第二章微生物多样性总结

(5)高通量测序：环境微生物群落多样性分析微生物群落多样性的基本概念环境中微生物的群落结构及多样性和微生物的功能及代谢机理是微生物生态学的研究热点。长期以来，由于受到技术限制，对微生物群落结构和多样性的认识还不全面，对微生物功能及代谢机理方

微生物多样研究中的—β多样性分析概述一、β-多样性分析介绍1. β（Beta）Diversity：是对不同样品/不同组间样品的微生物群落构成进行比较分析。➢β多样性分析前的数据“来源”：1）OTUs的丰度信息表；2）OTUs之间的系统发生关

变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）普通的聚丙烯酰胺凝胶电泳只能通过片段大小不同在同一浓度的胶上电泳迁移率不同而分离不同的DNA片段，对于片段大小接近或相同的DNA片段无法做到有效地分离；DGGE(denaturing gradient g

微生物对碳源的利用能力则是表征环境微生物生长情况的主要指。BIOLOG ECO微平板技术可以用于估价环境微生物群落代谢多样性和功能多样性的研究。环境中物种多样性与物种的丰富度及均匀度相关，群落内组成的物种越丰富、均匀度越大，则该群落的多样性

微生物群落多样性分析方法的进展

革兰氏阳性细菌（Gram-positive bacteria）噬纤维菌属-黄杆菌属（Cytophaga-Flavobacterium） 浮霉状菌（Planctomycetales）

第27卷增刊V ol 127,Sup 1广西农业生物科学Journal o f Guangx i A g ric 1and Biol 1Science 2008年6月June,2008收稿日期:20080122。基金项目:广西大学博士启动基

在多元统计分析中，主成分分析是一种简化数据集的技术。主成分分析经常用于减少数据集的维数，同时保持数据集中对方差贡献最大的特征，从而有效地找出数据中最“主要”的元素和结构，去除噪音和

基于二代高通量测序的环境微生物多样性分析一般认为土壤、海洋、肠道等生态系统中的微生物数量繁多、种类多样。传统的培养方法只限于对环境样品中极少部分（0.1%-1%）可培养的微生物类群的研究，而变性梯度凝胶电泳（DGGE）、克隆文库等常规的分子

• 微生物可作为阐明生态和生物进化原理的模式, 因为它们容易操作、具有独特的交叉反应并在地 球上存在的历史悠久。• ……• 微生物资源的开发, 是21世纪生命科学生命力之 所在。如

微生物多样研究中的—β多样性分析一、β-多样性分析1. 样品间距离计算➢样品间的物种丰度分布差异程度可通过统计学中的距离进行量化分析，使用统计算法Euclidean，Bray-Curtis，Unweighted_unifrac，weight

原核微生物物种多样性中国地域辽阔，地形、气候、土壤和植被等自然条件极为复杂多样，这些决定了中国微生物物种群必然丰富多彩，但是由于中国微生物资源尚未进行全面调查研究，目前在中国科学院微生物菌种保藏中心(非医学微生物保藏中心)保藏的细菌60属，

微生物多样研究中的α 多样性指数分析一、多样性指数介绍➢多样性指数：是指物种多样性测定。➢主要有三个空间尺度：α多样性，β多样性，γ多样性。➢每个空间尺度的环境不同测定的数据也不相同。➢α多样性：主要关注局域均匀生境下的物种数目，因此也被称

基于二代高通量测序的环境微生物多样性分析一般认为土壤、海洋、肠道等生态系统中的微生物数量繁多、种类多样。传统的培养方法只限于对环境样品中极少部分（0.1%-1%）可培养的微生物类群的研究，而变性梯度凝胶电泳（DGGE）、克隆文库等常规的分子

-cell shapes: rods, cocci, spirals, filaments,amorphous, starshaped, squares,……-cell organ

第三节 基因重组和杂交育种基于分子杂交技术的分子标记核酸分子杂交技术是20 世纪70 年代发展起来的 一种崭新的分子生物学技术,它是基于DNA 分子碱 基互补配对的原理,用特异性的

环境微生物群落多样性分析微生物群落多样性的基本概念环境中微生物的群落结构及多样性和微生物的功能及代谢机理是微生物生态学的研究热点。长期以来，由于受到技术限制，对微生物群落结构和多样性的认识还不全面，对微生物功能及代谢机理方面了解的也很少。但

基于二代高通量测序的环境微生物多样性分析一般认为土壤、海洋、肠道等生态系统中的微生物数量繁多、种类多样。传统的培养方法只限于对环境样品中极少部分（0.1%-1%）可培养的微生物类群的研究，而变性梯度凝胶电泳（DGGE、克隆文库等常规的分子生

微基生物——解码微生物的奥秘微生物多样性分析方案NGS / 第二代测序技术 Illimina MiSeq 2*300bp 平台Roche 454 GS FLX 平台2015 年 1