生物化学实验技术

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设计要求:
(1)蛋白质样品的选择: 乳制品、植物蛋白、动物蛋白等 (2)处理方法的选择:根据所要制备和测定的蛋白质样品
的来源、种类和特性选择处理的方法——可选择粉碎、匀 浆、超声破壁等方法 (3)制备方法的选择:根据要测定的蛋白质组分选择制备 的方法——要求必需选择一种蛋白质样品的制备方法,如 采用特定溶剂提取后测定特定溶解性的蛋白质、分离纯化 后测定特定组分的蛋白质或除去脂肪等杂质制备粗蛋白测 定蛋白质等等。
1.安装膜具
装封胶条,注意封胶条平面朝 下,不能有裂口
盖上凹玻璃
将凹玻璃冲外装进槽里
将楔子插进,将底部插紧
2. 配制凝胶溶液
胶的配制(平行电泳两块胶板)
胶母液: 8.4ml 配胶缓冲液:13ml 蒸馏水:4ml 10% TEMD: 0.2ml,混匀 10%AP: 0.2ml ,混匀
示意图(交换树脂表面)
示意图(离子交换过程)
电离基团(磺酸根) 可交换离子(钠离 子) 交换离子 阳离子交换树脂:可供交换的是阳离子;
阴离子交换树脂:可供交换的是阴离子;
不交换离子
示意图
B物质
水分子
A物质
三、操作步骤
1、装柱
¾ 装柱是最关键的一步。 ¾ 重力沉降法装柱 ¾ 陆续不断地添加糊状物,使其形成的胶粒床面
-
-
-
-
1
三氯化铁浓盐酸溶液/mL
2
2
2
2
2
苔黑酚乙醇溶液/mL
0.2
0.2
0.2
0.2
0.2
放沸水浴中10-20min后 的现象
由于核酸和脱氧核糖核酸有特殊的颜 色反应,经显色后所呈现的颜色深浅在一 定范围内和样品中所含的核糖和脱氧核糖 的量成正比。因此可用定糖法来定性定量 测定核酸。
上述两种定糖的方法准确性较差,但 快速简便,能鉴别DNA和RNA,是鉴定核 酸、核苷酸的常用方法。
3 实验记录与实验报告
3.2 实验报告 实验报告的格式应为:
⑴ 实验目的; ⑵ 实验原理; ⑶ 仪器、材料和试剂; ⑷ 实验步骤; ⑸ 结果讨论(含数理据处); ⑹ 注意事项; (7)思考题 注意:实验结果的讨论要充分,尽可能多查阅一些有 关的文献和教科书,充分运用己学过的知识和生物化 学原理,进行深入的探讨,勇于提出自己独到的分析 和见解,并欢迎对实验提出改进意见。
蓝色物质
注意:DNA、蛋白质和黏多糖等物质对测定有干 扰作用。
按教材表1加入各种试剂,反应后观察并记录结果。
表1 二苯胺反应加入试剂
管号
1
2
3
4
5
蒸馏水/mL
1
-
-
-
-
DNA溶液/mL
-
1
-
-
-
RNA溶液/mL
-
-
1
-
-
提取物一/mL
-
-
-
1
-
提取物二/mL
-
-
-
-
1
二苯胺试剂/mL
2
2
2
2
2
放沸水浴中10min 后的现象
思考题:
1.比较几种方法的优点和缺点? 2.为什么标准蛋白质必须用凯氏定氮法测定度? 3.若样品中含有核酸杂质,紫外法测定时应如何
排除干扰? 4. 说明你所选择的蛋白质样品、制备方法和蛋白
质含量测定方法的依据。
3. 灌胶,加到顶部,来回倾斜去气泡
插入梳子
凝胶
胶凝后用夹子将玻璃夹出
用夹子夹紧玻璃将封胶条轻轻撕掉
旋转180度,凹玻璃向里 将玻璃放进槽内 加缓冲液
4. 样品制备:
将0.5ml 样品
液,0.25ml 10% SDS 和0.25ml 1%巯基乙醇 于小试管中,置100℃ 水浴中煮沸3分钟后, 取出冷却,然后,加 入0.25ml 上样缓冲液 (0.05%溴酚兰+ 40% 蔗糖溶液),混合。 取出混合样品40微升 加入样品槽,每个样 品重复两个。
20mL95%乙醇+海砂
菜花花冠
匀浆
20g
抽滤
20mL丙酮
滤渣
搅拌均匀 抽滤
滤渣
搅拌
抽滤
20mL95%乙醇
抽滤
滤渣
提取 物二
滤液
20mL高氯酸
滤渣
冰盐浴
20mL丙酮
搅拌5min 抽滤
滤渣
20mL丙酮
重复 一次
40mL10% 氯化钠
滤渣
搅拌5min 抽滤至干
滤渣
抽滤
沸水浴
滤液
抽滤 20mL高氯酸
15min
根据以上选择制定实验方案,并确定 具体的实验参数,具体实验步骤和参数的 选择可参考实验教材。
第二部分:样品中蛋白质含量的测定
设计要求: (1)根据所制备的样品中蛋白质的性质选择合适的
