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基因克隆的一般流程
基因克隆的一般流程
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DNA量:
摩尔数之比 载体:目的 DNA = 1 : ( 1~3 ) 载体摩尔数 目标DNA摩尔数 目标基因片段碱基数×载体重量 目标基因片段重量×载体碱基数
载体和目标基因的连接反应
如未定量可以按回收效率75%计算DNA浓度,按载体与 目的基因摩尔数比1:3进行连接。
连接反应在灭菌的 0.5ml离心管中进行。 15 l 体积反
平端连接图示
匹配粘端连接图示
不匹配粘端连接图示
连接反应的建立
连接反应的温度:
粘性末端,按A-T,G-C含量计算,±5℃。 如 Pst I(CTGCA↓G,12℃ ),EcoRI(G↓AATTC,8℃)。 平末端,如EcoRⅤ(GAT↓ATC),可在室温进行,不超过30℃, 酶的用量要比粘性末端加大10-100倍 。
重组子转入受体细胞
体外重组的DNA引入受体细胞
感受态:受体细胞处于易于接受外源 DNA 的状态 原理:(1)遗传物质的传递 (2)受体菌的选择与改造
重组质粒的酶切鉴定
重组子的鉴定
插入片段长度大小鉴定 质粒抽提、酶切;PCR 插入片段方向性鉴定 可以选择基因内部切点进行不对称酶切 DNA序列测定
质粒 M 酶切反应 M 酶切反应
pEGFP
pT-NGF
酶切产物凝胶回收操作步骤
(Gel Extraction Kit)
仔细切下含DNA的凝胶,置一称重的1.5ml离心管中。称重。 按300lS1溶液/100mg凝胶加入的比例加入S1溶液,置50℃水浴10分钟, 使凝胶完全溶化,每2分钟颠倒混匀一次。 将溶化后的凝胶溶液移入吸附柱,置收集管中,9000g×30秒,倒掉收集 管中的液体,再将吸附柱放入同一收集管中。 在吸附柱中加入500l W1溶液,9000g×15秒,倒掉收集管中的液体,再 将吸附柱放入同一收集管中。重复一次洗柱。 将吸附柱放入同一收集管中。9000g×1分钟。 将吸附柱放入一新1.5ml离心管中,在吸附膜中央加入30lddH2O,静置1 分钟,9000g×1分钟。备用。
应体系中: 加ddH2O使终体积为 15 l Liner vector 50-100 ng Target gene fragment 15- 30 ng 10×Ligase Buffer (已含有ATP) 1.5 l T4 DNA Ligase 1.O l 轻轻混匀,稍加离心, 14-16℃或4℃,O/N 。
重组子的筛选
Fra Baidu bibliotek
耐药性基因
外源质粒赋予宿主抗生素抗性 蓝白斑筛选(互补现象) lacZ+ plasmid 和 M15△ cell strain
关于连接酶
定义:ATP存在下,在3’OH和5’ P之间形成磷酸二酯
键。 特性:连接粘端的效率远高于平端。 1. 首选不匹配粘端 策略: 2. 次选匹配粘端,载体脱磷 3. 平端连接,延长时间,提高酶量
实验一:pEGFP-NGF质粒载体的构建
NGF 基因的克隆(T-A克隆)
a GAGCTC aagatgctgtgcctcaagccagt at GGGCCC gtctagatcc agagtgtctg
NGF-sense: NGF-antisense:
6
5
pEGFP 荧光质粒表达载体
质粒DNA的酶切反应结果
易从宿主细胞中分离纯化出来, 便于重组操作。
有筛选标志,当其进入宿主细胞、或携带着外源序列进入宿主细胞都 能容易被辨认和分离出来。便于克隆操作。
常用的载体有质粒、噬菌体和病毒等
重组 DNA 技术的一般流程
目的DNA的获得 目的DNA与载体的连接 重组子导入受体细胞 重组子的筛选和鉴定
荧光质粒转染观察
基因克隆的一般流程
PCR RT-PCR 载体 连接 转化 准备感受态细胞 基因的获得
重组子筛选
下游工作
载体的选择
基因工程载体一般要求:
能在宿主细胞中复制繁殖,有较高的自主复制能力。 易进入宿主细胞,进入效率越高越好。 合适的多克隆位点(MCS)可接受外源片段,且不影响其进入宿主细 胞和在细胞中的复制。
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