蛋白质的序列分析及结构预测
蛋白质的序列分析及结构预测

.2. 模体以及结构域数据库➢ 模体数据库(1)PROSITE 蛋白质家族及结构域数据库 ( /prosite/ )• PROSITE 数据库收集了有显著生物学意义的蛋白质位点序 列、蛋白质特征序列谱库以及序列模型, 并能依据这些特征属 性

2024-02-07
蛋白质序列分析与结构预测
蛋白质序列分析与结构预测

P(c) 0.57 1.00 1.68 1.26 1.17 0.56 0.44 1.68 0.69 0.58 0.53 1.01 0.67 0.71 1.54 1.56 1.00 1.11 1.25 0.30BioinformaticsJu

2024-02-07
蛋白质结构预测
蛋白质结构预测

四肽片段Pt的平均值大于100,并且Pt 的均值同时大于P 的均值以及P 的均值,则可以预测这样连续的4个残基形成转角。则可以预测这样连续的4个氨基酸形成转角。(iv) 重叠规则• 对于螺旋和折叠的重叠区域,按{Pa}和{P}的 相对大小进

2024-02-07
第六章 蛋白质结构预测的原理与方法
第六章 蛋白质结构预测的原理与方法

25五、蛋白质结构域的折叠模式与蛋白质结构分类数据库261 蛋白质结构域的折叠模式蛋白质结构域(domain): 是蛋白质分子中介于二级结构 和三级结构之间的结构层次。在分子量较大的球形蛋白质分 子中,一条多肽链可能折叠成两个或多个空间上互

2024-02-07
蛋白质二级结构预测软件
蛋白质二级结构预测软件

PHD的使用请见人工神经网络方法中的“基于人工神经网络模型的预 测软件PHDsec使用简介”. nnPredict: /~nomi/nnpredict.html nnpredict算法使用了一个双层、前馈神经网络去给每个氨基酸分配 预测的类

2024-02-07
蛋白质结构预测
蛋白质结构预测

6.picornaviral蛋白上的酶切位点(NetPicoRNA) 7.叶绿体传递蛋白(ChoroP) 8.跨膜螺旋(TMHMM) 9.跨膜螺旋的位臵(TOPPRED) 10.跨膜螺旋的位臵和方向(DAS) 数据库搜索: 1.基于预测的线

2024-02-07
蛋白质结构预测和序列分析软件
蛋白质结构预测和序列分析软件

蛋白质结构预测和序列分析软件 2010-05-08 20:40 转载自布丁布果 最终编辑布丁布果 4月18日 蛋白质数据库及蛋白质序列分析 第一节、蛋白质数据库介绍 一、蛋白质一级数据库 1、 SWISS-PROT 数据库 SWISS-PR

2024-02-07
蛋白质结构预测方法综述
蛋白质结构预测方法综述

蛋白质结构预测方法综述 卜东波陈翔王志勇 《计算机不能做什么?》是一本好书,其中文版序言也堪称佳构。在这篇十余页的短文中,马希文教授总结了使用计算机解决实际问题的三步曲,即首先进行形式化,将领域相关的实际问题抽象转化成一个数学问题;然后分析

2024-02-07
第十一章 蛋白质结构及预测
第十一章 蛋白质结构及预测

第十一章 蛋白质功能、结构 及预测授课教师:唐 明本章内容提要• 1. 基本概念• 2. 蛋白质功能的预测• 3. 蛋白质结构的预测 • 4.主要数据库资源和的应用 • 5. 蛋白

2024-02-07
蛋白质结构预测
蛋白质结构预测

实习 5 :蛋白质结构预测学号20090***** 姓名****** 专业年级生命生技****实验时间2012.6.21 提交报告时间2012.6.21实验目的:1.学会使用GOR和HNN方法预测蛋白质二级结构2.学会使用SWISS-MOD

2024-02-07
第11讲 蛋白质高级结构预测
第11讲 蛋白质高级结构预测

蛋白质结构分类数据库SCOP (Structural Classification of Proteins) CATH (Class, Architecture, Topology,Homology)Number of folds is l

2024-02-07
关于蛋白质的序列分析及结构预测
关于蛋白质的序列分析及结构预测

二、蛋白质的序列分析1. 蛋白质序列信息的获取 2. 蛋白质序列分析这个数据库包含1 500 个蛋白质指纹图谱, 编码9 136 个单一模体。(3) BLOCKS ( www.bl

2024-02-07
蛋白质结构预测在线软件
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蛋白质结构预测在线软件Company Document number:WUUT-WUUY-WBBGB-BWYTT-1982GT蛋白质预测分析网址集锦?物理性质预测:?Compute PI/MW??SAPS?基于组成的蛋白质识别预测?AACo

2024-02-07
蛋白质结构预测网址
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蛋白质结构预测网址 物理性质预测: Compute PI/MW http://expaxy.hcuge.ch/ch2d/pi-tool.html Peptidemass http://expaxy.hcuge.ch/sprot/peptid

2024-02-07
七蛋白质结构预测与功能初步注释
七蛋白质结构预测与功能初步注释

氨基酸数目 相对分子质量理论 pI 值 氨基酸组成原子组成 分子式 总原子数消光系数半衰期 不稳定系数脂肪系数 总平均亲水性蛋白质疏水性分析• ProtScale工具http://

2020-11-16
蛋白质结构预测在线软件
蛋白质结构预测在线软件

蛋白质预测分析网址集锦物理性质预测:Compute PI/MWSAPS基于组成的蛋白质识别预测AACompIdent PROPSEARCH二级结构和折叠类预测nnpredictPredictproteinSSPRED特殊结构或结构预测COI

2024-02-07
蛋白质结构预测
蛋白质结构预测

BioinformaticsLiaoning University SWISS-MODEL:基于同源建模法与PDB数据库已知 结构的蛋白质序列比对,使用同源建模方法预测蛋白质 结构的在线服务器。 网址:/BioinformaticsLia

2024-02-07
蛋白质结构比对
蛋白质结构比对

SCOP 入口 :来自百度文库用 RASMOL 查看泛素蛋白和铁氧化 还原蛋白等的结构11 %的序列相似性 Dali 重叠泛素蛋白 [ 医学: [91274342] , PUB00

2024-02-07
蛋白质结构及功能预测
蛋白质结构及功能预测

物理性质预测 Compute PI/MW http://expaxy.hcuge.ch/ch2d/pi-tool.html Peptidemass http://expaxy.hcuge.ch/sprot/peptide-mass.html

2024-02-07
蛋白质结构预测原理概述
蛋白质结构预测原理概述

蛋白质结构预测原理概述 蛋白质结构预测技术已经有很多发展,但是基本原理未变,可以参考;基本操作也可以参考下文。 摘自:阎隆飞,孙之荣主编,蛋白质分子结构,清华大学出版社,1999. 现在计算机互联网高速发展,已经成为遍布全球的一个网络,成为

2024-02-07