生物信息学考试试卷

大学生生物信息学考试模拟题及解析一、单选题（每题 3 分，共 30 分）1、生物信息学中，用于分析 DNA 序列的常见软件是（）A BLASTB ClustalWC Primer PremierD MEGA2、以下哪种数据库主要存储蛋白质结构信息（）A GenBankB PDBC UniProtD SWISSPROT3、在基因预测中，开放阅读框（ORF）是指（）A 从起始密码子到终止密码子的一段序列B 具有特定功能的一段基因序列C 编码蛋白质的基因序列D 以上都不对4、进行系统发育分析时，常用的构建进化树的方法是（）A 邻接法B 最大简约法C 最大似然法D 以上都是5、以下哪种算法常用于序列比对（）A 动态规划算法B 贪心算法C 分治法D 回溯算法6、生物信息学中，用于分析基因表达数据的常用方法是（）A 聚类分析B 回归分析C 方差分析D 以上都是7、以下哪个不是常见的生物信息学文件格式（）A FASTAB GenBankC PDBD CSV8、在蛋白质序列分析中，用于预测蛋白质二级结构的方法是（）A 同源建模B 从头预测C 基于机器学习的方法D 以上都是9、进行基因功能注释时，常用的数据库是（）A GOB KEGGC ReactomeD 以上都是10、以下哪种技术可以用于大规模测序（）A Sanger 测序B 二代测序C 三代测序D 以上都是答案及解析：1、答案：A解析：BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是用于比较生物序列相似性的工具，常用于分析 DNA 序列。

ClustalW 主要用于多序列比对；Primer Premier 常用于设计引物；MEGA 用于构建进化树。

2、答案：B解析：PDB（Protein Data Bank）是主要存储蛋白质结构信息的数据库。

GenBank 主要存储核酸序列；UniProt 和 SWISSPROT 主要存储蛋白质序列信息。

生物信息考试题及答案生物信息学是一门结合生物学、计算机科学、信息技术和数学的交叉学科，它利用计算机技术来分析和解释生物数据。

以下是一份生物信息学考试题及答案的示例。

生物信息学考试题一、选择题（每题2分，共20分）1. 生物信息学中，用于存储DNA序列的文件格式是：A. FASTAB. JPEGC. MP3D. DOCX2. 以下哪项不是生物信息学分析的基本步骤？A. 数据收集B. 数据预处理C. 数据解释D. 数据存储3. 在蛋白质序列分析中，BLAST工具用于：A. 序列比对B. 序列组装C. 序列克隆D. 序列合成4. 以下哪个数据库不是用于存储基因表达数据的？A. NCBIB. GEOC. PDBD. ArrayExpress5. 以下哪个算法不是用于基因预测的？A. GeneMarkB. BLASTC. GlimmerD. Fgenesh二、简答题（每题10分，共30分）6. 简述生物信息学在现代生物学研究中的重要性。

7. 解释什么是基因组学，并说明其在医学研究中的应用。

8. 描述序列比对的基本原理及其在生物信息学中的作用。

三、计算题（每题15分，共30分）9. 假设你有一个DNA序列，其组成为：ATCGTA。

请计算其互补序列。

10. 给定两个蛋白质序列，序列A：A-B-C-D-E，序列B：A-C-E-B-D。

请使用Needleman-Wunsch算法计算它们的全局比对得分。

四、论述题（每题20分，共20分）11. 论述生物信息学在新药开发中的作用及其面临的挑战。

答案一、选择题1. A2. C3. A4. C5. B二、简答题6. 生物信息学在现代生物学研究中的重要性体现在它能够处理和分析大量的生物数据，如基因组序列、蛋白质结构等，帮助科学家快速发现生物现象的规律，推动生物学的发展。

7. 基因组学是研究生物基因组的结构、功能和演化的科学。

在医学研究中，基因组学可以帮助我们了解疾病的遗传基础，为个性化医疗提供理论基础。

生物信息学试题一、选择题1. 生物信息学主要研究的是：A. 生物实验技术B. 生物统计学C. 生物大数据分析与计算D. 生物体内生化反应2. 在生物信息学中，常用的序列比对工具是：A. BLASTB. PCRC. ELISAD. SDS-PAGE3. 下列哪个数据库主要用于存储核酸序列信息？A. PDBB. GenBankC. UniProtD. KEGG4. 以下哪种方法不是用于蛋白质结构预测的？A. 同源建模B. 折叠识别C. 从头预测D. 实验测定5. 生物信息学中的“基因家族”是指：A. 一组具有相似序列和功能的基因B. 一组来自同一物种的基因C. 一组通过基因复制产生的基因D. 一组控制同一生物过程的基因二、简答题1. 简述生物信息学在现代医学研究中的应用。

