代谢组学的研究方法和研究流程分子微生物学１12３０0０0３林兵随着人类基因组计划等重大科学项目的实施，基因组学、转录组学及蛋白质组学在研究人类生命科学的过程中发挥了重要的作用，与此同时, 代谢组学(ｍｅtaｂoloｍiｃs）在2０世纪90年

代谢组学的数据分析技术摘要：代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。其研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。先进分

代谢组学在医药领域的应用与进展一、学习指导1.学习代谢组学的概念及内涵，掌握代谢组学的研究对象与分析方法。2.熟悉代谢组学数据分析技术手段3.了解代谢组学优势特点4.了解代谢组学在医药领域的应用5.了解代谢组学发展趋势二、正文基因组功能解析

代谢组学综述摘要：代谢组学是20世纪90年代中期发展起来的对某一生物或细胞所有低相对分子质量代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科,由于其广泛的应用前景,目前已成为系统生物学的重要组成部分。现简要介绍了代谢组学的含义、代谢组学研究的历史沿革

代谢组学研究中数据处理新方法的应用李　晶1,吴晓健1,刘昌孝1,23,元英进1(1.天津大学化工学院制药工程系,天津300072;2.天津药物研究院药物动力学与药效动力学省部共建国家重点实验室,天津300193)摘要:目的　探索代谢组学研究

9/45多元统计分析可以在不具备样品任 何分组信息的情况下对 数据进行降维处理，使 得样本代谢表型的内在 关系变得可视化。主成分分析 （PCA）聚类 分析偏最小二乘-判别分析 （P

二、GC-MS和LC-MS5、LC/MS 分析目前没有可用于LC/MS 鉴定的谱库。但由于LC/MS 分析中 通常都有分子离子，其质量可以用代谢物数据库进行检索，如 METLIN

代谢组学小常识概念：•代谢组：指一个细胞、组织或器官中所有代谢物的集合, 包含一系列不同类型的小分子（通常分子量•代谢组学：通过考察生物体系（细胞、组织或生物体）受刺激或扰动后，其代谢产物的变化或其随时间的变化，来研究生物体系的一门科学。实

代谢组学分析系统1.工作条件：电压：220V（±10%）单相，50Hz(±1)。环境温度：19-22o C相对湿度：* 2.设备用途和基本组成仪器用途：所提供仪器为高分辨率，高灵敏度、高通量的分析系统，配以专业的数据分析处理软件构成代谢组学

簇类分析(Hierarchical Cluster Analysis ,HCA) 簇类的独立软模式分类法(Soft In- dependent Modeling of Class

代谢组学是一门对某一生物或细胞所有低分子质量代谢产物（以相对分子质量代谢组学分析数据用于统计分析时，数据集通常为一个N ×K 的矩阵（X矩阵），N表示N个样本数，每一行代表一个样品，K表示K个变量，每一列代表一个变量，在代谢组学中变量通常是

◇专论◇中国临床药理学与治疗学中国药理学会主办CN 3421206/R ,ISSN 100922501E 2mail :ccpt96@ 2010May ;15(5):481-4892010203211收稿　2010204224修回E 2ma

植物代谢组学的研究方法及其应用近年来，随着生命科学研究的发展，尤其是在完成拟南芥(Arabidopsis thaliana) 和水稻(Oryza sativa) 等植物的基因组测序后，植物生物学发生了翻天覆地的变化。人们已经把目光从基因的测

1H-NMR 代谢组学样本处理——双相提取法细胞1.收集细胞，1500rpm/min，5min，4℃离心，弃上清2.预冷PBS洗两次，1500rpm/min，5min，4℃离心。3.将细胞转移至2mlEP管中，PBS润洗离心管，对应转移。4

代谢组学小常识概念：•代谢组：指一个细胞、组织或器官中所有代谢物的集合, 包含一系列不同类型的小分子（通常分子量•代谢组学：通过考察生物体系（细胞、组织或生物体）受刺激或扰动后，其代谢产物的变化或其随时间的变化，来研究生物体系的一门科学。实

A代谢组学-资料C外部或内部刺激↓生物系统(机体)↓基因→转录→翻译→代谢↓基因组学转录组学蛋白质组学代谢组学↓数据处理↓知识或模型系统生物学:用系统的观点或方法研究生物体系,以获

核磁共振代谢组学样品处理数据分析Protocol1H-NMR 代谢组学样本处理——双相提取法细胞1. 收集细胞，1500rpm/min，5min，4℃离心，弃上清2. 预冷PBS洗两次，1500rpm/min，5min，4℃离心。3. 将细

*国家自然科学基金资助（81172767）；高等学校博士学科专项基金（20122307110004）1.哈尔滨医科大学卫生统计学教研室（150081）2.山东大学卫生统计学教研室Δ通信作者：李康，E-mail ：likang@ 代谢组学数据

关于标记物的筛选01通过统计图来选择通常，在多元统计分析（如PCA和PLS-DA）的载荷图（Loading plot）可以帮助我们选出对分类贡献较大的变量。在图中，我们可以选取距离原点较远的点作为潜在的生物标记物。此外，如果是两组比较，也可

簇类分析(Hierarchical Cluster Analysis ,HCA) 簇类的独立软模式分类法(Soft In- dependent Modeling of Class