卫生部全国细菌耐药监测网上传数据标准
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全国细菌耐药监测网信息系统
数据上报标准V5.2
(此文档最后修改于2014年4月14日)
全国细菌耐药监测网通过“全国细菌耐药监测网信息系统”收集所有成员单位的耐药监测数据,系统具备完善的数据筛选和容错处理功能,系统所支持上传的数据文件格式为WHONET 5.6软件所导出的通用数据文件格式,但后缀必需为“.dbf”。除此以外,系统还支持Excel表格,包括Excel2003以下版本生成的(*.xls)以及Excel2007/2010所生成的*.xlsx。
一、科室代码设置
监测网成员单位首次登录时须先使用【本院科室管理】功能,登记注册医院临床科室并将其映射至系统所要求的标准科室分类上,该映射关系可随着本院的科室变化随时进行调整(增加、删除、修改),调整之后不影响曾经上传过的文件,仅影响在调整时间点后上传的数据。而各医院临床科室对应上报数据文件中的WARD字段保存的值,可以是本院临床科室名称也可以是本院的临床科室代码,取决于各院在WHONET中是如何管理的,或者是如何从LIS系统导出的。完成医院科室设置后,在上传本院数据时,系统会自动将已经设置好的本院科室信息与系统标准的科室分类进行映射,并将映射结果直接写入DEPARTMENT字段,不影响WARD字段中上传的原始值,也就是说,DEPARTMENT字段实际上可以不填写,甚至是整列都不存在。其实,更好的做法是在上报的数据文件中直接将DEPARTMENT字段设置成系统内置的标准科室代码(3位字符)。
二、数据文件各字段要求
1、来源ORIGIN
非必填字段,最长1个字符。若填写,则其必须为“h”,若不填写,数据上传后系统会自动补充,若填写值不为“h”,系统将自动替换成“h”。
2、国家COUNTRY_A
非必填字段,最长3个字符。若填写,则其必须为“CHN”,若未填写,数据上传后系统会自动补充。
3、医院INSTITUT
非必填字段,为卫生部统一分配的标准代码,标准6字符,前两位为国家标准省级代码(如北京为11,福建为35等),后4位为各省编码(从0001开始),例如福建省立医院为350001,若未填写,数据上传后系统自动补充已注册的医院标准代码,若填写则必须与本院的代码一致,否则系统会自动替换为正确代码,在数据上传时此字段不建议填值。
4、实验室LABORATORY
非必填字段,最长3个字符。系统不再将此作为医院标识,无具体格式要求,只要不超长,系统均可接受。
5、病历号PATIENT_ID
对于门诊病历不要求必须填写,对于住院病历要求必须填写,并且填写总量至少占住院病历数据量的95%,否则会导致整个数据文件系统无法接收,该字段最长16个字符。
6、姓氏LAST_NAME、名字FIRST_NAME、姓名FULL_NAME
系统原则上要求FULL_NAME必填,如果未填写系统可根据
LAST_NAME和FIRST_NAME自动推算FULL_NAME的值。因此请根据本院实际情况填写如上三个字段中的任意一个字段即可,如果考虑到本院病人隐私问题,可将病人姓名加密,只要不超长,系统依然可以正常接收。以上三个字段的长度要求分别为:LAST_NAME(30字)、FIRST_NAME(20字)、FULL_NAME(50字)。
7、性别SEX
此字段要求必填,最长1个字,WHONET要求只能填写“f”或者“m”,系统提供了相关的容错处理机制,允许填写“男”和“女”,系统会自动将“男”替换成“m”,将“女”替换成“f”。
8、年龄字段AGE
此字段要求必填,最长3个字符。
(1)不带任何后缀的1~3位整数或者2位数字+"y"后缀,代表年龄是按岁计算。
(2)2位数字+ "d" 即代表年龄按天计算。
(3)2位数字+ "w" 即代表年龄按周计算。
(4)2位数字+ "m" 即代表年龄按月计算。
(5)空值或其它字符,系统会认为是非法值,需补充修改后才能上报。
9、年龄类别PAT_TYPE
非必填字段,系统会根据年龄AGE自动生成,即使是数据中已经填写了该值系统也会强制替换,因此,该字段可以不填,若要填写,长度必须为3位字符,且要符合系统的计算规则,具体计算规则如下:
1)当AGE后缀为“d”代表“天”时:
A.<=28d,生成“new”代表“新生儿”;
B.>28d,生成“ped”代表“儿童”;
2)当AGE后缀为“w”代表“周”时:
A.<=4w,生成“new”代表“新生儿”;
B.>4w,生成“ped”代表“儿童”;
3)当AGE后缀为“m”代表“月”时:
A.0m,系统无法识别,需修正后才能上报;
A.>=1m,生成“ped”代表“儿童”;
4)当AGE为纯数字,代表“岁”时:
B.0或者0y,系统无法识别,需修正后才能上报;
C.>=1或者>=1y并且<=14或者<=14y,生成“ped”代表“儿童”;
D.>=15或者>=15y并且<=65或者<=65y,生成“adu”代表“成人”;
E.>65或者>65y,生成“ger”代表“老年”。
10、科室(送检科室)WARD
为必填项,最大长度为15字,中英文不限,此字段所填写的值应该对应为本院科室维护模块中所录入的信息,可以是本院科室代码也可以是本院科室名称,而填写的值不在本院科室列表中时,系统会认为该值为非法值,需要修改之后再上传。
11、科室类别WARD_TYPE
为非必填项,最大长度为3个字。如果不填写,系统不进行校验,如果填写,则必须与WHONET内置的代码要求一致,见附表1。
12、专业类别DEPARTMENT
为100%必填项,最大长度为3个英文字符,此字段所填写的值,必须为系统所规定的标准专业类别代码,见附表2。未在该附表中的值为非法值,无法通过系统校验。系统提供了容错处理,可直接通过WARD字段自动推算此列的值。因此,此字段其实可以不填写。
13、标本类型英文代码SPEC_TYPE
本字段为必填项,最低校验通过率为100%,要求 100% 必填,不能为空白,否则将导致整个文件校验失败,系统拒绝接收!系统只接受WHONET标准【标本字典】中的英文代码,见附表3。
意外情况:如果本字段所填写值,与从【SPEC_CODE】字段所推算出来的值不匹配,则同样会导致整个文件校验失败,并且被系统拒绝接收,必须改正之后才可以重新上传,且不仅仅是影响单列通过率的问题!
例如:痰标本的英文代码为“sp”,数字代码应该对应为“3”,如果填写了其它数字代码,会导致整个文件校验失败,并且被系统拒绝接收,必须改正之后才可以重新上传!
14、数字代码SPEC_CODE
本字段为必填项,最低校验通过率为100%,要求 100% 必填,不能空,否则将导致整个文件校验失败,并且被系统拒绝接收!
校验规则如下:
系统只接WHONET标准【标本字典】中的数字代码,具体请参照或者下载《全国细菌耐药监测网信息系统数据上报标准》文档中的《附表3:SPEC_TYPE与SPEC_CODE对照字典》中的【SPEC_CODE】列。