2. 描述PCR技术的原理及其在分子生物学中的重要性。

3. 解释什么是基因编辑技术，以及CRISPR-Cas9系统是如何工作的。

三、论述题1. 论述生物信息学在新药发现和开发中的作用。

2. 分析比较RNA测序技术与DNA测序技术的优势和局限性。

四、计算题1. 给定一个DNA序列：“ATGCGATACCTGAGCTG”，计算其碱基组成的比例。

2. 假设某种生物的基因组大小为200 Mb，每个碱基对的平均质量为650 Da，计算该基因组的大致质量。

五、案例分析题1. 根据给定的某种疾病的基因组数据，分析可能的致病基因，并讨论其可能的生物机制。

2. 通过分析某物种的转录组数据，探讨其在特定环境下的适应性变化。

请注意，以上试题仅供参考，具体题目应根据实际教学大纲和考试要求进行调整。

在实际考试中，题目可能会包含更多的细节和复杂性，要求考生具备扎实的生物信息学知识和分析能力。

生物信息技术考试试题一、选择题（每题 3 分，共 30 分）1、以下哪个不是生物信息学的主要研究内容？（）A 基因组学B 蛋白质组学C 细胞学D 代谢组学2、生物信息学中用于序列比对的常用算法是（）A 动态规划算法B 贪心算法C 分治算法D 回溯算法3、在基因表达数据分析中，常用的标准化方法是（）A RPKMB TPMC FPKMD 以上都是4、以下哪种数据库主要用于存储蛋白质结构信息？（）A GenBankB PDBC UniProtD Ensembl5、进行系统发育分析时，常用的构建进化树的方法是（）A 邻接法B 最大简约法C 最大似然法D 以上都是6、以下哪个软件不是用于基因序列分析的？（）A Primer PremierB SPSSC DNAStarD Vector NTI7、生物信息学中，预测蛋白质二级结构的方法不包括（）A 基于同源建模B 基于机器学习C 基于物理化学原理D 基于经验规则8、在生物信息学中，BLAST 程序主要用于（）A 序列比对B 进化分析C 基因预测D 蛋白质结构预测9、以下哪种编程语言在生物信息学中应用较为广泛？（）A JavaB PythonC C+＋D Fortran10、用于分析基因芯片数据的软件包是（）A R 语言中的 BioconductorB MATLABC StataD SAS二、填空题（每题 3 分，共 30 分）1、生物信息学中的三大核心数据库是_____、＿____、＿____。

2、基因序列的相似性搜索常用的工具是_____。

3、蛋白质的一级结构是指_____。

4、常见的基因注释数据库有_____、＿____等。

5、系统发育树的构建基于_____的原理。

6、生物信息学中常用的数据格式有_____、＿____等。

7、预测蛋白质三级结构的方法主要有_____、＿____。

8、基因表达数据的差异分析常用的方法有_____、＿____。

9、用于分析高通量测序数据的软件有_____、＿____。

生物信息学基础考试试题生物信息学基础考试试题回答一、选择题（每题5分，共20题）1. 生物信息学的定义是什么？A. 研究生物的基本信息B. 利用计算机科学分析生物学数据C. 研究生物的遗传编码D. 生物学的一个分支学科答案：B2. 以下哪个是常用的生物信息学数据库？A. NCBIB. C++C. DNAD. Photosynthesis答案：A3. 在DNA序列中，碱基A配对的是？A. TB. CC. GD. U答案：A4. 以下哪个是生物信息学中常用的序列比对算法？A. BLASTB. MATLABC. PCRD. ELISA答案：A5. 基因组学是研究什么的科学？A. 蛋白质结构B. DNA修复C. 基因组DNA的组成和功能D. 细胞分裂答案：C6. 哪种技术可用于测定DNA序列？A. 单克隆抗体技术B. RNA干扰技术C. 半制备列序法D. 高效液相色谱法答案：C7. 生物信息学中的序列模拟是指什么？A. 通过计算机模拟生物进化过程B. 利用计算机模拟DNA合成过程C. 模拟生物对某种药物的反应D. 利用计算机模拟细胞分裂过程答案：A8. 以下哪个是生物信息学的一个重要应用领域？A. 化学合成B. 建筑设计C. 新药研发D. 环境保护答案：C9. 哪个工具常用于分析生物信息中的调控网络？A. PhotoshopB. CytoscapeC. ExcelD. SPSS答案：B10. 蛋白质结构预测是生物信息学的一个重要研究方向，以下哪种是蛋白质的一级结构？A. α螺旋B. 葡萄糖C. 多肽链D. 抗原答案：C11. 生物信息学与生物医学工程有什么相似之处？A. 都研究细胞生物学B. 都属于理学院系C. 都涉及到计算机科学D. 都使用相同的实验方法答案：C12. 在基因组测序中，什么是基因组装？A. 利用计算机将碎片序列拼接成连续的基因组B. 测定基因组中的突变位点C. 研究基因间的调控关系D. 将RNA转录为蛋白质的过程答案：A13. 以下哪个不属于生物信息学的软件工具？A. BLASTB. PhotoshopC. RD. Python答案：B14. 哪种常见的DNA测序技术被广泛应用于基因组学研究？A. Sanger测序B. 吉姆斯法则C. CRISPR-Cas9技术D. 免疫印迹法答案：A15. 生物信息学中的反向遗传学用于研究什么？A. DNA复制B. 基因的转录和翻译C. RNA干扰D. 基因组的组装答案：B16. 哪种方法可用于鉴定基因表达谱中的关键基因？A. 蛋白质降解法B. 基因芯片技术C. 聚合酶链式反应D. 免疫组化技术答案：B17. 生物信息学研究中常用的基因表达定量方法是什么？A. Western BlotB. ELISAC. qPCRD. 蛋白质组学答案：C18. 生物信息学中的系统生物学研究的是什么？A. 各个细胞器的功能B. 化学元素与生物体的相互作用C. 生物学过程中的相互关系D. 各个动物种群的遗传特征答案：C19. 下面哪个数据库不是用于蛋白质结构预测的？A. PDBB. UniProtC. Swiss-ProtD. Entrez Gene答案：D20. 生物信息学中常用的序列对比方法是什么？A. 水平基因转移B. Smith-Waterman算法C. 单克隆抗体制备D. RNA干扰技术答案：B二、简答题（每题10分，共5题）1. 编程语言在生物信息学中的作用是什么？编程语言在生物信息学中扮演着重要角色。

