生物信息学课后习题及答案 （由10级生技一、二班课代表整理） 一、绪论 1.你认为，什么是生物信息学？ 采用信息科学技术，借助数学、生物学的理论、方法，对各种生物信息（包括核酸、蛋白质等）的收集、加工、储存、分析、解释的一门学科。 2.你认

19多老了？1960s已有建立数据库、序列分析、 开发算法,当时叫分子进化如果考虑生物数学,19世纪已经流行 首次提出Bioinformatics的说法荷兰理论生物学家1980年代初Ben Hesper和Paulien Hogeweg马来西

Drosophila melanogaster 果蝇Arabidopsis thaliana 拟南芥基因组测序计划 海量DNA序列数据DNA序列是生命的真谛，这个世界上发生的一 切事情都与这一序列息息相关。 人类基因组计划（HGP）结果：

蛋白质折叠蛋白质的结构在多肽链之间或一条肽链的肽段之间靠氢键联结 而成的锯齿状片层结构蛋白质转角蛋白质的结构在球状的蛋白质分子中，肽链经常出现的回折， 由4个连续的氨基酸组成。（大多Phe, Gly组成）蛋白质蛋白质的结构 蛋白质的三级结构

21(1)遗传信息的载体——DNA遗传信息的载体主要是DNA2020/11/21控制生物体性状的基因是一 系列DNA片段生物体生长发育的本质就是遗 传信息的传递和表达22DNA通过自我复制，在生物体的繁衍过 程中传递遗传信息基因通过转录和翻

ห้องสมุดไป่ตู้Drug DiscoveryMetabolomics Genomics生物信息学定义Bio-informatics bio (biology) + informatics利用计算机存储、检索、分析、预测生物分子

蛋白质数据来自UniProt数据库 比对软件：AAT-nap和Genewise（二）构建基因预测训练集基因预测训练集的构建对于从头开始基因预测及 EVM 中权重的训练都是至关重要的。（三）从头开始的基因预测从头开始基因预测软件——BGF、G

生物分子一级结构 二级结构 三级结构一级结构二级结构 三级结构四级结构DNA基因的DNA序列对 应 遗 传前体RNA mRNA关系密码蛋白质序列多肽链三个重要的信息(1)遗传信息的载体——DNADNA通过自我复制，在生物体的繁衍过程中传递遗

基因通过转录和翻译，使遗传信息在生物个体中得以表达，并使后代表现出 与亲代相似的生物性状。复制DNA转录RNA翻译蛋白 质(2)蛋白质的结构决定其功能l 蛋白质功能取决于蛋白质的空间结构l 蛋白质结构决定于蛋白质的序列（这是目前基本公认的假

第一章 DNA、RNA和 蛋白质序列信息资源DNA、RNA And Protein Sequence Information Resources中国医科大学 赵雨杰人民卫生出版社8

• 在NCBI（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/） NCBI（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/）的主页上提供了进入GenBank的路

生物信息学（系统发生） http://www.lmbe.seu.ed /chenyuan/xsun/bio infomatics/web/Index.h tml 第一章生物信息学引论 ========= 选择章节 ========== 1.

核酸三维结构数据库：• 核苷酸三维结构数据库（NDB）； • 普纳大学核酸结构数据库（BNASDB）等。基因表达数据库：• 基因表达库（GEO）； • 斯坦福微阵列数据库（SMD）

的诞生2021/3/96信息科学概念（广义）生生物体系和过程中信息命的存贮、传递和表达科学中的信细胞、组织、器官的生理、病理 、药理过程的中各种生物信息息 科 学2021/3/97概念（狭义）生物分子信息的获取、存贮、分析和利用分子生物信息

起源于20世纪70-80年代。这一阶段的主要成 就包括核酸和蛋白质序列的初步分析、生物学数据 库的建立以及检索工具的开发。例如Dayhoff的替 换矩阵、Neelleman和Wunsch的序列比对及GenBank （由美国国立生物技术信息中

geneENCODE试点研究计划（ENCODE pilot project）Non-coding DNA 约60% 约40% 分散重复序列假基因基因片段内含子串联重复序列/ 成簇重复序列估计10万→最初公布3.5万→目前研究确定2.45万2

4基因数据的 快速增长5为什么这么快6Sanger, UK已完成测序的基因组(EBI)病毒(virus) 类病毒(viroid) 1639 46 包括多种流感病毒, HIV, SA