 蛋白质结构分析非编码区分析系统发育分析研究内容---数据库构建基因序列数据库 常用： GenBank、 DDB
生物分子一级结构 二级结构 三级结构一级结构二级结构 三级结构四级结构DNA基因的DNA序列对 应 遗 传前体RNA mRNA关系密码蛋白质序列多肽链三个重要的信息(1)遗传信息的载体——DNADNA通过自我复制，在生物体的繁衍过程中传递遗
结束• The end！Omiga 2.0 ORF MapDNAStar 之 Protean 对氨基酸的亲疏水性 分析：helical wheel 图不同颜色代表不同的AA功能2. 提示、指导、替代实验操作，利用对实 验数据的分析所得的结论
《精要速览系列-先锋版生物信息学（第二版）》 D.R.Westhead，J.H.Parish & R.M.Twyman 科学出版社2004 A生物信息学概述 相关学习网站/inbioinformatics B数据采集 DNA,RNA和蛋白质
20世纪90年代人类基因组计划开始 （Human Genome Project, HGP）人类基因组计划带来了生物信息学人类基因组计划(HGP，Human Genome Project) 目标：整体上破解人类遗传信息的奥秘由美国NIH和能源
基因通过转录和翻译，使遗传信息在生物个体中得以表达，并使后代表现出 与亲代相似的生物性状。复制DNA转录RNA翻译蛋白 质(2)蛋白质的结构决定其功能l 蛋白质功能取决于蛋白质的空间结构l 蛋白质结构决定于蛋白质的序列（这是目前基本公认的假
– 生物信息学是在生命科学的研究中，以计算机为工具 对生物信息进行储存、检索和分析的科学。– 生物信息学是当今生命科学和自然科学的重大前沿领 域之一，同时也将是21世纪自然科学的核
生物信息学概述徐燕❖ 生物信息学产生的背景 ❖ 生物信息学的定义和研究内容❖ 生物信息学的研究方法 ❖ 软件开发一、产生的背景➢1990，由美国能源部(DOE)和国立卫生研究院(N
❖ SAS (Statistical Analysis System)是一个模块化、 集成化的大型应用软件系统。它由数十个专用模 块构成，功能包括数据访问、数据储存及管理、 应用开
在后两种比对在使用简单空位罚分时，最后得分都是 +3，现在却得到了不同的分数。2.4 打分矩阵• 正如空位罚分可以奖励与进化相关的的比对，失配罚分也可以 用来进一步区分相似
引物二聚体及发夹结构 (duplex formation and hairpin) 错误引发位点（false priming site） 引物及产物GC含量（compositi
5、蛋白质结构预测常见研究领域Alignment (序列比对)Protein Structure Prediction (蛋白质结构预测)Computer-Aided Gene Recognitions (计算机辅助基因识别)DNA Lan
存在不同的层次分子，细胞，组织器官和机体等等生命现象的层次 分子和原子的相互作用 生物小分子——糖、脂肪、核苷酸、氨基酸、金 属离子、水 生物大分子——蛋白质与核酸复制、转录、剪接、 翻译、运输 细胞及信号传导 个体、器官、组织 免疫
《生物信息学》先锋版中译本第二版科学出版社打分政策:60% 期末考试（70%掌握内容、25% 熟悉内容、5% 理解内容）（请注意红体与黑体字）A: 生物信息学概述1. 生物信息学：生物信息学是生物学和信息技术的结合，是现代科学的又一个分支学
生物信息学概述 一门学科的产生并不是偶然的，它是有一定的道理的。那为什么生物信息学能够产生并获得飞速发展，我们可以从哲学方面找到答案。我们知道，数据并不等于信息和知识，但却是信息和知识的源泉，关键在于如何从中挖掘它们。与正在以指数方式增长的