《生物信息学》题集一、选择题（每题3分，共30分）1.生物信息学的主要研究对象是什么？A. 蛋白质结构B. 基因序列C. 生态系统D. 细胞代谢2.下列哪项技术不是生物信息学中常用的数据库技术？A. BLASTB. GenBankC. PubMedD. SWISS-PROT3.在生物信息学中，进行多序列比对时常用的软件是什么？A. MATLABB. ClustalWC. ExcelD. PowerPoint4.哪种算法常用于基因表达数据的聚类分析？A. K-meansB. DijkstraC. A*D. Floyd5.生物信息学中，下列哪项不是常用的序列分析技术？A. PCRB. 测序C. 质谱分析D. 芯片技术6.下列哪项不是生物信息学在医学领域的应用？A. 疾病诊断B. 药物设计C. 天气预报D. 个性化医疗7.下列哪项技术常用于生物大分子的结构预测？A. NMRB. X射线衍射C. 同源建模D. 质谱分析8.在生物信息学中，下列哪项不是基因注释的内容？A. 基因功能B. 基因表达水平C. 基因在染色体上的位置D. 基因的长度9.下列哪项技术不是高通量测序技术？A. Sanger测序B. Illumina测序C. 454测序D. SOLiD测序10.下列哪项不是生物信息学在农业领域的应用？A. 作物育种B. 病虫害防治C. 土壤成分分析D. 农产品品质改良二、填空题（每题2分，共20分）1.生物信息学是一门交叉学科，它主要涉及______、计算机科学和数学等领域。

2.在生物信息学中，______技术常用于基因序列的相似性搜索。

3.生物信息学在药物研发中的主要应用包括______和药物靶点的预测。

4.在基因表达数据分析中，______是一种常用的数据标准化方法。

5.生物信息学中，______技术常用于蛋白质结构的预测和分析。

6.在生物信息学数据库中，GenBank主要存储的是______数据。

生物信息学考试试题一、选择题（每题 3 分，共 30 分）1、以下哪种不是常见的生物信息学数据库？（）A GenBankB SWISSPROTC PubMedD Baidu2、在 DNA 序列分析中，以下哪个不是用于序列比对的算法？（）A NeedlemanWunsch 算法B SmithWaterman 算法C BLAST 算法D Fourier 变换算法3、蛋白质结构预测的方法不包括（）A 同源建模B 从头预测C 折叠识别D 随机模拟4、以下哪种不是基因表达数据分析的常用方法？（）A 聚类分析B 主成分分析C 判别分析D 回归分析5、生物信息学中，用于预测蛋白质功能的方法有（）A 基于序列相似性B 基于结构相似性C 基于基因共表达D 以上都是6、在基因组学中，以下哪个不是测序技术？（）A Sanger 测序B 二代测序C 三代测序D 四代测序7、系统发生树构建的方法不包括（）A 距离法B 最大简约法C 最大似然法D 最小二乘法8、以下哪种不是生物信息学中常用的编程语言？（）A PythonB JavaC C+＋D Visual Basic9、以下哪个不是生物信息学在医学领域的应用？（）A 疾病诊断B 药物研发C 医疗美容D 个性化医疗10、生物信息学中，处理大规模数据常用的工具是（）A ExcelB R 语言C SPSSD Word二、填空题（每题 2 分，共 20 分）1、生物信息学是一门融合了生物学、计算机科学和（）的交叉学科。

2、常见的核酸序列格式有 FASTA 和（）。

3、蛋白质的二级结构包括α螺旋、β折叠和（）等。

4、基因芯片技术是一种（）分析技术。

5、序列比对的目的是寻找两个或多个序列之间的（）。

6、人类基因组计划的主要目标是测定人类基因组的（）序列。

7、生物信息学中的隐马尔可夫模型主要用于（）。

8、系统发生分析中，外群的作用是（）。

9、蛋白质相互作用网络分析有助于理解（）。

10、生物信息学数据库可以分为一级数据库和（）数据库。

武汉大学2007—2008学年度高校教师研修班《生物信息学》试卷（B）及答案一、翻译下列名词并解释。

(每题5分，共25分)1. HGP2. SRS3. Markov Chain4. ANN5. CDS二、填空(每空2分，共20分)1、生物信息学主要研究的两种信息载体是和。

2、目前国际上主要的核酸数据库是由建立和维护的、由维护的，和日本遗传研究所建立和维护的。

每个机构负责收集来自不同地理分布的数据， 3 个数据库所有信息并向世界开放，3、在进行序列两两比对时，有两方面问题直接影响相似性分值：和。

三、解释说明：请按要求对下列GenBank文件作解释说明。

(每小题4分，共20分)1、LOCUS行中的第3项mRNA linear表示，这里是。

2、DEFINITION行在GenBank记录中用以3 ACCESSION 是，是从数据库中检索一个记录的主要。

4. FEATURES后面部分是，直接表达了记录的生物背景知识，5 CDS 30…533 表示。

四、问答。

（共35分）1、DNA测序有哪些方法？其基本原理是什么？（10分）2、简述蛋白质结构预测的基本思想和方法。

（10分）3、试述人类基因组计划与生物信息学的关系。

（15分）《生物信息学》试卷（B）答案一、翻译下列名词并解释。

(每题5分，共25分)1. HGP Human genome project人类基因组计划2. SRS Sequence Retrieval System 序列检索系统3. 马尔科夫链（Markov Chain），对于生物分子序列分析，马尔科夫链是一个很好的数学统计模型，因为马尔科夫链本身就是相继发生事件的序列，其特征是对于事件序列中的任何一个事件都有一个发生概率，而这个概率依赖于该事件之前的若干个事件。

