第一讲：学科间的关联• 首先锁定研究对象：分子 + 环境，或者更大的体系 – 分子：单个或几个分子 ，千万个分子 – 环境：多个分子，连续介质 • 计算途径：原理 + 算法– 原理：物理学，化学，生物学 – 算法：数学、统计学同样的几个问题 1. 包含什么？tRNA, mRNA, protein, water 2. 有何关联？tRNA-mRNA; mRNA-

自组织临界性 (self organization criticality)幂律分布 power law钟形分布钟形分布成年人身高、体重 跳远的距离 苹果大小 。。。。。。幂律分布

2018/5/215二、有丝分裂和减数分裂中的相关计算间期 染色体复制 后期 着丝点分裂+减Ⅰ后期同源染色体分离 减Ⅱ后期姐妹染色单体分离 一个精原细胞产生2种4个精子 一

2018/9/1 22自由组合规律几种特定的杂交组合 亲代P AABB×aabb AaBb×aabb ↓杂交 ↓测交 AaBb AaBb Aabb aaBb aabb 1 1 ︰

2/4Aa1/4aa2020/12/141/4BB → 2/4Bb → 1/4bb →1/4BB → 2/4Bb → 1/4bb →1/4BB → 2/4Bb → 1/4bb →h

计算生物学复习题名词解释：ORFs----在DNA链上，由蛋白质合成的起始密码开始，到终止密码子为止的一个连续编码序列。算法---为了解决一个适当的公式化表示的问题而必须执行的一系列指令。相似性方法：利用一个基因组中已知功能的基因预测另一物种的未知基因Motif(基序)编辑距离---将一个字符串变换成另一个字符串所需要的最少编辑操作数目。d(v,w) = 把

2020年北京林业大学生科院计算生物学与生物信息学（0710Z2）研究方向、考试科目、参考书目、考研经验、复习指导一．研究方向01系统生物学二．初试考试科目①101思想政治理论②201英语一③714生物化学与分子生物学④847遗传学三．复试笔试科目专业综合考试（包括分子生物学，遗传学）四．参考书目1.初试参考书目714生物化学与分子生物学：【1】《生物化学》

cd常生长？为什么？15不能正常生长。白天 10光照强度为b时，无有机 物积累，而夜间消耗有机 物，从全天来看，有机物5 0 －5 －10b 5 a101520 25 30 35

Acute Inflammations Data Set(急性炎症数据集)数据摘要：The data was created by a medical expert as a data set to test the expert system, which will perform the presumptive diagnosis of two dise

名词解释(共21分，每小题3分)：Motif（基序）：调节蛋白(TF) 结合到一段DNA 序列，称这段DNA 序列为基序部分酶切:将样本DNA在有限的时间内进行酶切，结果，在某个概率下，任意两个（不一定是相邻的）位点间的区段可能没有发生酶切，因此会生成任意两个限制酶切位点间的片段。贪婪算法:是指在对问题求解时，总是做出在当前看来是最好的选择。也就是说，不从整

Wprod(E) = Πwe Assumption: Edge scores reflect independent confidence values. All containe

名词解释(共21分，每小题3分)：Motif：DNA、蛋白质等生物大分子中的保守序列。部分酶切：将样本DNA在有限的时间内进行酶切，结果，在某个概率下，任意两个（不一定是相邻的）位点间的区段可能没有发生酶切，因此会生成任意两个限制酶切位点间的片段。贪婪算法（登山法）：根本思想是逐步到达山顶，即逐步获得最优解，是解决最优化问题时的一种简单但适用范围有限的策略。

遗传学中的数学计算1．有关蛋白质的计算：①n个氨基酸分子脱水缩合形成m条多肽链（多肽链之间无肽键），失去的水分子数（s）和形成的肽键数（t）之间的关系式：s＝t＝n-m则：n=m+t(s).即：氨基酸分子数＝肽链数＋肽键数（失去的水分子数）②蛋白质的相对分子质量=氨基酸的相对分子质量总量－脱去的水分子的相对分子质量总量(以及脱去的其他原子等的相对质量总量)③

CS 374: Algorithms in Biology (Spring 2010) Ting Liu Paper referencePeacock, C.S. et al. Comparative genomic analysis of three Leishmania species that cause diverse human disease (

利用DNA甲基化450K array数据估计肿瘤细胞纯度与差异甲基化分析——《计算生物学编程语言》考试题目DNA甲基化是一类重要的表观遗传修饰，它可以通过控制基因表达在多种细胞过程中起作用，比如胚胎干细胞发育[1]，基因组印迹化[2, 3]，X染色体失活[4] 等等。其异常表达与包括癌症在内的多种人类疾病密切相关[5-12]。在单核苷酸水平上得到DNA甲基化

Breast Tissue Data Set(乳腺组织数据集)数据摘要：Dataset with electrical impedance measurements of freshly excised tissue samples from the breast.中文关键词：乳腺,组织,数据集,电阻抗,样本,英文关键词：Breast,Tissue,Data

C6H12O6 + 6O2 + 6H2O 酶 6CO2 + 12H2O + 能量180+2870KJ2、将某绿色植物的叶片放在特定的实验装置

碱基配对DNA : A-T（配对）,T-A, G-C, C-G RNA：A-G （配对）,G-A, G-C, C-G, G-U（错配）,U-G（错配）蛋白质、氨基酸、核酸与核苷酸氨

Balls & SticksSpace-fillingRibbonsTraceIsosurface结构多样性1CTF 1TIM 1A1O1K3R1NIK1AON三维结构比对

高中生物学习方法及超全计算公式总结！高中生物常用的记忆方法（1）简化记忆法即通过分析教材，找出要点，将知识简化成有规律的几个字来帮助记忆。例如DNA的分子结构可简化为“五四三二一”，即五种基本元素、四种基本单位、每种基本单位有三种基本物质、很多基本单位形成两条脱氧核酸链、成为一种规则的双螺旋结构。（2）联想记忆法即根据教材内容，巧妙地利用联想帮助记忆。在背诵