名词解释总结
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名词解释总结
第五章 DNA 复制
DNA复制(DNA replication):亲代双链DNA分子在DNA聚合酶的作用下,分别以各单链DNA分子为模板,聚合与自身碱基可以互补配对的游离的dNTP, 合成出两条与亲代DNA分子完全相同的子代DNA 分子的过程。
复制子(Replicon):又称复制单位或复制元;DNA中含有一定复制起点和复制终点的复制单位; 1.3万~90万不等
复制体(Replisome):复制叉处的许多酶和蛋白组成的复合体,协同动作合成DNA。
The multi protein (30±) structure that assembles at replicating fork to undertake synthesis of DNA 。
DNA的半保留复制(Semi-Conservation Replication)
复制过程中各以双螺旋DNA的其中一条链为模板合成其互补链,新生的互补链与母链构成子代DNA分子复制起点(origin):复制开始处DNA分子的特定位置
原核生物(Prokaryote):单复制起点
真核生物(Eukaryote):多复制起点
复制叉(Replication fork):染色体中参与复制的活性区域,即复制正在发生的位点
复制眼(replication eye):电子显微镜下观察正在复制的DNA,复制的区域形如一只眼睛
慢停突变(slow-stop mutation)
在37℃下可以正常发动DNA的复制,当转入42℃的培养条件下,由于DNA的延伸由延长基因控制,整个复制过程不会立即停止,只有当完成这一周期的复制后,下一周期的复制启动不能发动
快停突变(fast-stop mutation)
复制延长基因温度敏感型突变体,在37℃和42℃下均可以正常发动DNA的复制,但当转入42℃的培养条件下,由于DNA延长基因的突变,整个复制过程表现立即停止的表型。
θ复制(Theta structure replication)
双链环状DNA的复制眼可以形成一种θ结构,形状像希腊字母θ,
D环式复制(Displacement form replication)
线粒体和叶绿体DNA的复制方式,复制起点先是以一条链为模板起始合成DNA的一段序列;两条链的起点并不在同一个点上,由于两条链的起点分开一定距离,所以产生D环复制
共价延伸方式(covalence elongation)或滚环式复制(rolling circle replication)
多为病毒、细菌因子的复制方式,
DNApol三种的比较
DNA旋转酶(gyrase)又称拓扑异构酶Ⅱ
DNA解旋酶(DNA helicase)
DNA解旋酶是利用ATP水解获得的能量来打断氢键,解开双链DNA并在DNA分子上沿一定方向移动的一类酶的总称(又称解链酶)。
单链DNA结合蛋白(single-strand binding protein, SSB)
防止DNA单链的链间或链内局部“退火”并保证其完整性与伸展性,使单链DNA处于稳定的状态一类蛋白即SSB与DNA单链相结合,既防止核酸水解酶的作用,又避免解开的单链DNA重新缔合形成双链,从而保持一种伸展状态,以保证复制顺利进行。
在DNA的修复和重组中都有SSB的参与
DNA连接酶(DNA Ligase)
DNA半不连续复制(semidiscontinuous replication)
认为DNA的新合成链的走向为3’——5’实际上是由许多5’——3’方向合成的DNA片段连接起来的岗奇片段(Okazaki fragment)
DNA合成中首先出现的较短的DNA 片段
引发酶(primerase)
催化RNA引物(RNA primer)合成的酶叫引发酶(primerase)。引发酶识别DNA单链模板特异顺序,以核糖核苷三磷酸为底物合成寡聚核苷酸产生3'-OH,为DNA聚合酶起始生成磷酸二酯键提供条件
引发体(primosome)
引物酶与蛋白质结合形成的复合体
复制子(replicon)基因组中能够独立进行的复制单位
OriC:大肠杆菌复制起始的最小更能片段
自主复制序列(autonomously replicating sequence,ARS)
酵母中具有复制能力的DNA片段含有复制起点
Tue蛋白:识别并结合在终止序列上,具有反解旋酶活性,能够阻止DNA的解旋作用,抑制复制叉前进切口(nick):一条链上断裂一条磷酸二脂键留下的切口
缺口(gap):一条单链上失去一段DNA单链
Klenow片段:DNA聚合酶1被蛋白酶切开得到的大片段,只有3’——5’外切核酸酶活性
夹子装配器(clamp loader):即γ复合物,是一种依赖DNA的ATP酶,由6个亚基构成,主要功能是协同β亚基钳住模板DNA。
拓扑异构酶(topoisomerase):能切开DNA双链和单链的一种酶,可引入超螺旋
回环模型():在DNA的两条链同时复制时,后随链模板经过复制叉的部位形成一个回环,以适应双链同时向前行进。这种模型称为回环模型
ORC:即起点识别复合物,是由ARS与一由六个蛋白质组成的复合物结合在一起形成的,存在于真核生物复制中
端粒(telomere):存在于真核生物线性染色体末端的特殊结构,其功能主要是染色体末端与特定的端粒蛋白因子结合形成复合物,既保护端粒DNA末端外切核酸酶及单链特异的内切核酸酶的破坏,稳定染色体末端结构,又避免DNA在黏性末端裸露而发生染色体融合,此外还可能与真核生物线性DNA末端的复制有关。
端粒酶(telomerase)可以外加重复单位到5‘末端上,维持端粒一定的长度
复制型(replicative form,RF)指在滚环复制中形成的中间产物——双链DNA
总结:DNA复制中的基本概念,三种复制方向(相向复制、单向复制、双向复制)、三种复制方式(θ复制、滚换复制、D环复制)、原核与真核复制速度的比较(原>真)、DNA复制的酶系(三种DNA聚合酶、DNA连接酶、引物合成酶、拓扑异构酶、单链结合蛋白)、原核生物复制过程、真核生物复制过程