4. ANN Artificial Neural Network, 人工神经网络5. CDS指的是编码序列,从起始密码子到终止密码子二、填空(每空2分，共20分)1、生物信息学主要研究的两种信息载体是DNA分子和蛋白质分子2、目前国际上主要的核酸数据库是由美国国立生物技术信息中心建立和维护的Genbank库、由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的EMBL-Bank，和日本遗传研究所建立和维护的日本DNA 数据仓库(DDBJ)。

生物信息考试题及答案一、选择题（每题2分，共20分）1. 基因组学研究的核心是（）。

A. 基因克隆B. 基因表达C. 基因组序列D. 基因功能答案：C2. 下列哪项不是生物信息学的主要研究内容？（）A. 基因组序列分析B. 蛋白质结构预测C. 植物分类学D. 基因表达分析答案：C3. 转录组学研究的是（）。

A. 基因组中的所有基因B. 特定细胞或组织中的所有RNA分子C. 特定细胞或组织中的所有蛋白质分子D. 特定细胞或组织中的所有DNA分子答案：B4. 下列哪个数据库主要用于存储蛋白质序列信息？（）A. GenBankB. PDBC. Swiss-ProtD. EMBL答案：C5. 以下哪个不是生物信息学中常用的序列比对工具？（）A. BLASTB. FASTAC. ClustalWD. PCR答案：D6. 以下哪个是用于蛋白质三维结构预测的软件？（）A. Swiss-ProtB. PDBC. MODELLERD. GenBank答案：C7. 以下哪个是用于基因表达分析的高通量技术？（）A. Sanger测序B. 微阵列C. PCRD. 质谱分析答案：B8. 下列哪个是用于基因组关联研究的统计方法？（）A. 聚类分析B. 系统发育分析C. 连锁不平衡分析D. 多态性分析答案：C9. 以下哪个是用于蛋白质-蛋白质相互作用网络分析的工具？（）A. STRINGB. BLASTC. ClustalWD. GenBank答案：A10. 下列哪个是用于生物信息学数据可视化的工具？（）A. R语言B. PythonC. CytoscapeD. Perl答案：C二、填空题（每题2分，共20分）1. 生物信息学是一门结合了__________、__________和__________的交叉学科。

答案：生物学、计算机科学、信息技术2. 基因组学中的“组”指的是__________的集合。

答案：基因3. 转录组学研究的RNA分子包括__________、__________和__________。

生物信息试题及答案考题一：1. 什么是生物信息学？生物信息学是一门综合学科，它融合了生物学、计算机科学和统计学等领域的知识和技术，旨在通过对生物序列、结构、功能和进化等信息的收集、管理、分析和应用，揭示生命现象和生物体的特性。

2. 生物信息学在生物研究中的应用有哪些？生物信息学在生物研究中有多种应用，包括：- 基因组学研究：通过对基因组序列的分析，探索基因组结构和功能，识别基因、编码蛋白质和非编码RNA等基因组元件。

- 转录组学研究：通过对转录组数据的分析，研究基因表达谱、异构剪切和转录调控等过程。

- 蛋白质组学研究：通过对蛋白质组数据的分析，研究蛋白质互作网络、翻译后修饰和蛋白质结构与功能等问题。

- 代谢组学研究：通过对代谢产物谱数据的分析，研究代谢途径、代谢物互作和生物样本间的代谢差异。

- 生物信息学工具开发：开发生物信息学软件和数据库，提供数据分析、可视化和挖掘的工具，并推动生物信息学的技术创新。

考题二：1. 生物序列中常见的两类序列是什么？生物序列中常见的两类序列是DNA序列和蛋白质序列。

2. 请简要解释DNA序列和蛋白质序列的意义。

DNA序列是生物遗传信息的载体，它决定了生物体的遗传特征和功能。

通过分析DNA序列，我们可以识别基因、预测基因功能，研究基因组结构和进化过程。

蛋白质序列是DNA翻译后产生的，蛋白质是生物体内多种生物学功能的主要执行者。

分析蛋白质序列可以预测蛋白质的结构和功能，从而理解生物体内蛋白质相互作用、代谢途径和信号传导等重要生物过程。

考题三：1. 什么是基因组学？基因组学是研究生物体基因组的学科，它包括了对基因组序列、结构、功能和进化等多个方面的研究。

基因组是一个生物体所有基因的集合，通过对基因组的研究，可以揭示生物体的遗传信息和特征。

2. 基因组学研究的主要内容有哪些？基因组学研究的主要内容包括以下几个方面：- 基因组测序：通过高通量测序技术，获取生物体基因组的序列信息。

生物信息试题及答案一、选择题（每题2分，共20分）1. 生物信息学的主要研究对象是（）。

A. 蛋白质结构B. 基因组序列C. 细胞信号传导D. 生物分子相互作用答案：B2. 以下哪项不是生物信息学的主要任务？（）A. 基因预测B. 蛋白质功能预测C. 疾病诊断D. 植物分类学研究答案：D3. 人类基因组计划的主要目标是（）。

A. 确定人类基因组中的所有基因B. 确定人类基因组中的所有蛋白质C. 确定人类基因组中的所有核苷酸序列D. 确定人类基因组中的所有代谢途径答案：C4. 以下哪种生物信息数据库不是公共数据库？（）A. GenBankB. Swiss-ProtC. PDBD. Myriad Genetics答案：D5. 在生物信息学中，BLAST是一种（）。