测定方法,如粗制品的粗蛋白质含量和蛋白质含 量一般可选择凯氏定氮法,纯化后没有干扰的蛋 白质样品可选择紫外分光光度法等其它方法,标 准蛋白质为牛血清白蛋白。 (2)参考附录中提供的可选用的方法,制定测定的 具体实验方案。
一、实验目的
¾ 学习和掌握从植物组织中分离核酸的原理和方法 ¾ 掌握定糖法测定核酸的原理及操作方法
二、原理
核酸的提取:三氯乙酸或高氯酸除酸溶小分子 有机溶剂去脂类 浓盐溶液(10%NaCl)提DNA 0.5M高氯酸提RNA
RNA核糖的测定:苔黑酚法
DNA脱氧核糖的测定:二苯胺法
三、操作步骤
1、核酸的分离
¾ 阳离子交换树脂:可供交换的是阳离子; ¾ 阴离子交换树脂:可供交换的是阴离子;
z 常用的惰性基质:人工合成树脂(单体:苯乙烯、交联 剂:二乙烯苯)
z 阳离子交换剂:磺酸甲基、羧甲基、磷酸基 z 阴离子交换剂:二乙基胺乙基、三乙基胺乙基 z 可交换离子:阳离子:Na+、H+
阴离子:Cl-、OH-
生物化学实验技术
Biochemical Experiment
绪论
1 实验目的
z 掌握蛋白质、酶、核酸、糖等重要物质的分 离、纯化和测定技术的原理及方法;
z 掌握生物化学的基本知识、基本理论及基本实 验技能;
z 培养分析和解决问题能力以及严谨细致的科学 作风、创新能力等综合素质。
2 通过生物化学实验应该做到
实验目的: 通过学习的生物化学知识和实验技术,学会
自行设计一种含蛋白质的样品处理方法、蛋白质 制备方法和测定方法。
基本要求:
掌握常用的蛋白质制备和定量测定的方 法及其原理,能够根据样品的种类不同设计 蛋白质制备的方法,并根据蛋白质性质不同 设计选用相应的定量测定方法。
培养目标:
通过实验方案设计及方法选择,使学生 了解不同来源蛋白质制备的基本原理与方 法;熟悉几种蛋白质含量测定方法的基本原 理及应用条件;学会设计并实施一种蛋白质 的制备及测定实验方案;通过实验独立完成 试剂的配制、蛋白质的制备、标准曲线的制 作、蛋白质含量测定、结果计算、方案实施 总结全过程。并能够熟练使用离心机、分光 光度计等进行蛋白质制备和紫外、可见分光 光度测定。
上有胶粒连续均匀地沉降,直至装柱物完全沉 降至适当的柱床体积为止。 ¾ 柱的表面始终要保持着一层溶剂(一般l~3cm柱 高)柱的任何一部分绝对不能“流干”。
1、装柱
z 层析柱的形状,一般直径 与高度的比为l:15为宜。
z 柱形必须根据层析介质和 分离目的而定。待分离物 质的性质相近,柱越细长, 则分离效果越好,但流速 较慢。在样品组分并不复 杂的情况下,采用“矮胖 柱”。
RNA+浓盐酸+
OH
OH FeCl 3
绿色化合物
注意:DNA、蛋白质和黏多糖等物质对测定有干扰作用。
按教材表2加入各种试剂,反应后观察并记录结 果。
表2 苔黑酚反应加入试剂
管号
1
2
3
4
5
蒸馏水/mL
1
-
-
-
-
DNA溶液/mL
-
1
-
-
-
RNA溶液/mL
-
-
1
-
-
提取物一/mL
-
-
-
1
-
提取物二/mL
5. 加 样
6. 电泳
接通电源,电流 恒定为80mA,待溴酚 兰指示剂移至离下端 0.5cm(约3小时), 切断电源,拔去插 头,倒出电极缓冲液 于大烧杯中(如此缓 冲液欲重用时,应把 正负电极液分别贮 存)。
7. 剥胶
8.染色: 考马斯亮蓝染色,详见教材
9.脱色
10. 凝胶(脱色之后)结果分析
z 学习设计一个实验的基本思路,掌握各个实 验的基本原理,学会严密地组织自己的实 验,合理地安排实验步骤和时间。
z 训练实验的动手能力,学会熟练地使用各种 生物化学实验仪器。
z 学会准确翔实地记录实验现象和数据的技 能,提高实验报告的写作能力,能够整齐清 洁地进行所有的实验。
z 掌握生物化学的各种基本实验方法和实验技 术,尤其是各种电泳技术和层析枝术,为今 后参加科研工作打下坚实的基础。
3、加样
z 上样量:0.3-0.5mL
注意:
¾加样的同时开始收集 ¾加样时且勿搅动树脂床面
z 0.5mL缓冲液冲洗加样处2次
4、洗脱与收集
z 尽量维持衡定柱压
z 每2分钟收集一管,共收集25管
5、氨基酸的鉴定
每个收集管

沸水浴15min
1mL水合茚三酮
比色测定
绘制洗脱曲线
实验二 SDS-PAGE分离蛋白质
根据现象分析提取物一和提取物二中主要 含有什么物质?为什么?
