第十章微生物分类

第十章 微生物的分类和鉴定
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❖ 第一节 通用分类单元 ❖ 第二节 微生物在自然界的地位 ❖ 第三节 各大类微生物的分类系统纲要 ❖ 第四节 微生物分类鉴定的方法
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第一节 通用分类单元
❖ 分类是认识客观事物的一种基本方法。 我们要认识、研究和利用各种微生物资 源也必须对他们进行分类。
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❖ 常用的细菌分类术语
❖ 培养物（culture),是指一定时间一定空间内微 生物的细胞群或生长物。
❖ 种（species),是生物分类中基本的分类单元和 分类等级。是一大群表型特征高度相似，亲缘 关系极其接近、与同属内的其他物种有明显差 异的一大群菌株的总称。
❖ 型（form或type),常指亚种以下的细分，当同 种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以 分为心的亚种时，可以细分为不同的型。
其他 :某属中一个种或几个种时，属后加sp.或SPP.
Micrococcus sp.(spp.)一种或一批小单孢菌
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新名称的发表 根据细菌命名法规的规定，有效发表新 的细菌名称应在公开发行的刊物上进行，在菌种目 录、会议记录、会议论文摘要的均不能视为有效发 表。此外，若新名称是在国际系统细菌学杂志 （IJSB）以外的其他杂志上发表的，还必须经过新 名称的合格化发表，被认为合格后，在该杂志上定 期公布，命名日期即从公布之日算起，否则不算合 格发表，也不能取得国际上的承认。
发表新名称时，应在新名称之后加上所属新分 类等级的缩写词，如新目“ord.nov.”、新属 “gen.nov.”、新种“sp.nov.”等。
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俗名（common name）: 普通的、通俗的、地区性的名字，具有简明和大众
化的优点，但往往涵义不够确切，易于重复，使用范 围局限。
如 绿脓杆菌： 铜绿假单孢菌Pseudomonas aeruginosa 白念菌： 白色假丝酵母Candida albicans 金葡萄： 金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus
❖ 分类学内容涉及三个相互依存又有区别 的组成部分：分类、命名和鉴定。
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❖分类（classification）是根据一定的原则（表型 特征相似性或系统发育相关性）对微生物进行分 群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统， 并对各个分类群的特征进行描述，以便考察和对 未被分类的微生物进行鉴定；
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第二节 微生物在自然界的地位
科学家估计有分类纪录的各类物种大约有 150万，其中微生物超过10万种，而且其数 目还在不断增加。微生物学工作者要认识、 研究和利用微生物或控制有害微生物，必须 对它们进行分类（classification）。
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1、两界系统
动物界 Animalia：不具细胞壁，可运动，不进 行光合作用。
植物界 Plantae：具有细胞壁，不运动，可行光 合作用。
三界：原生生物界 Protista：（E. H. Haeckel, 1866年提出）
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2、五界系统
R. H. Whitakker, Science, 163: 150-160, 1969 原核生物界 Monera：细菌、放线菌等 原生生物界 Protista：藻类、原生动物、粘菌等 真菌界 Fungi：酵母、霉菌 动物界 Animalia： 植物界 Plantae： 五界系统是以细胞结构分化的等级以及和光合、吸收、 摄食这三种主要营养方式有关的组织类型为基础的。 六界：加上病毒界。
如Aspergillus niger
曲霉
黑色的 黑曲霉
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当微生物是一个亚种或变种时，应按三名法命名 既：学名=
属名+种名+（subsp或var）+亚种（变种）名称
排斜体
排源自文库体（可省略） 排斜体 （不可省略）
如：椭圆酿酒酵母
Saccharomyces cerevisiae （subsp/var）ellipsoideus
排斜体字
排正体字（一般省略）
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如：大肠杆菌:
Escherichia coli (Migula) Castellani&Chalmers 1919 属名: 名词,大写首字母,一般描绘主要形态或
生理特征。 种名:形容词,小写,代表一个种次要特征。
未确定种名或不指特定的种时，可在属名后加sp.（表 示单数）或SPP.（表示双数）表示。
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3.三界（域）系统 Woese用寡核苷酸序列编目分析法对60多株细菌的
16SrRNA序列进行比较后发现：产甲烷细菌完全没有作 为细菌特征的那些序列，于是提出了生命的第三种形式 -古细菌(archaebacteria)。随后对包括某些真核生物在内 的大量菌株进行了16Sr RNA(18SrRNA)序列的分析比较， 又发现极端嗜盐菌和极端嗜酸嗜热菌也和产甲烷细菌一 样， 具有既不同其他细菌也不同于其核生物的序列特征， 而它们之间则具有许多共同的序列特征。
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v菌株（strain)或品系，从自然界分离得到的任何一种 微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株；用 实验方法（如通过诱变）所获得的某一菌株的变异型， 也可以称为一个新的菌株，以便与原来的菌株相区别。
v模式菌株：一个被指定为能代表一个种群的菌株，是 活体标本
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界Kingdom 门Phylum——亚门 纲Class——亚纲 目Order——亚目 科Family——亚科 属Genus 种Species
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二、微生物的命名规则： 命名按照《国际细菌命名法规》，一般
采用林奈氏双名法。
学名=
属名 + 种名 +（首次命名人）+现在命名人+现名命名时间
❖命名（nomenclature）是根据命名法规，给每 一个分类群一个专有的名称；
❖鉴定（identification或determination）
则是指借助于现有的微生物分类系统，通过特征测 定，确定未知的、新发现的或未明确分类地位的 微生物所应归属分类群的过程。
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一.分类单元及其等级