A. 基因克隆技术B. 基因表达分析软件C. 序列比对工具D. 蛋白质结构预测方法答案：C6. 以下哪种序列分析方法不适用于大规模基因组数据？（）A. 多重序列比对B. 单序列比对C. 基因预测D. 基因家族分析答案：B7. 以下哪种技术不是用于蛋白质结构预测的？（）A. 同源建模B. 从头预测C. 基因克隆D. 蛋白质折叠模拟答案：C8. 以下哪种生物信息学工具主要用于蛋白质功能预测？（）A. PfamB. BLASTC. ClustalWD. Swiss-Prot答案：A9. 以下哪种生物信息学数据库专门存储蛋白质结构数据？（）A. GenBankB. Swiss-ProtC. PDBD. KEGG答案：C10. 在生物信息学中，以下哪种数据类型不是高通量数据？（）A. 基因表达数据B. 蛋白质组数据C. 代谢组数据D. 单个基因序列答案：D二、填空题（每题2分，共20分）1. 生物信息学是应用__________和__________技术，研究生物大分子结构、功能和相互作用的科学。

答案：计算机；信息技术2. 人类基因组计划完成于__________年。

生物信息学答题卷考题一：到蛋白质序列数据库中查询一条杆状病毒(Baculovirus)DNA聚合酶（DNA polymerase)的完整序列，写出序列名称、登录号及来源物种的分类情况，然后用Blast（注意：写出所用程序及所搜索的数据库名称）搜索到数据库中和它相似程度较高的10条序列（写出这些序列的名称和登陆号及来源物种的分类情况。

要求至少包括3-4个属，每个属中选择1-2个种），对这10条序列进行多序列比对后（写出比对所用程序及比对结果），使用phylip软件，用距离法对它们进行分子进化分析(包括对进化树进行统计评估)，说明这种蛋白质的进化历程（60分）。