思考题:
1.核酸分离时为什么要除去小分子物质和脂类物 质?本实验是怎样除掉的?
2.运用本实验方法是否可以制备得到高纯度核酸? 3.快速鉴别RNA和DNA的方法是什么?
实验四 设计性实验——蛋白质的制 备及其含量测定
实验类型: 给定选题的综合设计性实验
(1) 计算迁移率(Rm值):计算公式见教材。 (2) 绘制标准曲线:以标准蛋白亚基的Rm值为横坐标,以相
应分子量的对数值为纵坐标,即可绘制出测定蛋白质分 子量的标准的线图。 (3) 计算未知蛋白亚基样品的分子量:根据未知样品样的Rm 值,从上述标准曲线图中即可查出其分子量。
实验三 菜花中核酸的分离与鉴定
70℃水浴20min
提取物一
2、RNA和DNA的定性鉴定
(1)二苯胺反应
测定脱氧核糖的常用方法是二苯胺法。含有脱氧
核糖的DNA在酸性条件下和二苯胺在沸水浴中共热
后,产生蓝色。这是因为DNA嘌呤核苷酸上的脱氧核
糖遇酸生成ω-羟基-6-酮基戊醛,再与二苯胺作用产
生Байду номын сангаас色物质。
DNA+少量浓硫酸或冰乙酸+ NH
4 实验成绩评分方法
实验预习情况(10%) 实验操作情况(20%) 实验报告情况(30%) 实验考试成绩(40%)
实验一 离子交换层析法分离氨基酸
一、实验目的 学习用阳离子交换树脂分离氨基酸 的操作方法和基本原理
二、原理 氨基酸的pI不同,在同一pH下所带电荷的
数量和性质不同,与树脂的亲和力就有差异, 因此可根据亲和力从小到大的顺序依次被洗脱 下来。
一、实验目的 掌握SDS-PAGE的工作原理和操作方法
二、原理 不同蛋白质具有不同的分子量,并在一定
的pH溶液中带有不同的电荷。但经过SDS处理 后的蛋白质,分子表面完全被负电荷所覆盖, 因此在电泳时,电泳迁移率近取决于蛋白质的 分子量大小而与其所带电荷的性质无关。 ¾ 分子筛效应 ¾ 浓缩效应
三、操作步骤
可选择的蛋白质含量测定方法有:
(一)紫外分光光度法 (二)Bradford法 (三)微量凯氏定氮法 (四)双缩脲法等 (五)Folin-酚法
实验报告:
要求给出实验目的、设计方案及设计原 理、实验技术路线和参数选择的依据、实验 参考文献、实验方法和步骤、实验结果和分 析、总结。
第一部分:蛋白质样品的选择、处理及制备
(2)苔黑酚反应
测定核糖的常用方法是苔黑酚法(3,5—二羟基甲
苯,即Orcinol反应)。当含有核糖的RNA与浓盐酸及3, 5—二羟基甲苯在沸水水浴中加热10~20min后,有绿色物 产生,这是因为RNA脱嘌呤后的核糖与酸作用生成糠醛, 后者再与3,5—二羟基甲苯作用生成绿色物质。
CH3
100 o C
2、平衡
z 层析柱正式使用前,必须平衡至所需的pH和离子强 度,一般用起始缓冲液在恒定压力下走柱,其洗脱体 积相当于4-6倍床体积,使交换剂充分平衡,柱床稳 定。装好的柱必须均匀,无纹路,不含气泡,柱顶交 换剂沉积表面十分平坦。
z 本实验平衡体积:60-80mL
z 调节流速:0.5mL/min或8-12滴/min
3 实验记录与实验报告
3.1 实验记录 实验前写好实验预习报告(钢笔和园珠笔)。 实验中应及时准确地记录(专用纸,事先在记录纸上
设计好各种记录格式和表格)所观察到的现象和测 量的数据。 实验记录要注意有效数字,如吸光度值应为 “0.050”,而不能记成“0.05”。每个结果都要尽可能 重复观测二次以上,即使观测的数据相同或偏差很 大,也都应如实记录,不得涂改。 实验中要详细记录实验条件,如使用的仪器型号、 编号、生产厂等;生物材料的来源、试剂的规格、 试剂的浓度等。