答：（1）到蛋白质序列数据库中查询一条杆状病毒(Baculovirus)DNA聚合酶（DNA polymerase)的完整序列如下：完整序列（ORIGIN）：1 mastdsldtr tfdyasdssf eviiitnaph dydgyielga aarllapfqk nisalwtnaa61 pshkltrnnk nylhvfglfk ylqnynlntk khppeyytik svicdlmmga qgktfdplce121 iktqlcaiqe slneaivtln ghaaadpapr tearelvesl hseyskkltf atdtildhvk181 sikdlvclnk序列名称: capsid protein [Choristoneura fumiferana MNPV]即：云杉卷叶蛾(虎尾松卷叶蛾)颗粒体病毒具体信息：LOCUS NP_848433 190 aa linear VRL06-MAY-2009登录号(ACCESSION): NP_848433来源物种的分类情况SOURCE Choristoneura fumiferana MNPVORGANISM Choristoneura fumiferana MNPVViruses; dsDNA viruses, no RNA stage; Baculoviridae;Alphabaculovirus.FEATURES Location/Qualifierssource 1..190/organism="Choristoneura fumiferana MNPV"/db_xref="taxon:208973"/country="Ireland"（2）然后用Blast搜索和它相似程度较高的10条序列如下：说明：所用程序:blosum62所搜索的数据库名称:swissprot数据库中和它相似程度较高的10条序列1、RecName: Full=Capsid protein p24名称：RecName: Full=Capsid protein p24LOCUS VP24_NPVOP 192 aa linear VRL 11-JAN-2011登录号：P24078来源物种的分类情况：SOURCE Orgyia pseudotsugata MNPVORGANISM Orgyia pseudotsugata MNPVViruses; dsDNA viruses, no RNA stage; Baculoviridae;Alphabaculovirus.FEATURES Location/Qualifierssource 1..192/organism="Orgyia pseudotsugata MNPV"/host="Orgyia pseudotsugata (Douglas fir tussock moth)"/db_xref="taxon:262177"2、RecName: Full=Capsid protein p24名称：RecName: Full=Capsid protein p24LOCUS VP24_NPVAC 198 aa linear VRL 11-JAN-2011登录号：P41678来源物种的分类情况：SOURCE Autographa californica nucleopolyhedrovirusORGANISM Autographa californica nucleopolyhedrovirusViruses; dsDNA viruses, no RNA stage; Baculoviridae;Alphabaculovirus.FEATURES Location/Qualifierssource 1..198/organism="Autographa californica nucleopolyhedrovirus"/host="Lepidoptera (butterflies and moths)"/db_xref="taxon:46015"3、RecName: Full=Flagellar motor switch phosphatase FliY; AltName: Full=CheY-P phosphatase FliY; AltName: Full=Flagellar motor switch protein FliY名称：RecName: Full=Flagellar motor switch phosphatase FliY; AltName: Full=CheY-P phosphatase FliY; AltName: Full=Flagellar motor switch protein FliYLOCUS FLIY_BACSU 378 aa linear BCT 08-FEB-2011登录号：P24073来源物种的分类情况：SOURCE Bacillus subtilisORGANISM Bacillus subtilisBacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus.FEATURES Location/Qualifierssource 1..378/organism="Bacillus subtilis"/db_xref="taxon:1423"4、RecName: Full=Uncharacterized protein YjeA名称：RecName: Full=Uncharacterized protein YjeALOCUS YJEA_HAEGA 322 aa linear BCT 30-NOV-2010登录号：Q9ZIY0来源物种的分类情况：SOURCE Avibacterium paragallinarumORGANISM Avibacterium paragallinarumBacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pasteurellales;Pasteurellaceae; Avibacterium.FEATURES Location/Qualifierssource 1..322/organism="Avibacterium paragallinarum"/db_xref="taxon:728"5、RecName: Full=Protein YOP1名称：RecName: Full=Protein YOP1LOCUS YOP1_USTMA 172 aa linear PLN 08-MAR-2011 登录号：Q4P0H0来源物种的分类情况：SOURCE Ustilago maydisORGANISM Ustilago maydisEukaryota; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Ustilaginomycotina;Ustilaginomycetes; Ustilaginales; Ustilaginaceae; Ustilago. FEATURES Location/Qualifierssource 1..172/organism="Ustilago maydis"/db_xref="taxon:5270"6、RecName: Full=Protein anon-37Cs名称：RecName: Full=Protein anon-37CsLOCUS A37C_DROLE 544 aa linear INV 10-AUG-2010 登录号：O96570来源物种的分类情况：SOURCE Scaptodrosophila lebanonensisORGANISM Scaptodrosophila lebanonensisEukaryota; Metazoa; Arthropoda; Hexapoda; Insecta; Pterygota;Neoptera; Endopterygota; Diptera; Brachycera; Muscomorpha;Ephydroidea; Drosophilidae; Scaptodrosophila.FEATURES Location/Qualifierssource 1..544/organism="Scaptodrosophila lebanonensis"/db_xref="taxon:7225"7、RecName: Full=Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1; Short=PsaA名称：RecName: Full=Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1; Short=PsaA LOCUS PSAA_SYNPW 767 aa linear BCT 08-FEB-2011登录号：Q9R6U0来源物种的分类情况：SOURCE Synechococcus sp. WH 7803ORGANISM Synechococcus sp. WH 7803Bacteria; Cyanobacteria; Chroococcales; Synechococcus.FEATURES Location/Qualifierssource 1..767/organism="Synechococcus sp. WH 7803"/db_xref="taxon:32051"8、RecName: Full=UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase; AltName:Full=UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase名称：RecName: Full=UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase; AltName:Full=UDP-N-acetylmuramate dehydrogenaseLOCUS MURB_CAMJE 258 aa linear BCT 08-FEB-2011登录号：Q9PM01来源物种的分类情况：SOURCE Campylobacter jejuniORGANISM Campylobacter jejuniBacteria; Proteobacteria; Epsilonproteobacteria; Campylobacterales;Campylobacteraceae; Campylobacter.FEATURES Location/Qualifierssource 1..258/organism="Campylobacter jejuni"/db_xref="taxon:197"9、RecName: Full=UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase; AltName:Full=UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase名称：RecName: Full=UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase; AltName:Full=UDP-N-acetylmuramate dehydrogenaseLOCUS MURB_CAMJR 258 aa linear BCT 08-FEB-2011登录号：Q5HSB7来源物种的分类情况：SOURCE Campylobacter jejuni RM1221ORGANISM Campylobacter jejuni RM1221Bacteria; Proteobacteria; Epsilonproteobacteria; Campylobacterales;Campylobacteraceae; Campylobacter.FEATURES Location/Qualifierssource 1..258/organism="Campylobacter jejuni RM1221"10、RecName: Full=Probable molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A 名称：RecName: Full=Probable molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A LOCUS MOBA_METAC 225 aa linear BCT 03-MAY-2011登陆号：Q8TPD6来源物种的分类情况：SOURCE Methanosarcina acetivorans C2AORGANISM Methanosarcina acetivorans C2AArchaea; Euryarchaeota; Methanomicrobia; Methanosarcinales;Methanosarcinaceae; Methanosarcina.FEATURES Location/Qualifierssource 1..225/organism="Methanosarcina acetivorans C2A"/db_xref="taxon:188937"搜索过程附图：（3）对这10条序列进行多序列比对:写出比对所用程序:clustalx比对结果分析：比对所得的以phy为后缀的文件用写字板格式打开后得如下结果： 10 771P24078.1 ---------- ---------- ------MANA DSLDAR-AFS YAPDASFEVIP41678.1 ---------- ---------- ---------- ----TR-NFM YSPDSSLEVVQ9R6U0 ---------- TAKTQVEKVD NPATFELFGK PGHFDR-ALA KGPKTTTWVWQ3AMS5.1 MTISPPERGS DAKSQVEKVD NPATFELFGK PGHFDR-ALA KGPKTTTWVWQ9PM01.1 ------MIID FKKYSSVRIG NEFEVLVLDQ ICDFDG-FLI GGANN----LQ4P0H0 ---------- ---------- -KVEYFVAQI DKELSRYPAL KKFEQTVPVPQ9ZIY0.1 ------SIQT LLSRAKIIAE IRQFFSERGL LEVETPILSE FGVTDVHLSTP24073.2 --IDALLNGT GSTLDEPEIP EVDDLSEMER DAIGEIGNIS FGSSATALSTO96570 ---------E SLSFSGYKLT RRNLYNAPAL KVMGRSVNNS SSNNNDQQQYQ8TPD6.1 ---------- ---------- MSGKTELKPG RTKSRSAIVL AGGRGRRMGMIITNAPNDHD GY---LELNA AARL-LAPFQ KN-ISALWTS ----------IITNSDGDHD GY---LELTA AAKV-MSPFL SNGSSAVWTN ----------NLHANAHDFD SHTSDLEEVS RKIF-SAHFG HLAVIFIWLS GAFFHGARFSNLHANAHDFD AHTSDLQEVS RRIF-SAHFG HLAVIFIWLS GAFFHGARFSLVSPKPKNIG ILGDGFNFIQ ILDR-NKDFI HLRIGCKTKS S---------KAYAALGAFG IFTLFVFFNI AAGF-LTNLL GFFVPAYFS- ----------FSTKLISPFQ KKEKTLWLST SPEYPMKRLL SAGSGAIFQL CKVFRN---ELLNQKVDITT PSVTVIPRSK ISDAFPEPYV AIEVNYTEGF SG--------NLESAKQNTQ IVVIGAGLAG LSAAQHLLRH GFRSTIVLEA TDRYGG---RVEKALLEFEG KTILERLLEN LFRVVDEVIL SVRDIPQKEK ----------……（此处省略约9KB的数据分析结果）以上是多序列比对的纯数据结果，部分数据省略，因为可以从下面的进化树得到具体的分析。

第一单元生物信息学引论1人基因组大小约为:BA. 3.1*10A10bpB.3.1*10A9bpC.3.1*10A8bpD.3.1*10A7bp2（单选题|1分）人基因组大约有多少是编码蛋白的基因区间:CA.10%B.30%C.不足5%D.90%3（单选题|1分）Genbank数据库存储的数据是什么AA.核酸序列B.蛋白结构C.核酸结构D.蛋白序列4（单选题|1分）SRA数据库存储的数据是什么CA.存储基因芯片的数据B.存储Sanger测序数据C.存储新一代测序技术的数据5（单选题|1分）高通量测序错误率和传统Sanger测序相比AA.低B.高C.差不多6（单选题|1分）生物信息学对数据的处理一般是一个什么样的过程AA.数据管理-数据计算-数据挖掘-建立模型/进行预测B.数据挖掘-数据管理-建立模型/进行预测-数据计算C.数据挖掘-数据管理-数据计算-建立模型/进行预测D.建立模型/进行预测-数据挖掘-数据管理-数据计算7（单选题|1分）Sanger测序哪年发表DA.1965B.2002C.1970D.19778（单选题|1分）人基因组计划哪年启动?哪一年发表草图?CA.1988-2004B.1977-2001C.1988-2001D.1990-20039（单选题|1分）PAM打分矩阵是为什么设计的AA.氨基酸替换B.核苷酸替换10（单选题|1分）序列匹配（比对）算法哪年出现：DA.1991B.1977C.1988D.1970第二单元生物学基础、数据库基础和网络与数学及算法基础）1•以下哪一个是mRNA条目序列号：BA.J01536B.NM_15392C.NP_52280D.AAB1345062（单选题|1分）确定某个基因在哪些组织中表达的最直接获取相关信息方式是：AA.UnigeneB.EntrezC.LocusLinkD.PCR3（单选题|1分）一个基因可能对应两个Unigene簇吗？：AA.可能B.不可能4（单选题|1分）下面哪种数据库源于mRNA信息：AA.dbESTB.PDBC.OMIMD.HTGS5（单选题|1分）下面哪个数据库面向人类疾病构建：CA.ESTB.PDBC.OMIMD.HTGS6（单选题|1分）Refseq和GenBank有什么区别：CA.Refseq包括了全世界各个实验室和测序项目提交的DNA序列B.GenBank提供的是非冗余序列C.Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息D.GenBank源于Refseq7（单选题|1分）如果你需要查询文献信息，下列哪个数据库是你最佳选择：CA.OMIMB.EntrezC.PubMedD.PROSITE8（单选题|1分）比较从Entrez和ExPASy中提取有关蛋白质序列信息的方法，下列哪种说法正确：CA.因为GenBank的数据比EMBL更多，Entrez给出的搜索结果将更多B.搜索结果很可能一样，因为GenBank和EMBL的序列数据实际一样C.搜索结果应该相当，但是ExPASy中的SwissProt记录的输出格式不同1口49（单选题|1分）天冬酰胺、色氨酸和酪氨酸的单字母代码分别对应于：AA.N/W/YB.Q/W/YC.F/W/YD.Q/N/W10（单选题|1分）直系同源定义为：AA.不同物种中具有共同祖先的同源序列B.具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源序列C.同一物种中由基因复制产生的同源序列D.同一物种中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列11（单选题|1分）下列那个氨基酸最不容易突变：DA.丙氨酸B.谷氨酰胺C.甲硫氨酸D.半胱氨酸12（单选题|1分）PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变：DA.1%B.20%C.80%D.250%13（单选题|1分）下列哪个句子最好的描述了两个序列全局比对和局部比对的不同：DA.全局比对通常用于比对DNA序列，而局部比对通常用于比对蛋白质序列B.全局比对允许间隙，而局部比对不允许C.全局比对寻找全局最大化，而局部比对寻找局部最大化D.全局比对比对整体序列，而局部比对寻找最佳匹配子序列14（单选题|1分）假设你有两条远源相关蛋白质序列。

生物信息学考试试题1. 选择题1. DNA序列中哪种碱基与腺嘌呤形成碱基对？A. 腺嘌呤B. 胸腺嘧啶C. 钝甲嘧啶D. 尿嘧啶2. 下列哪种不属于生物信息学中常用的序列比对软件？A. BLASTB. ClustalWC. PhotoshopD. MEGA3. 在生物信息学中，什么是基因组装？A. 把基因组序列和蛋白质序列对应起来B. 把已知的DNA序列分析并组装成完整的基因组C. 把DNA序列和RNA序列对比分析D. 把基因组序列转录为RNA序列4. 下列哪个软件主要用于预测DNA序列中的基因结构？A. BLASTB. ClustalWC. FGENESD. MEGA5. 在生物信息学中，什么是密码子？A. DNA序列中的重复单元B. 氨基酸序列C. tRNA分子上的核苷酸组合D. mRNA上的三联体核苷酸序列2. 简答题1. 请简要解释生物信息学在基因组学中的应用。

2. 什么是序列比对？序列比对的意义是什么？3. 解释基因组装和基因注释在生物信息学中的作用。

4. 生物信息学中常用的两种序列分析方法分别是什么？简要描述它们的原理。

5. 请简要介绍生物信息学在进化比较基因组学中的应用。

3. 计算题1. 给定以下两条序列，求它们的相似度：序列1: ATCGTCCGATT序列2: ATCGACCGTTA2. 已知一个DNA序列长度为1000bp，其中AT含量为60%，求该序列中GC含量百分比。

4. 应用题1. 请利用BLAST软件对一组已知DNA序列进行序列比对，并解释结果。

2. 请使用ClustalW对两个已知蛋白质序列进行多序列比对，并分析比对结果。

3. 选取一个基因组装软件，对一个已知基因组序列进行装配，并解释装配结果。

以上是生物信息学考试试题，希望您认真作答，祝您考试顺利！。

河南农业大学《生物信息学学 2020-2021学年第一学期期末试卷《《《《《《《《《《《生物信息学》院/系——年纪——专业——姓名——学号——《《《一．选择题（每2分，共20分）1.《物信息学学主要关注的是（《）。

A.《物信大分子的合成B.《物信数据的收集、存储、分析和解释C.《物信系统的物态学关系D.《物信分子的信理性质2.《下列哪个不是物信息学学的主要应用领域？A.《基因组学B.《转录组学C.《蛋白质组学D.《分子物信学实验技术3.《在物信息学学中，用于描述物信序列中特定区域的特性的语言称为（《）。

A.《序列分析B.《序列比对C.《序列模式D.《序列注释4.《在进行基因组分析时，通常使用的数据库是（《）。

A.《PubMedB.《GenBankC.《PDBD.《UniProt5.《物信息学学中，BLAST是一种常用的（《）。

A.《序列比对工具B.《结构模拟软件C.《蛋白质功能预测方法D.《基因调控网络分析工具6.物信息学学是（《）。

《A.《研究物信大分子合成和降解的学科《B.《专门研究基因编辑技术的学科《C.《物信学与计算机科学的交叉学科，主要关注物信数据的收集、管理和分析《D.《研究物信进化历史的学科7.在物信息学学中，用于描述DNA序列中基因位置的数据库通常是（《）。

《A.《UniProt《B.《PDB《C.《Ensembl《D.《KEGG8.BLAST是一个常用的（《）。

《A.《蛋白质三维结构模拟软件《B.《基因表达谱分析工具《C.《局部序列比对搜索工具《D.《基因组组装软件9.下列哪个不是物信息学学在基因组学中的主要应用？（《）《A.《基因定位《B.《基因表达分析《C.《蛋白质结构预测《D.《基因编辑实验设计10.物信息学学中，用于预测蛋白质功能的常见方法不包括（《）。

《A.《序列比对《B.《结构域分析《C.《蛋白质-蛋白质相互作用网络《D.《分子物信学实验二、填空题（每题2分，共10分）1.《在物信息学学中，用于存储和检索核酸序列的数据库是___________。

生物信息学试题及答案一、单项选择题（每题2分，共20分）1. 生物信息学的主要研究对象是（）。

A. 生物数据B. 生物实验C. 生物模型D. 生物技术答案：A2. 下列哪项不是生物信息学中的常用数据库（）。

A. GenBankB. Swiss-ProtC. PubMedD. Google Scholar答案：D3. 蛋白质序列比对的主要目的是（）。

A. 确定蛋白质的三维结构B. 预测蛋白质的功能C. 比较蛋白质的氨基酸序列D. 计算蛋白质的分子量答案：B4. 在生物信息学中，以下哪种算法不是用于序列比对的（）。

A. BLASTB. FASTAC. Smith-WatermanD. Hidden Markov Model答案：D5. 下列哪种生物信息学工具主要用于基因表达分析（）。

A. ClustalWB. Primer3C. R语言D. PDB答案：C6. 以下哪种技术不是用于蛋白质结构预测的（）。

A. 同源建模B. 从头预测C. 序列比对D. 折叠识别答案：C7. 以下哪种生物信息学工具主要用于基因组注释（）。

A. BLASTC. GATKD. Primer3答案：B8. 在生物信息学中，以下哪种方法不用于基因表达数据的聚类分析（）。

A. K-meansB. Hierarchical clusteringC. Principal component analysisD. Multiple sequence alignment答案：D9. 下列哪种生物信息学工具主要用于蛋白质-蛋白质相互作用网络分析（）。

A. STRINGB. BLASTD. Primer3答案：A10. 在生物信息学中，以下哪种数据库不包含蛋白质结构信息（）。

A. PDBB. UniProtC. RCSBD. GenBank答案：D二、多项选择题（每题3分，共15分）11. 生物信息学中常用的序列比对工具包括（）。

A. BLASTB. FASTAC. ClustalWD. Pfam答案：ABC12. 以下哪些是生物信息学中常用的基因表达分析软件（）。